当前蛋白身份：P0A850
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1L1P Solution Structure of the PPIase Domain from E. coli Trigger Factor 提交 2002-02-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
148–249（102 aa）
片段：PPIase domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1M NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
2-3mM PPIase domain U-15N; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 0.02% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2-3mM PPIase domain; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 0.02% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2-3mM PPIase domain; 50mM phosphate buffer; 0.1M NaCl; 0.02% NaN3 | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1OMS Structure determination by MAD: E.coli Trigger Factor binding at the ribosomal exit tunnel. 提交 2003-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–118（118 aa）
片段：Ribosome binding domain
链 B
1–118（118 aa）
片段：Ribosome binding domain
链 C
1–118（118 aa）
片段：Ribosome binding domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 13 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 5 SO2 SULFUR DIOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；279 K；PEG 2000 MME, PEG 400, ammonium sulfate, sodium acetate, tris, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.238 |
| 1P9Y Ribosome binding of E. coli Trigger Factor mutant F44L. 提交 2003-05-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–118（118 aa）
片段：Ribosome binding domain
|
突变：F44L | ACY ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；281 K；PEG 2000 MME, AMMONIUM SULFATE, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.247 |
| 1P9Y Ribosome binding of E. coli Trigger Factor mutant F44L. 提交 2003-05-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–118（118 aa）
片段：Ribosome binding domain
|
突变：F44L | ACY ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；281 K；PEG 2000 MME, AMMONIUM SULFATE, SODIUM ACETATE, TRIS, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.247 |
| 2VRH Structure of the E. coli trigger factor bound to a translating ribosome 提交 2008-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–432（432 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50 MM HEPES-KOH PH 7.5, 100 MM KCL, 25 MM MGCL2, 0.5 MG/ML CHLORAMPHENICOL；pH 7.5；50 MM HEPES-KOH PH 7.5, 100 MM KCL, 25 MM MGCL2, 0.5 MG/ML CHLORAMPHENICOL
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
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分辨率 19.00 Å |
| 5OWI The dynamic dimer structure of the chaperone Trigger Factor (conformer 1) 提交 2017-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–432（432 aa）
链 B
1–432（432 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成
0.3 mM [U-15N; U-2H] Trigger Factor, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N; U-2H] Trigger Factor, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 5OWJ The dynamic dimer structure of the chaperone Trigger Factor (conformer 2) 提交 2017-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–432（432 aa）
链 B
1–432（432 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成
0.3 mM [U-15N; U-2H] Trigger Factor, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N; U-2H] Trigger Factor, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6D6S Solution structure of Trigger Factor dimer 提交 2018-04-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–432（432 aa）
链 B
1–432（432 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；295 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR测量条件
pH 7；283 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR测量条件
pH 7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR测量条件
pH 7；295 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成
2.2 mM [U-2H; Ala-13CH3; Met-13CH3; Ile-d1-13CH3; Leu/Val-13CH3/13CH3; Phe-13C15N; Tyr-13C15N] TF, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-2H; Ala-13CH3; Met-13CH3; Ile-d1-13CH3] Trigger Factor, 0.6 mM [Leu/Val-13CH3/13CH3; Phe-13C15N; Tyr-13C15N] TF, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.3 mM [U-2H; Ala-13CH3; Met-13CH3; Ile-d1-13CH3; Leu/Val-13CH3/13CH3; Phe-13C15N; Tyr-13C15N] RBD, 0.3 mM [U-2H; Ala-13CH3; Met-13CH3; Ile-d1-13CH3; Leu/Val-13CH3/13CH3] PPD-SBD, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.3 mM [U-2H; Ala-13CH3; Met-13CH3; Ile-d1-13CH3; Leu/Val-13CH3/13CH3; Phe-13C15N; Tyr-13C15N] RBD, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] PPD, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-2H; Ala-13CH3; Met-13CH3; Ile-d1-13CH3; Leu/Val-13CH3/13CH3; Phe-13C15N; Tyr-13C15N] SBD, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
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分辨率未提供 |
| 7D6Z Molecular model of the cryo-EM structure of 70S ribosome in complex with peptide deformylase and trigger factor 提交 2020-10-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 h
1–117（117 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7D80 Molecular model of the cryo-EM structure of 70S ribosome in complex with peptide deformylase, trigger factor, and methionine aminopeptidase 提交 2020-10-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 5
1–432（432 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8ZFI Structure of E.coli ribosome in complex with an engineered arrest peptide and trigger factor 提交 2024-05-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–432（432 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 PRO PROLINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；20 mM HEPES (pH 7.6), 140 mM NH4Cl, 25 mM MgCl2, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
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分辨率 2.90 Å |
| 9WNR Structure of E.coli ribosome in complex with an engineered arrest peptide and trigger factor 提交 2025-09-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–432（432 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 PRO PROLINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6；20 mM HEPES (pH 7.6), 140 mM NH4Cl, 25 mM MgCl2, 2 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 2.76 Å |