当前蛋白身份：P07271
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5O6B Structure of ScPif1 in complex with GGGTTTT and ADP-AlF4 提交 2017-06-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
237–780（544 aa）
链 B
237–780（544 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；0.1M Tris-HCl
0.2M Na2SO4
15% EPEG5000-MME
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.238 |
| 5O6D Structure of ScPif1 in complex with polydT and ATPgS 提交 2017-06-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
237–780（544 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；100mM NaAc-HAc pH5.5
240mM NaF
14%-16% PEG8000
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.322 |
| 5O6D Structure of ScPif1 in complex with polydT and ATPgS 提交 2017-06-06 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 B
237–780（544 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；100mM NaAc-HAc pH5.5
240mM NaF
14%-16% PEG8000
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.322 |
| 5O6E Structure of ScPif1 in complex with TTTGGGTT and ADP-AlF4 提交 2017-06-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
237–780（544 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；0.1M Tris-HCl
0.2M Na2SO4
15% PEG5000-MME
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.257 |
| 5O6E Structure of ScPif1 in complex with TTTGGGTT and ADP-AlF4 提交 2017-06-06 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 B
237–780（544 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；0.1M Tris-HCl
0.2M Na2SO4
15% PEG5000-MME
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.257 |
| 6E49 Pif1 peptide bound to PCNA trimer 提交 2018-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
815–831（17 aa）
片段：UNP residues 815-831
链 E
815–831（17 aa）
片段：UNP residues 815-831
链 F
815–831（17 aa）
片段：UNP residues 815-831
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；298 K；100 mM MIB (Qiagen), pH 9.0, 25% PEG1500
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分辨率 2.90 Å R-free 0.253 |