当前蛋白身份:P08402 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1B00 PHOB RECEIVER DOMAIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1998-11-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–127(127 aa) 片段:RECEIVER DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8;pH 8.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.280
1B00 PHOB RECEIVER DOMAIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1998-11-15 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–127(127 aa) 片段:RECEIVER DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8;pH 8.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.280
1GXP PhoB effector domain in complex with pho box DNA. 提交 2002-04-08 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 124–229(106 aa) 片段:DNA-BINDING AND TRANSACTIVATION DOMAIN, RESIDUES 124-229
链 B 124–229(106 aa) 片段:DNA-BINDING AND TRANSACTIVATION DOMAIN, RESIDUES 124-229
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;pH 7.50
分辨率 2.50 Å R-free 0.289
1GXP PhoB effector domain in complex with pho box DNA. 提交 2002-04-08 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 E 124–229(106 aa) 片段:DNA-BINDING AND TRANSACTIVATION DOMAIN, RESIDUES 124-229
链 F 124–229(106 aa) 片段:DNA-BINDING AND TRANSACTIVATION DOMAIN, RESIDUES 124-229
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;pH 7.50
分辨率 2.50 Å R-free 0.289
1QQI SOLUTION STRUCTURE OF THE DNA-BINDING AND TRANSACTIVATION DOMAIN OF PHOB FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1999-06-07 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 126–229(104 aa) 片段:C-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;300 K;离子强度(mmCIF原始值)NACL 500mM;压力 AMBIENT
NMR样品组成 1-2MM PROTEIN U-15N,13C; 50MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL
NMR样品组成 1-2MM PROTEIN U-15N; 50MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL
NMR样品组成 1-2MM PROTEIN ; 50MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL
分辨率未提供
1ZES BeF3- activated PhoB receiver domain 提交 2005-04-19 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–125(125 aa) 片段:N-terminal domain (residues 1-125)
突变:P125Q MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;298 K;sodium thiocyanate, Peg3350, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.240
1ZES BeF3- activated PhoB receiver domain 提交 2005-04-19 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–125(125 aa) 片段:N-terminal domain (residues 1-125)
链 C 1–125(125 aa) 片段:N-terminal domain (residues 1-125)
突变:P125Q 突变:P125Q MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;298 K;sodium thiocyanate, Peg3350, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.240