当前蛋白身份：P08670
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1GK4 HUMAN VIMENTIN COIL 2B FRAGMENT (CYS2) 提交 2001-08-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
327–410（84 aa）
片段：CYS2, RESIDUES 328-411
链 B
327–410（84 aa）
片段：CYS2, RESIDUES 328-411
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.17M NA ACETATE, 25.5% PEG8000, 0.1M CACODYLATE, PH6.5, pH 6.50
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |
| 1GK4 HUMAN VIMENTIN COIL 2B FRAGMENT (CYS2) 提交 2001-08-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
327–410（84 aa）
片段：CYS2, RESIDUES 328-411
链 D
327–410（84 aa）
片段：CYS2, RESIDUES 328-411
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.17M NA ACETATE, 25.5% PEG8000, 0.1M CACODYLATE, PH6.5, pH 6.50
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |
| 1GK4 HUMAN VIMENTIN COIL 2B FRAGMENT (CYS2) 提交 2001-08-08 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
327–410（84 aa）
片段：CYS2, RESIDUES 328-411
链 F
327–410（84 aa）
片段：CYS2, RESIDUES 328-411
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.17M NA ACETATE, 25.5% PEG8000, 0.1M CACODYLATE, PH6.5, pH 6.50
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |
| 1GK6 Human vimentin coil 2B fragment linked to GCN4 leucine zipper (Z2B) 提交 2001-08-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
384–411（28 aa）
片段：Z2B FUSION CONSTRUCT CONTAINING THE GCN4 LEUCINE ZIPPER LINKED TO VIMENTIN RESIDUES 385 - 412
链 B
384–411（28 aa）
片段：Z2B FUSION CONSTRUCT CONTAINING THE GCN4 LEUCINE ZIPPER LINKED TO VIMENTIN RESIDUES 385 - 412
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；HANGING DROPS WITH 12.5MG/ML PROTEIN AND 0.55M (NH4)2HPO4, PH ADJUSTED TO 9.0 WITH NAOH, AS PRECIPITANT
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 1GK7 HUMAN VIMENTIN COIL 1A FRAGMENT (1A) 提交 2001-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
101–137（37 aa）
片段：1A, RESIDUES 102-138
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；2.0M AMMONIUM ACETATE, 10%(V/V) DIOXANE, 0.1M MES/NA, PH6.5, pH 6.50
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.216 |
| 3G1E X-ray crystal structure of coil 1A of human vimentin 提交 2009-01-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
102–138（37 aa）
片段：coil 1A
链 B
102–138（37 aa）
片段：coil 1A
|
突变：Y117L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Y117L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；298 K；20 % PEG, 33 % isopropanol, 0.1 M trisodium citrate, pH 5.6, vapour diffusion, temperature 298K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.295 |
| 3KLT Crystal structure of a vimentin fragment 提交 2009-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
263–334（72 aa）
片段：UNP residues 263-334
链 B
263–334（72 aa）
片段：UNP residues 263-334
链 C
263–334（72 aa）
片段：UNP residues 263-334
链 D
263–334（72 aa）
片段：UNP residues 263-334
|
未记录 | P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 SM SAMARIUM (III) ION × 3 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 CA CALCIUM ION × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 27% PEG monoethylether 550, 27mM CaCl2, 7.5% (v/v) glycerol, 10mM DTT , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.331 |
| 3KLT Crystal structure of a vimentin fragment 提交 2009-11-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
263–334（72 aa）
片段：UNP residues 263-334
链 B
263–334（72 aa）
片段：UNP residues 263-334
|
未记录 | P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 SM SAMARIUM (III) ION × 2 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 27% PEG monoethylether 550, 27mM CaCl2, 7.5% (v/v) glycerol, 10mM DTT , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.331 |
| 3KLT Crystal structure of a vimentin fragment 提交 2009-11-09 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
263–334（72 aa）
片段：UNP residues 263-334
链 D
263–334（72 aa）
片段：UNP residues 263-334
|
未记录 | SM SAMARIUM (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 27% PEG monoethylether 550, 27mM CaCl2, 7.5% (v/v) glycerol, 10mM DTT , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.331 |
| 3S4R Crystal structure of vimentin coil1A/1B fragment with a stabilizing mutation 提交 2011-05-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
99–189（91 aa）
片段：coil 1A/1B fragment (UNP residues 99-189)
链 B
99–189（91 aa）
片段：coil 1A/1B fragment (UNP residues 99-189)
|
突变：Y117L 突变：Y117L | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M Na cacodylate, MPD 20%, Mg acetate 0.45M, pH 6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M MES, MPD 35%, 0.35M Li2SO4, pH 6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.315 |
| 3SSU Crystal structure of vimentin coil1A/1B fragment 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
99–189（91 aa）
片段：UNP residues 99-189
链 B
99–189（91 aa）
片段：UNP residues 99-189
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；0.04M calcium acetate, 0.1M MES pH 6, isopropanol 6%, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.06M calcium acetate, 0.1M MES pH 5.5, isopropanol 6%, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.272 |
| 3SWK Crystal structure of vimentin coil1B fragment 提交 2011-07-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
153–238（86 aa）
片段：coil 1B fragment (UNP residues 153-238)
链 B
153–238（86 aa）
片段：coil 1B fragment (UNP residues 153-238)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；protein in 10 mM Tris pH 8, 38 mM NaCl + PEG 3350 25% w/v, 0.2M ammonium acetate, BIS-TRIS 0.1M pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.272 |
| 3TRT Crystal structure of stabilised vimentin coil2 fragment 提交 2011-09-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
261–335（75 aa）
片段：first half of vimentin coil2, UNP residues 261-335
链 B
261–335（75 aa）
片段：first half of vimentin coil2, UNP residues 261-335
|
突变：L265C, L269(MSE), C328(MSE) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L265C, L269(MSE), C328(MSE) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 NH4 AMMONIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；2M ammonium sulphate, 0.1M Tris pH8.5 + protein in 10 mM Tris pH 8, 38 mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.298 |
| 3UF1 Crystal Structure of Vimentin (fragment 144-251) from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium Target HR4796B 提交 2011-10-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
144–251（108 aa）
片段：residues 144-255
链 B
144–251（108 aa）
片段：residues 144-255
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；Protein solution: 100mM NaCl, 5mM DTT, 0.02% NaN3, 10mM Tris-HCl (pH 7.5). Reservoir solution:NH4SO4 0.15M, TRISHCL 0.1M, PEG3350 18%, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.284 |
| 3UF1 Crystal Structure of Vimentin (fragment 144-251) from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium Target HR4796B 提交 2011-10-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
144–251（108 aa）
片段：residues 144-255
链 D
144–251（108 aa）
片段：residues 144-255
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；Protein solution: 100mM NaCl, 5mM DTT, 0.02% NaN3, 10mM Tris-HCl (pH 7.5). Reservoir solution:NH4SO4 0.15M, TRISHCL 0.1M, PEG3350 18%, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.284 |
| 4MCY Immune Receptor 提交 2013-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
66–78（13 aa）
片段：UNP residues 66-78
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；294 K；26% PEG 3350, 0.2M Potassium Nitrate, 0.1M Bis-Tris-Propane pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.225 |
| 4MCZ Immune Receptor 提交 2013-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
59–71（13 aa）
片段：Residues 59-71
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；294 K；26% PEG 3350, 0.2M Potassium Nitrate, 0.1M Bis-Tris-Propane, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.231 |
| 4MD0 Immune Receptor 提交 2013-08-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
59–71（13 aa）
片段：Residues 59-71
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；294 K；24% PEG 3350, 0.2M Potassium Nitrate, 0.1M Bis-Tris-Propane pH 7.3
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.208 |
| 4MD5 Immune Receptor 提交 2013-08-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
66–78（13 aa）
片段：Residues 66-78
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；294 K；26% PEG 3350, 0.2M Potassium Nitrate, 0.1M Bis-Tris-Propane pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.186 |
| 4MDI Immune Receptor 提交 2013-08-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
66–78（13 aa）
片段：Residues 66-78
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；294 K；25% PEG 3350, 0.2M Potassium Nitrate, 0.1M Bis-Tris-Propane pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.203 |
| 4MDJ Immune Receptor 提交 2013-08-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
66–78（13 aa）
片段：Residues 66-78
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；294 K；25% PEG 3350, 0.2M Potassium Nitrate, 0.1M Bis-Tris-Propane pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.188 |
| 4YPC Trimeric crystal structure of vimentin coil1B fragment 提交 2015-03-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
161–243（83 aa）
片段：coil 1B fragment, UNP residues 161-243
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；protein in 10 mM Tris pH 8, 38 mM NaCl mixed in ratio 1:1 with 1M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.276 |
| 4YV3 Trimeric crystal structure of vimentin coil1B fragment 提交 2015-03-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
161–238（78 aa）
链 B
161–238（78 aa）
链 C
161–238（78 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；10mg/ml protein in 10mM Tris-HCl pH 8, 38 mM NaCl mixed in v/v ratio 1:1 with ammonium sulphate 2.2M, sodium thiocyanate 0.2 M
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.296 |
| 5WHF Crystal structure of vimentin coil 1B packed in a high-order filamentous form 提交 2017-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
153–238（86 aa）
片段：UNP residues 153-238
链 B
153–238（86 aa）
片段：UNP residues 153-238
链 C
153–238（86 aa）
片段：UNP residues 153-238
链 D
153–238（86 aa）
片段：UNP residues 153-238
链 E
153–238（86 aa）
片段：UNP residues 153-238
链 F
153–238（86 aa）
片段：UNP residues 153-238
链 G
153–238（86 aa）
片段：UNP residues 153-238
链 H
153–238（86 aa）
片段：UNP residues 153-238
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.2 M magnesium acetate tetrahydrate and 10% PEG 8000
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.282 |
| 6YXK Crystal structure of ACPA 3F3 in complex with cit-vimentin 59-74 提交 2020-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
59–74（16 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20mM Tris pH 7.5, 20mM NaCl, 0.2M ammonium chloride pH 6.3, (20%) w/v PEG 3350)
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 8RVE Vimentin intermediate filament 提交 2024-02-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 78 PDB 声明：78-meric（78） 与蛋白数一致 |
链 0
1–466（466 aa）
链 1
1–466（466 aa）
链 2
1–466（466 aa）
链 3
1–466（466 aa）
链 4
1–466（466 aa）
链 5
1–466（466 aa）
链 6
1–466（466 aa）
链 7
1–466（466 aa）
链 8
1–466（466 aa）
链 9
1–466（466 aa）
链 A
1–466（466 aa）
链 AA
1–466（466 aa）
链 AB
1–466（466 aa）
链 AC
1–466（466 aa）
链 AD
1–466（466 aa）
链 AE
1–466（466 aa）
链 AF
1–466（466 aa）
链 AG
1–466（466 aa）
链 AH
1–466（466 aa）
链 AI
1–466（466 aa）
链 AJ
1–466（466 aa）
链 AK
1–466（466 aa）
链 AL
1–466（466 aa）
链 AM
1–466（466 aa）
链 AN
1–466（466 aa）
链 AO
1–466（466 aa）
链 AP
1–466（466 aa）
链 B
1–466（466 aa）
链 C
1–466（466 aa）
链 D
1–466（466 aa）
链 E
1–466（466 aa）
链 F
1–466（466 aa）
链 G
1–466（466 aa）
链 H
1–466（466 aa）
链 I
1–466（466 aa）
链 J
1–466（466 aa）
链 K
1–466（466 aa）
链 L
1–466（466 aa）
链 M
1–466（466 aa）
链 N
1–466（466 aa）
链 O
1–466（466 aa）
链 P
1–466（466 aa）
链 Q
1–466（466 aa）
链 R
1–466（466 aa）
链 S
1–466（466 aa）
链 T
1–466（466 aa）
链 U
1–466（466 aa）
链 V
1–466（466 aa）
链 W
1–466（466 aa）
链 X
1–466（466 aa）
链 Y
1–466（466 aa）
链 Z
1–466（466 aa）
链 a
1–466（466 aa）
链 b
1–466（466 aa）
链 c
1–466（466 aa）
链 d
1–466（466 aa）
链 e
1–466（466 aa）
链 f
1–466（466 aa）
链 g
1–466（466 aa）
链 h
1–466（466 aa）
链 i
1–466（466 aa）
链 j
1–466（466 aa）
链 k
1–466（466 aa）
链 l
1–466（466 aa）
链 m
1–466（466 aa）
链 n
1–466（466 aa）
链 o
1–466（466 aa）
链 p
1–466（466 aa）
链 q
1–466（466 aa）
链 r
1–466（466 aa）
链 s
1–466（466 aa）
链 t
1–466（466 aa）
链 u
1–466（466 aa）
链 v
1–466（466 aa）
链 w
1–466（466 aa）
链 x
1–466（466 aa）
链 y
1–466（466 aa）
链 z
1–466（466 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.20 Å |
| 8TRQ T cell recognition of citrullinated vimentin peptide presented by HLA-DR4 提交 2023-08-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
59–71（13 aa）
片段：UNP residues 59-71 with modified residue citrulline (CIR) at position 64
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% w/v PEG3350, 0.2 M di-sodium malonate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, tri-glycine additive
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.264 |
| 8TRR T cell recognition of citrullinated vimentin peptide presented by HLA-DR4 提交 2023-08-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
59–71（13 aa）
片段：UNP residues 59-71 with modified residue citrulline (CIR) at position 64
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 7 SO4 SULFATE ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% w/v PEG8000, 0.1 M Tris, pH 8.5, 0.2 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.244 |
| 8TRR T cell recognition of citrullinated vimentin peptide presented by HLA-DR4 提交 2023-08-10 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 H
59–71（13 aa）
片段：UNP residues 59-71 with modified residue citrulline (CIR) at position 64
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% w/v PEG8000, 0.1 M Tris, pH 8.5, 0.2 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.244 |