当前蛋白身份:P07174
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1NGR DEATH DOMAIN OF P75 LOW AFFINITY NEUROTROPHIN RECEPTOR, RESIDUES 334-418, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-01-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
334–418(85 aa)
片段:DEATH DOMAIN, RESIDUES 281 - 425
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;301 K
|
分辨率未提供 |
| 1SG1 Crystal Structure of the Receptor-Ligand Complex between Nerve Growth Factor and the Common Neurotrophin Receptor p75 提交 2004-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 X
30–190(161 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.3;295 K;PEG 1000, isoproponal, sodium chloride, citrate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.269 |
| 2MIC NMR structure of p75 transmembrane domain in DPC micelles 提交 2013-12-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
245–284(40 aa)
片段:UNP residues 245-284
链 B
245–284(40 aa)
片段:UNP residues 245-284
|
突变:C36S (chain A), C136S (chain B) 突变:C36S (chain A), C136S (chain B) | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.9;318 K;压力 ambient
NMR样品组成
1.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p75-TM-wt, 95 mM [U-98% 2H] DPC, 20 mM sodium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MJO NMR structure of p75 transmembrane domain C257A mutant in DPC micelles 提交 2014-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
245–284(40 aa)
片段:UNP residues 245-284
链 B
245–284(40 aa)
片段:UNP residues 245-284
|
突变:C14A, C36S chain A, C114A, C136S chain B 突变:C14A, C36S chain A, C114A, C136S chain B | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.9;318 K;压力 ambient
NMR样品组成
1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p75-TM-C257A, 30 mM [U-98% 2H] DPC, 20 mM sodium phosphate, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3BUK Crystal Structure of the Neurotrophin-3 and p75NTR Symmetrical Complex 提交 2008-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
29–189(161 aa)
片段:ectodomain
链 D
29–189(161 aa)
片段:ectodomain
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 5;290 K;0.9M Lithium Sulfate, 0.05M Na Citrate, 0.7M Ammonium Sulfate, pH 5.0, EVAPORATION, temperature 290K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.288 |
| 3IJ2 Ligand-receptor structure 提交 2009-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 X
33–193(161 aa)
片段:UNP RESIDUES 30-190
链 Y
33–193(161 aa)
片段:UNP RESIDUES 30-190
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.75 Å R-free 0.274 |
| 4F42 Neurotrophin p75NTR intracellular domain 提交 2012-05-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
334–418(85 aa)
片段:death domain, UNP RESIDUES 334-418
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未记录 | MNB 5-MERCAPTO-2-NITRO-BENZOIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;0.1M Bis-Tris propane pH 7.0, 1.2M sodium citrate tribasic dehydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.38 Å R-free 0.260 |
| 4F44 Neurotrophin p75NTR intracellular domain 提交 2012-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
334–418(85 aa)
片段:death domain
链 B
334–418(85 aa)
片段:death domain
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未记录 | MNB 5-MERCAPTO-2-NITRO-BENZOIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;0.1M Bis-Tris propane, 1.4M sodium malonate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.280 |