当前蛋白身份：P08100
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4ZWJ Crystal structure of rhodopsin bound to arrestin by femtosecond X-ray laser 提交 2015-05-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–348（348 aa）
|
突变：R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；PEG400, sodium acetate, magnesium acetate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.293 |
| 4ZWJ Crystal structure of rhodopsin bound to arrestin by femtosecond X-ray laser 提交 2015-05-19 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–348（348 aa）
|
突变：R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；PEG400, sodium acetate, magnesium acetate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.293 |
| 4ZWJ Crystal structure of rhodopsin bound to arrestin by femtosecond X-ray laser 提交 2015-05-19 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–348（348 aa）
|
突变：R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；PEG400, sodium acetate, magnesium acetate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.293 |
| 4ZWJ Crystal structure of rhodopsin bound to arrestin by femtosecond X-ray laser 提交 2015-05-19 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–348（348 aa）
|
突变：R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；PEG400, sodium acetate, magnesium acetate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.293 |
| 5DGY Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin 提交 2015-08-28 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–348（348 aa）
链 C
1–348（348 aa）
|
突变：R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A 突变：R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；PEG400
|
分辨率 7.70 Å R-free 0.335 |
| 5DGY Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin 提交 2015-08-28 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–348（348 aa）
链 D
1–348（348 aa）
|
突变：R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A 突变：R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；PEG400
|
分辨率 7.70 Å R-free 0.335 |
| 5W0P Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin determined by X-ray free electron laser 提交 2017-05-31 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–348（348 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；PEG 400, magnesium acetate, sodium acetate.
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分辨率 3.01 Å R-free 0.272 |
| 5W0P Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin determined by X-ray free electron laser 提交 2017-05-31 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–348（348 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；PEG 400, magnesium acetate, sodium acetate.
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.272 |
| 5W0P Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin determined by X-ray free electron laser 提交 2017-05-31 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–348（348 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；PEG 400, magnesium acetate, sodium acetate.
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.272 |
| 5W0P Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin determined by X-ray free electron laser 提交 2017-05-31 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–348（348 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5；293 K；PEG 400, magnesium acetate, sodium acetate.
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分辨率 3.01 Å R-free 0.272 |
| 6CMO Rhodopsin-Gi complex 提交 2018-03-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
3–323（321 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.50 Å |