当前蛋白身份：P07225
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1Z6C Solution structure of an EGF pair (EGF34) from vitamin K-dependent protein S 提交 2005-03-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
200–286（87 aa）
片段：EGF modules 3 and 4
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；309 K；离子强度（mmCIF原始值）low；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6；309 K；离子强度（mmCIF原始值）low；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6；309 K；离子强度（mmCIF原始值）low；压力 ambient
NMR样品组成
1mM EGF34 U-15N; pH 6.0; 0.1mM NaN3; 1mM DSS; 10mM CaCl2 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM EGF34 U-15N; phage Pf1 16 mg/ml; pH 6.0; 10mM CaCl2 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM EGF34; pH 6.0; 0.1 mM NaN3; 1mM Dss; 10 mM CaCl2 | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9L20 cryo-EM structure of Vitamin K-dependent gamma-carboxylase complexed with anisindione 提交 2024-12-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
24–49（26 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A1AT0 anisindione × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 3 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 BCT BICARBONATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |
| 9L54 cryo-EM structure of Vitamin K-dependent gamma-carboxylase complexed with Vitamin K1 2,3-epoxide 提交 2024-12-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
24–48（25 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A1EIL (1~{a}~{R},7~{a}~{S})-7~{a}-methyl-1~{a}-[(~{E},7~{R},11~{R})-3,7,11,15-tetramethylhexadec-2-enyl]naphtho[2,3-b]oxirene-2,7-dione × 1 CLR CHOLESTEROL × 1 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 3 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 BCT BICARBONATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.04 Å |