当前蛋白身份:P07998 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1DZA 3-D structure of a HP-RNase 提交 2000-02-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 28–156(129 aa)
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;pH 8.50
分辨率 1.65 Å R-free 0.236
1DZA 3-D structure of a HP-RNase 提交 2000-02-21 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 28–156(129 aa)
突变:YES 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;pH 8.50
分辨率 1.65 Å R-free 0.236
1E21 Ribonuclease 1 des1-7 Crystal Structure at 1.9A 提交 2000-05-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 29–156(128 aa)
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;7% PEG 8K, 0.1M TRIS-HCL PH 8.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.251
1H8X Domain-swapped Dimer of a Human Pancreatic Ribonuclease Variant 提交 2001-02-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 29–156(128 aa) 片段:RNASE 1, HP-RNASE
链 B 29–156(128 aa) 片段:RNASE 1, HP-RNASE
突变:YES 突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;pH 9.00
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
1Z7X X-ray structure of human ribonuclease inhibitor complexed with ribonuclease I 提交 2005-03-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 X 29–156(128 aa)
链 Z 29–156(128 aa)
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.2;293 K;10% MEPEG 2000, 0.020 M SODIUM CITRATE, 0.025 M DTT, 0.001 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, HANGING DROP, temperature 293K, pH 4.2
分辨率 1.95 Å R-free 0.236
2E0J Mutant Human Ribonuclease 1 (R31L, R32L) 提交 2006-10-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 29–156(128 aa)
突变:R31L, R32L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;293 K;26% PEG 4000, 0.2M ammpnium sulfate, 0.1M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.217
2E0J Mutant Human Ribonuclease 1 (R31L, R32L) 提交 2006-10-10 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 29–156(128 aa)
突变:R31L, R32L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;293 K;26% PEG 4000, 0.2M ammpnium sulfate, 0.1M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.217
2E0L Mutant Human Ribonuclease 1 (Q28L, R31L, R32L) 提交 2006-10-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 29–156(128 aa)
突变:Q28L, R31L, R32L CD CADMIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;293 K;30% PEG 400, 0.1M cadmium chloride, 0.1M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.215
2E0L Mutant Human Ribonuclease 1 (Q28L, R31L, R32L) 提交 2006-10-10 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 29–156(128 aa)
突变:Q28L, R31L, R32L CD CADMIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;293 K;30% PEG 400, 0.1M cadmium chloride, 0.1M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.215
2E0L Mutant Human Ribonuclease 1 (Q28L, R31L, R32L) 提交 2006-10-10 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 29–156(128 aa)
链 B 29–156(128 aa)
突变:Q28L, R31L, R32L 突变:Q28L, R31L, R32L CD CADMIUM ION × 16 CL CHLORIDE ION × 22 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;293 K;30% PEG 400, 0.1M cadmium chloride, 0.1M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.215
2E0M Mutant Human Ribonuclease 1 (T24L, Q28L, R31L, R32L) 提交 2006-10-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 29–156(128 aa)
突变:T24L, Q28L, R31L, R32L CD CADMIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;293 K;30% PEG 400, 0.1M cadmium chloride, 0.1M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.214
2E0M Mutant Human Ribonuclease 1 (T24L, Q28L, R31L, R32L) 提交 2006-10-10 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 29–156(128 aa)
突变:T24L, Q28L, R31L, R32L CD CADMIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;293 K;30% PEG 400, 0.1M cadmium chloride, 0.1M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.214
2E0M Mutant Human Ribonuclease 1 (T24L, Q28L, R31L, R32L) 提交 2006-10-10 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 29–156(128 aa)
链 B 29–156(128 aa)
突变:T24L, Q28L, R31L, R32L 突变:T24L, Q28L, R31L, R32L CD CADMIUM ION × 16 CL CHLORIDE ION × 22 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 4.6;293 K;30% PEG 400, 0.1M cadmium chloride, 0.1M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.214
2E0O Mutant Human Ribonuclease 1 (V52L, D53L, N56L, F59L) 提交 2006-10-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 29–156(128 aa)
突变:V52L, D53L, N56L, F59L SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;1.0M ammonium sulfate, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2E0O Mutant Human Ribonuclease 1 (V52L, D53L, N56L, F59L) 提交 2006-10-10 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 29–156(128 aa)
突变:V52L, D53L, N56L, F59L SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;1.0M ammonium sulfate, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2E0O Mutant Human Ribonuclease 1 (V52L, D53L, N56L, F59L) 提交 2006-10-10 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 29–156(128 aa)
链 B 29–156(128 aa)
突变:V52L, D53L, N56L, F59L 突变:V52L, D53L, N56L, F59L SO4 SULFATE ION × 18 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;1.0M ammonium sulfate, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2E0O Mutant Human Ribonuclease 1 (V52L, D53L, N56L, F59L) 提交 2006-10-10 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 29–156(128 aa)
链 B 29–156(128 aa)
突变:V52L, D53L, N56L, F59L 突变:V52L, D53L, N56L, F59L SO4 SULFATE ION × 18 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;1.0M ammonium sulfate, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2K11 Solution structure of human pancreatic ribonuclease 提交 2008-02-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 29–155(127 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.7;298 K;压力 ambient
NMR样品组成 1.2 mM Human pancreatic ribonuclease, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.2 mM Human pancreatic ribonuclease, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1.2 mM [U-15N] Human pancreatic ribonuclease, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2Q4G Ensemble refinement of the protein crystal structure of human ribonuclease inhibitor complexed with ribonuclease I 提交 2007-05-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 X 29–156(128 aa)
链 Z 29–156(128 aa)
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.95 Å R-free 0.224
3F8G The X-ray structure of a dimeric variant of human pancreatic ribonuclease with high cytotoxic and antitumor activities 提交 2008-11-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 29–153(125 aa)
链 B 29–153(125 aa)
突变:Q28L, R31C, R32C, N34K, E111G 突变:Q28L, R31C, R32C, N34K, E111G SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;A protein solution of 10mg/ml in 10mM Tris acteate ph 7.0, 300mM NaCl was equilibrated against a solution containing 27% w/v PEG, 0.2 M AS, and 100mM cacodylate buffer ph 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.306
4KXH The X-ray crystal structure of a dimeric variant of human pancreatic ribonuclease 提交 2013-05-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 29–151(123 aa) 片段:unp residues 29-151
链 B 29–151(123 aa) 片段:unp residues 29-151
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;20% PEG 8000, 0.1M ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.246
4KXH The X-ray crystal structure of a dimeric variant of human pancreatic ribonuclease 提交 2013-05-26 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 29–151(123 aa) 片段:unp residues 29-151
链 D 29–151(123 aa) 片段:unp residues 29-151
未记录 SO4 SULFATE ION × 7 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;20% PEG 8000, 0.1M ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.246