当前蛋白身份:P07093 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4DY0 Crystal structure of native protease nexin-1 with heparin 提交 2012-02-28 Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 20–398(379 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;295 K;25mM NaAc, 12% PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.35 Å R-free 0.226
4DY0 Crystal structure of native protease nexin-1 with heparin 提交 2012-02-28 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 20–398(379 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;295 K;25mM NaAc, 12% PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.35 Å R-free 0.226
4DY0 Crystal structure of native protease nexin-1 with heparin 提交 2012-02-28 Assembly 3 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 20–398(379 aa)
链 B 20–398(379 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;295 K;25mM NaAc, 12% PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.35 Å R-free 0.226
4DY0 Crystal structure of native protease nexin-1 with heparin 提交 2012-02-28 Assembly 4 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 20–398(379 aa)
链 B 20–398(379 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;295 K;25mM NaAc, 12% PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.35 Å R-free 0.226
4DY7 Crystal structures of protease nexin-1 in complex with S195A thrombin 提交 2012-02-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 20–398(379 aa)
未记录 ACT ACETATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.4;295 K;0.14M calcium acetate, 13% PEG3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.268
4DY7 Crystal structures of protease nexin-1 in complex with S195A thrombin 提交 2012-02-28 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 20–398(379 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.4;295 K;0.14M calcium acetate, 13% PEG3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.268