当前蛋白身份：P08253
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CK7 GELATINASE A (FULL-LENGTH) 提交 1999-04-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–660（631 aa）
片段：FULL-LENGTH
|
突变：E404A | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；pH 7.8
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.327 |
| 1CXW THE SECOND TYPE II MODULE FROM HUMAN MATRIX METALLOPROTEINASE 2 提交 1999-08-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
278–336（59 aa）
片段：THE SECOND TYPE II MODULE
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR测量条件
pH 5.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
1.3MM COL-2 NA; 90% H2O, 10% D2O
NMR样品组成
1.3MM COL-2 NA; D2O
NMR样品组成
1MM COL-2 U-15N; 90% H2O, 10% D2O
NMR样品组成
4MM COL-2 U-15N; 90% H2O, 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1EAK Catalytic domain of proMMP-2 E404Q mutant 提交 2001-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
32–452（421 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 32-452
链 C
32–452（421 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 32-452
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；PH 8.50
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.303 |
| 1EAK Catalytic domain of proMMP-2 E404Q mutant 提交 2001-07-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
32–452（421 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 32-452
链 D
32–452（421 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 32-452
|
突变：YES 突变：YES | SO4 SULFATE ION × 3 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；PH 8.50
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.303 |
| 1GEN C-TERMINAL DOMAIN OF GELATINASE A 提交 1995-07-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
443–660（218 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.15 Å R-free 0.260 |
| 1GXD proMMP-2/TIMP-2 complex 提交 2002-04-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
30–660（631 aa）
|
突变：YES | SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.50
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.333 |
| 1GXD proMMP-2/TIMP-2 complex 提交 2002-04-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
30–660（631 aa）
|
突变：YES | SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.50
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.333 |
| 1HOV SOLUTION STRUCTURE OF A CATALYTIC DOMAIN OF MMP-2 COMPLEXED WITH SC-74020 提交 2000-12-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
110–256（147 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 I52 N-{4-[(1-HYDROXYCARBAMOYL-2-METHYL-PROPYL)-(2-MORPHOLIN-4-YL-ETHYL)-SULFAMOYL]-4-PENTYL-BENZAMIDE × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成
0.3-0.4mM U-15N, 13C MMP-2C: unlabeled SC-74020 in 20mM TRIS-d11-HCl, 5mM CaCl2, 10uM ZnCl2, 20uM unlabeled SC-74020 | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1J7M The Third Fibronectin Type II Module from Human Matrix Metalloproteinase 2 提交 2001-05-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
337–394（58 aa）
片段：third fibronectin type II module
|
突变：E11G | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5mM col-3 NA; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5mM col-3 NA; D2O | D2O
NMR样品组成
1mM col-3 U-15n; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1KS0 The First Fibronectin Type II Module from Human Matrix Metalloproteinase 2 提交 2002-01-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
223–282（60 aa）
片段：First Fibronectin Type II Module
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5mM col-1; 90% H2O, 10% d6-acetone | 90% H2O, 10% d6-acetone
NMR样品组成
0.5mM col-1; 90% D2O, 10% d6-acetone | 90% D2O, 10% d6-acetone
NMR样品组成
0.7mM col-1 15N; 90% H2O, 10% d6-acetone | 90% H2O, 10% d6-acetone
|
分辨率未提供 |
| 1QIB CRYSTAL STRUCTURE OF GELATINASE A CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
115–213（99 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 88-250 WITH THE FIBRONECTIN DOMAIN DELETED
链 A
394–449（56 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 88-250 WITH THE FIBRONECTIN DOMAIN DELETED
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 1RTG C-TERMINAL DOMAIN (HAEMOPEXIN-LIKE DOMAIN) OF HUMAN MATRIX METALLOPROTEINASE-2 提交 1995-12-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
451–660（210 aa）
片段：C-TERMINAL RESIDUES 451 - 660, HAEMOPEXIN-LIKE DOMAIN
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 3AYU Crystal structure of MMP-2 active site mutant in complex with APP-drived decapeptide inhibitor 提交 2011-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
110–219（110 aa）
片段：UNP residues 110-219 and 394-450
链 A
394–450（57 aa）
片段：UNP residues 110-219 and 394-450
|
突变：E108K, Q110V, E121A 突变：E108K, Q110V, E121A | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.205 |