当前蛋白身份：P06104
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AYZ CRYSTAL STRUCTURE OF THE SACCHAROMYCES CEREVISIAE UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME RAD6 (UBC2) AT 2.6A RESOLUTION 提交 1997-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–172（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；pH 5.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.246 |
| 1AYZ CRYSTAL STRUCTURE OF THE SACCHAROMYCES CEREVISIAE UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME RAD6 (UBC2) AT 2.6A RESOLUTION 提交 1997-11-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–172（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；pH 5.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.246 |
| 1AYZ CRYSTAL STRUCTURE OF THE SACCHAROMYCES CEREVISIAE UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME RAD6 (UBC2) AT 2.6A RESOLUTION 提交 1997-11-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–172（172 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；pH 5.0
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.246 |
| 4R62 Structure of Rad6~Ub 提交 2014-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–172（172 aa）
片段：Rad6
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突变：C88K | ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；293 K；24% PEG 300, 50 mM sodium acetate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.28 Å R-free 0.265 |
| 7MEX Structure of yeast Ubr1 in complex with Ubc2 and N-degron 提交 2021-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
3–152（150 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.35 Å |
| 7MEY Structure of yeast Ubr1 in complex with Ubc2 and monoubiquitinated N-degron 提交 2021-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–172（172 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 Z3V 2-(ethylamino)ethane-1-thiol × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
| 7UV8 Rad6-Bre1 Complex 提交 2022-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–150（150 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；286.15 K；0.05 to 0.1 M MMT buffer and 15-25% PEG400
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.280 |
| 7UVC Rad6(P43L)-Bre1 Complex 提交 2022-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–150（150 aa）
|
突变：P43L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；286 K；0.05 to 0.1 M MMT buffer and 15-25% PEG400
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分辨率 3.05 Å R-free 0.279 |
| 8IEG Bre1(mRBD-RING)/Rad6-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric（13） 与全部聚合物一致 |
链 R
3–150（148 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.44 Å |