当前蛋白身份:P0A7N0 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4V5B Structure of PDF binding helix in complex with the ribosome. 提交 2007-11-22 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:53-meric(53) 与全部聚合物一致
链 AZ 1–70(70 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 170 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;pH 7.5
分辨率 3.74 Å R-free 0.323
4V5B Structure of PDF binding helix in complex with the ribosome. 提交 2007-11-22 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:52-meric(52) 与全部聚合物一致
链 CZ 1–70(70 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 173 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;pH 7.5
分辨率 3.74 Å R-free 0.323
8URY Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 30 nt long spacer, and fMet-tRNA in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致
链 g 1–70(70 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9AX7 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + CUG start codon) 提交 2024-03-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致
链 4 1–70(70 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
9CG5 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + UUG start codon) 提交 2024-06-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致
链 4 1–70(70 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.59 Å
9CG6 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + GUG start codon) 提交 2024-06-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致
链 4 1–70(70 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
9CG7 70S initiation complex (tRNA-fMet M1 + AUG start codon) 提交 2024-06-28 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致
链 4 1–70(70 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 309 IAS BETA-L-ASPARTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å