当前蛋白身份：P06684
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4P3A Crystal structure of the mouse C5a anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
679–755（77 aa）
片段：UNP residues 679-755
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.7；277 K；0.1 M Na tri-citrate pH 3.7, 2.6 M Na formate, 0.5% (w/v) polyvinylpyrrolidone K15
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.174 |
| 4P3A Crystal structure of the mouse C5a anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
679–755（77 aa）
片段：UNP residues 679-755
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.7；277 K；0.1 M Na tri-citrate pH 3.7, 2.6 M Na formate, 0.5% (w/v) polyvinylpyrrolidone K15
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.174 |
| 4P3A Crystal structure of the mouse C5a anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
679–755（77 aa）
片段：UNP residues 679-755
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.7；277 K；0.1 M Na tri-citrate pH 3.7, 2.6 M Na formate, 0.5% (w/v) polyvinylpyrrolidone K15
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.174 |
| 4P3A Crystal structure of the mouse C5a anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
679–755（77 aa）
片段：UNP residues 679-755
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.7；277 K；0.1 M Na tri-citrate pH 3.7, 2.6 M Na formate, 0.5% (w/v) polyvinylpyrrolidone K15
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.174 |
| 4P3A Crystal structure of the mouse C5a anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
679–755（77 aa）
片段：UNP residues 679-755
链 B
679–755（77 aa）
片段：UNP residues 679-755
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.7；277 K；0.1 M Na tri-citrate pH 3.7, 2.6 M Na formate, 0.5% (w/v) polyvinylpyrrolidone K15
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.174 |
| 4P3A Crystal structure of the mouse C5a anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
679–755（77 aa）
片段：UNP residues 679-755
链 D
679–755（77 aa）
片段：UNP residues 679-755
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.7；277 K；0.1 M Na tri-citrate pH 3.7, 2.6 M Na formate, 0.5% (w/v) polyvinylpyrrolidone K15
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.174 |
| 4P3B Crystal structure of the mouse C5a-desArg anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
679–754（76 aa）
片段：UNP residues 679-754
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.3；277 K；0.1 M Na acetate pH 4.3, 2.4 M Na Formate, 3 % D-glucose monohydrate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 4P3B Crystal structure of the mouse C5a-desArg anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
679–754（76 aa）
片段：UNP residues 679-754
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.3；277 K；0.1 M Na acetate pH 4.3, 2.4 M Na Formate, 3 % D-glucose monohydrate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 4P3B Crystal structure of the mouse C5a-desArg anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
679–754（76 aa）
片段：UNP residues 679-754
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.3；277 K；0.1 M Na acetate pH 4.3, 2.4 M Na Formate, 3 % D-glucose monohydrate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 4P3B Crystal structure of the mouse C5a-desArg anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
679–754（76 aa）
片段：UNP residues 679-754
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.3；277 K；0.1 M Na acetate pH 4.3, 2.4 M Na Formate, 3 % D-glucose monohydrate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 4P3B Crystal structure of the mouse C5a-desArg anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
679–754（76 aa）
片段：UNP residues 679-754
链 C
679–754（76 aa）
片段：UNP residues 679-754
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.3；277 K；0.1 M Na acetate pH 4.3, 2.4 M Na Formate, 3 % D-glucose monohydrate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 4P3B Crystal structure of the mouse C5a-desArg anaphylatoxin 提交 2014-03-06 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
679–754（76 aa）
片段：UNP residues 679-754
链 D
679–754（76 aa）
片段：UNP residues 679-754
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.3；277 K；0.1 M Na acetate pH 4.3, 2.4 M Na Formate, 3 % D-glucose monohydrate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 4WB2 Crystal structure of the mirror-image L-RNA/L-DNA aptamer NOX-D20 in complex with mouse C5a complement anaphylatoxin 提交 2014-09-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
679–755（77 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；0.2 M NaCl, 0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 8% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.193 |
| 4WB2 Crystal structure of the mirror-image L-RNA/L-DNA aptamer NOX-D20 in complex with mouse C5a complement anaphylatoxin 提交 2014-09-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
679–755（77 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；0.2 M NaCl, 0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 8% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.193 |
| 4WB2 Crystal structure of the mirror-image L-RNA/L-DNA aptamer NOX-D20 in complex with mouse C5a complement anaphylatoxin 提交 2014-09-02 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 C
679–755（77 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；0.2 M NaCl, 0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 8% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.193 |
| 4WB3 Crystal structure of the mirror-image L-RNA/L-DNA aptamer NOX-D20 in complex with mouse C5a-desArg complement anaphylatoxin 提交 2014-09-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
679–754（76 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Na acetate pH 4.0, 15% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.199 |
| 4WB3 Crystal structure of the mirror-image L-RNA/L-DNA aptamer NOX-D20 in complex with mouse C5a-desArg complement anaphylatoxin 提交 2014-09-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
679–754（76 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Na acetate pH 4.0, 15% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.199 |
| 4WB3 Crystal structure of the mirror-image L-RNA/L-DNA aptamer NOX-D20 in complex with mouse C5a-desArg complement anaphylatoxin 提交 2014-09-02 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 C
679–754（76 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Na acetate pH 4.0, 15% (w/v) PEG 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.199 |
| 8JZP Structure of mouse C5a-human C5aR1-Go complex 提交 2023-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
679–755（77 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.45 Å |
| 9KWG Structure of mouse C5a bound mouse C5aR1 in complex with Go 提交 2024-12-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
679–755（77 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 9KWX Structure of mouse C5a-desArg bound mouse C5aR1 in complex with Go 提交 2024-12-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
679–754（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |