当前蛋白身份：P08622
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BQ0 J-DOMAIN (RESIDUES 1-77) OF THE ESCHERICHIA COLI N-TERMINAL FRAGMENT (RESIDUES 1-104) OF THE MOLECULAR CHAPERONE DNAJ, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1998-08-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–103（103 aa）
片段：N-TERMINAL FRAGMENT (RESIDUES 1-104)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM PHOSPHATE
NMR样品组成
2MM, 10% D2O IN H2O
|
分辨率未提供 |
| 1BQZ J-DOMAIN (RESIDUES 1-77) OF THE ESCHERICHIA COLI N-TERMINAL FRAGMENT (RESIDUES 1-78) OF THE MOLECULAR CHAPERONE DNAJ, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1998-08-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–77（77 aa）
片段：N-TERMINAL FRAGMENT (RESIDUES 1-78)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM PHOSPHATE
NMR样品组成
2MM, 10% D2O IN H2O
|
分辨率未提供 |
| 1EXK SOLUTION STRUCTURE OF THE CYSTEINE-RICH DOMAIN OF THE ESCHERICHIA COLI CHAPERONE PROTEIN DNAJ. 提交 2000-05-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
131–209（79 aa）
片段：RESIDUES 131-209
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 1
NMR测量条件
pH 6.8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 1
NMR样品组成
600 uM DnaJ CRD U-15N,13C; 20 mM Tris-d11 pH 6.8; 300 uM ZnCl2; 50 mM NaCl; 2 mM DTT; 0.02% NaN3 | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
600 uM DnaJ CRD U-15N; 20 mM Tris-d11 pH 6.8; 300 uM ZnCl2; 50 mM NaCl; | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1XBL NMR STRUCTURE OF THE J-DOMAIN (RESIDUES 2-76) IN THE ESCHERICHIA COLI N-TERMINAL FRAGMENT (RESIDUES 2-108) OF THE MOLECULAR CHAPERONE DNAJ, 20 STRUCTURES 提交 1996-10-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
片段：N-TERMINAL FRAGMENT (RESIDUES 2-108) OF THE MOLECULAR CHAPERONE DNAJ
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；301 K
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分辨率未提供 |
| 5NRO Structure of full-length DnaK with bound J-domain 提交 2017-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–105（105 aa）
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；9% w/v PEG 8000
0.1M calcium acetate
0.1 M imidazole pH 6.5
protein at 18 mg/ml
crystalization drop contained 200 nl protein + 100 nl reservoir solution
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.234 |