当前蛋白身份:P07093
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4DY0 Crystal structure of native protease nexin-1 with heparin 提交 2012-02-28 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
20–398(379 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;295 K;25mM NaAc, 12% PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.226 |
| 4DY0 Crystal structure of native protease nexin-1 with heparin 提交 2012-02-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
20–398(379 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;295 K;25mM NaAc, 12% PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.226 |
| 4DY0 Crystal structure of native protease nexin-1 with heparin 提交 2012-02-28 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
20–398(379 aa)
链 B
20–398(379 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;295 K;25mM NaAc, 12% PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.226 |
| 4DY0 Crystal structure of native protease nexin-1 with heparin 提交 2012-02-28 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
20–398(379 aa)
链 B
20–398(379 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;295 K;25mM NaAc, 12% PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
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分辨率 2.35 Å R-free 0.226 |
| 4DY7 Crystal structures of protease nexin-1 in complex with S195A thrombin 提交 2012-02-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
20–398(379 aa)
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未记录 | ACT ACETATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.4;295 K;0.14M calcium acetate, 13% PEG3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.268 |
| 4DY7 Crystal structures of protease nexin-1 in complex with S195A thrombin 提交 2012-02-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
20–398(379 aa)
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.4;295 K;0.14M calcium acetate, 13% PEG3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
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分辨率 2.80 Å R-free 0.268 |