当前蛋白身份：P0A790
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AW8 PYRUVOYL DEPENDENT ASPARTATE DECARBOXYLASE 提交 1997-10-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–24（24 aa）
链 B
25–115（91 aa）
链 D
1–24（24 aa）
链 E
25–115（91 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12% PEG 2000 MME, 0.1 M NA ACETATE, PH 4.6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 1PPY Native precursor of pyruvoyl dependent Aspartate decarboxylase 提交 2003-06-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
链 B
1–126（126 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；NH42SO4, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.195 |
| 1PQE S25A mutant of pyruvoyl dependent aspartate decarboxylase 提交 2003-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
|
突变：S25A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；NH42SO4,Tris/HCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.205 |
| 1PQF Glycine 24 to Serine mutation of aspartate decarboxylase 提交 2003-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
链 B
1–126（126 aa）
|
突变：G24S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：G24S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；NH42SO4, citric acid, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.185 |
| 1PQH Serine 25 to Threonine mutation of aspartate decarboxylase 提交 2003-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
链 B
1–126（126 aa）
|
突变：S25T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S25T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 2 MLA MALONIC ACID × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；Sodium malonate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.166 |
| 1PT0 Unprocessed Pyruvoyl Dependent Aspartate Decarboxylase with an Alanine insertion at position 26 提交 2003-06-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
链 B
1–126（126 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；290 K；1.4-1.6M Ammonium Sulphate, 0.1M Citric Acid, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.191 |
| 1PT1 Unprocessed Pyruvoyl Dependent Aspartate Decarboxylase with Histidine 11 Mutated to Alanine 提交 2003-06-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
链 B
1–126（126 aa）
|
突变：H11A 突变：H11A | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；290 K；1.4-1.6M Ammonium Sulphate, 0.1M Citric Acid, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.170 |
| 1PYQ Unprocessed Aspartate Decarboxylase Mutant, with Alanine inserted at position 24 提交 2003-07-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
链 B
1–126（126 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；290 K；0.1M citric acid, 1.6M ammonium sulphate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.179 |
| 1PYU Processed Aspartate Decarboxylase Mutant with Ser25 mutated to Cys 提交 2003-07-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–24（24 aa）
链 B
25–126（102 aa）
链 C
1–24（24 aa）
链 D
25–126（102 aa）
|
突变：S25C 突变：S25C | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；290 K；0.1M citric acid, 1.6M ammonium sulphate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.196 |
| 3TM7 Processed Aspartate Decarboxylase Mutant with Asn72 mutated to Ala 提交 2011-08-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–24（24 aa）
链 B
25–126（102 aa）
链 C
1–24（24 aa）
链 D
25–126（102 aa）
|
突变：N72A 突变：N72A | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；1.6-2.4M ammonium sulphate, 0.1M citric acid, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.184 |
| 3TM7 Processed Aspartate Decarboxylase Mutant with Asn72 mutated to Ala 提交 2011-08-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–24（24 aa）
链 B
25–126（102 aa）
链 C
1–24（24 aa）
链 D
25–126（102 aa）
|
突变：N72A 突变：N72A | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；1.6-2.4M ammonium sulphate, 0.1M citric acid, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.184 |
| 4AOK Conformational dynamics of aspartate alpha-decarboxylase active site revealed by protein-ligand complexes: 1-methyl-L-aspartate complex 提交 2012-03-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–24（24 aa）
链 B
25–126（102 aa）
链 D
1–24（24 aa）
链 E
25–126（102 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.2；5 MG/ML ASPARTATE-ALPHA-DECARBOXYLASE IN 1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM CITRATE, PH 3.8
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.180 |
| 4AON Conformational dynamics of aspartate alpha-decarboxylase active site revealed by protein-ligand complexes: 1-methyl-L-aspartate complex 提交 2012-03-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–24（24 aa）
链 B
25–126（102 aa）
链 D
1–24（24 aa）
链 E
25–126（102 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GLU GLUTAMIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.2；5 MG/ML ASPARTATE-ALPHA-DECARBOXYLASE IN 1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM CITRATE, PH 3.8
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.162 |
| 4AZD T57V mutant of aspartate decarboxylase 提交 2012-06-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
链 B
1–126（126 aa）
|
突变：YES 突变：YES | MLI MALONATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4；292 K；2.4 M SODIUM MALONATE, 1.5 M (NH4)2SO4 PH 4, 292 K
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.217 |
| 4CRY Direct visualisation of strain-induced protein post-translational modification 提交 2014-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–24（24 aa）
链 G
25–126（102 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ACO ACETYL COENZYME *A × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4；20% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 3350, 0.1 M BIS-TRIS PROPANE PH 7.4, 0.2 M POTASSIUM THIOCYANATE
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.150 |
| 4CRZ Direct visualisation of strain-induced protein prost-translational modification 提交 2014-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SCN THIOCYANATE ION × 4 ACO ACETYL COENZYME *A × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4；20% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 3350, 0.1 M BIS-TRIS PROPANE PH 7.4, 0.2 M POTASSIUM THIOCYANATE
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.175 |
| 4CS0 Direct visualisation of strain-induced protein post-translational modification 提交 2014-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–126（126 aa）
|
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SCN THIOCYANATE ION × 4 ACO ACETYL COENZYME *A × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4；20% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 3350, 0.1 M BIS-TRIS PROPANE PH 7.4, 0.2 M POTASSIUM THIOCYANATE
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.237 |
| 4D7Z E. coli L-aspartate-alpha-decarboxylase mutant N72Q to a resolution of 1.9 Angstroms 提交 2014-12-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–24（24 aa）
链 B
25–119（95 aa）
片段：RESIDUES 25-119
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突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SCN THIOCYANATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；ADC.PANZ COMPLEX WAS PREPARED IN A 10: 11 RATIO AT A FINAL CONCENTRATION OF 5.7 MG/ML WITH A 2-FOLD MOLAR EXCESS (RELATIVE TO PANZ) OF ACETYLCOA IN 0.05 M TRIS-HCL PH 7.69, 0.1 M NACL, 0.1 MM DTT. THIS WAS MIXED IN A 1:1 RATIO WITH RESERVOIR SOLUTION (0.2 M POTASSIUM THIOCYANATE, 0.1 M BIS- TRIS PROPANE PH 6.8, 20 % W/V PEG 3350) AND CRYSTALLIZED BY HANGING DROP VAOUR DIFFUSION (4 UL DROPLET OVER A 1 ML RESERVOIR).
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.244 |
| 5LS7 Complex of wild type E. coli alpha aspartate decarboxylase with its processing factor PanZ 提交 2016-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–24（24 aa）
链 D
25–126（102 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 8 ACO ACETYL COENZYME *A × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 CO2 CARBON DIOXIDE × 12 SCN THIOCYANATE ION × 8 74C methyl radical × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；200 mM KSCN, 100 mM Bis-Tris propane pH 6.5, 20% v/v PEG 3350
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分辨率 1.16 Å R-free 0.137 |