当前蛋白身份：P0A0L5
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JCK T-CELL RECEPTOR BETA CHAIN COMPLEXED WITH SEC3 SUPERANTIGEN 提交 1996-10-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
28–266（239 aa）
链 D
28–266（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；SOLUTION OF 20% PEG1000, 0.1M MGCL2, 0.025% AGAROSE, 0.1M TRIS-HCL PH 6.5 MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF PROTEIN SOLUTION (10MG/ML IN 20MM TRIS-HCL, 25MM NACL, PH 7.5). HANGING DROP METHOD., vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.328 |
| 1JWM Crystal Structure of the Complex of the MHC Class II Molecule HLA-DR1(HA peptide 306-318) with the Superantigen SEC3 提交 2001-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
28–266（239 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Ethylene Glycol, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.228 |
| 1JWS Crystal Structure of the Complex of the MHC Class II Molecule HLA-DR1 (HA peptide 306-318) with the Superantigen SEC3 Variant 3B1 提交 2001-09-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
28–266（239 aa）
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突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Ethylene Glycol, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.232 |
| 1JWU Crystal Structure of the Complex of the MHC Class II Molecule HLA-DR1 (HA peptide 306-318) with the superantigen SEC3 Variant 3B2 提交 2001-09-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
28–266（239 aa）
|
突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Ethylene Glycol, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.237 |
| 1KLG Crystal structure of HLA-DR1/TPI(23-37, Thr28-->Ile mutant) complexed with staphylococcal enterotoxin C3 variant 3B2 (SEC3-3B2) 提交 2001-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
28–266（239 aa）
片段：residues 29-266
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；PEG 4000, sodium acetate, ethylene glycol, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.246 |
| 1KLU Crystal structure of HLA-DR1/TPI(23-37) complexed with staphylococcal enterotoxin C3 variant 3B2 (SEC3-3B2) 提交 2001-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
28–266（239 aa）
片段：residues 29-266
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；PEG 4000, sodium acetate, ethylene glycol, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION,
HANGING DROP at 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.220 |
| 1SJE HLA-DR1 complexed with a 16 residue HIV capsid peptide bound in a hairpin conformation 提交 2004-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 D
28–266（239 aa）
片段：SEC3 variant 3B2
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突变：K43S,L45F,A46K,H47W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；PEG-MME 5000, Ethylene Glycol, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.223 |
| 1SJH HLA-DR1 complexed with a 13 residue HIV capsid peptide 提交 2004-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
28–266（239 aa）
片段：SEC3 variant 3B2
|
突变：K43S,L45F,A46K,H47W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；277 K；PEG 4000, Ethylene glycol, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.245 |
| 1T5X HLA-DR1 in complex with a synthetic peptide (AAYSDQATPLLLSPR) and the superantigen SEC3-3B2 提交 2004-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
28–266（239 aa）
片段：SEC3 variant 3B2
|
突变：K43S, L45F, A46K, H47W | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；PEG 4000, Ethylene Glycol, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.241 |
| 2AQ1 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
28–266（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M tri-ammonium citrate, 0.3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 2AQ1 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
28–266（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M tri-ammonium citrate, 0.3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 2AQ1 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
28–266（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M tri-ammonium citrate, 0.3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 2AQ1 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
28–266（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M tri-ammonium citrate, 0.3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 2AQ2 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
28–266（239 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, 0.3 % 1,6-diaminohexane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.213 |
| 2AQ2 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
28–266（239 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, 0.3 % 1,6-diaminohexane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.213 |
| 2AQ3 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 提交 2005-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
28–266（239 aa）
链 D
28–266（239 aa）
链 F
28–266（239 aa）
链 H
28–266（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M tri-ammonium citrate, 0.3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.271 |
| 3BVG Manipulating the coupled folding and binding process drives affinity maturation in a protein-protein complex 提交 2008-01-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–266（239 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1M Tris-Cl, pH 8.5, 2.4 M ammonium sulfate, 2.25% polyethylene glycol (PEG) 400 and 2.25% Tween 20, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.276 |
| 3BVM Manipulating the coupled folding and binding process drives affinity maturation in a protein-protein complex 提交 2008-01-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–266（239 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；containing 0.1M Tris-Cl, pH 8.5, 2.4 M ammonium sulfate, 2.25% polyethylene glycol (PEG) 400 and 2.25% Tween 20, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.274 |
| 3BVZ Manipulating the coupled folding and binding process drives affinity maturation in a protein-protein complex 提交 2008-01-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–266（239 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1M Tris-Cl, pH 8.5, 2.4 M ammonium sulfate, 2.25% polyethylene glycol (PEG) 400 and 2.25% Tween 20, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 3BYT A complex between a variant of staphylococcal enterotoxin C3 and the variable domain of the murine T cell receptor beta chain 8.2 提交 2008-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
28–266（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2 M tri-ammonium citrate pH 7.0, 0.3 % dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.278 |
| 3BYT A complex between a variant of staphylococcal enterotoxin C3 and the variable domain of the murine T cell receptor beta chain 8.2 提交 2008-01-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
28–266（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2 M tri-ammonium citrate pH 7.0, 0.3 % dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.278 |
| 3BYT A complex between a variant of staphylococcal enterotoxin C3 and the variable domain of the murine T cell receptor beta chain 8.2 提交 2008-01-16 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
28–266（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2 M tri-ammonium citrate pH 7.0, 0.3 % dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.278 |
| 3BYT A complex between a variant of staphylococcal enterotoxin C3 and the variable domain of the murine T cell receptor beta chain 8.2 提交 2008-01-16 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
28–266（239 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2 M tri-ammonium citrate pH 7.0, 0.3 % dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.278 |
| 3BYY Manipulating the coupled folding and binding process drives affinity maturation in a protein-protein complex 提交 2008-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
28–266（239 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-Cl pH 7.0, 0.3 % 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.233 |
| 3BZD Manipulating the coupled folding and binding process drives affinity maturation in a protein-protein complex 提交 2008-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
28–266（239 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-Cl pH 7.0, 0.3 % 1,6-diaminohexane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |