当前蛋白身份:P0A8J2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2RU8 DnaT C-terminal domain 提交 2014-01-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 89–179(91 aa) 片段:ssDNA binding domain, UNP residues 89-179
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] DnaT-1, 20 mM HEPES-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-99% 15N] DnaT-3, 20 mM HEPES-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
4OU6 Crystal structure of DnaT84-153-dT10 ssDNA complex form 1 提交 2014-02-15 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 A 84–159(76 aa) 片段:UNP RESIDUES 84-159
链 B 84–159(76 aa) 片段:UNP RESIDUES 84-159
链 C 84–159(76 aa) 片段:UNP RESIDUES 84-159
链 D 84–159(76 aa) 片段:UNP RESIDUES 84-159
链 E 84–159(76 aa) 片段:UNP RESIDUES 84-159
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.96 Å R-free 0.228
4OU7 Crystal structure of DnaT84-153-dT10 ssDNA complex reveals a novel single-stranded DNA binding mode 提交 2014-02-15 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 A 84–154(71 aa) 片段:UNP RESIDUES 84-154
链 B 84–154(71 aa) 片段:UNP RESIDUES 84-154
链 C 84–154(71 aa) 片段:UNP RESIDUES 84-154
链 D 84–154(71 aa) 片段:UNP RESIDUES 84-154
链 E 84–154(71 aa) 片段:UNP RESIDUES 84-154
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.83 Å R-free 0.238
9ZBT Visualization of PriA/PriB/DnaT complexes reveals mechanisms governing structure-specific assembly of the DNA replication restart primosome 提交 2025-11-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致
链 D 1–179(179 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;50 mM Tris-HCl, pH 8, 2 mM dithiothreitol, 5 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 75 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
9ZBU Visualization of PriA/PriB/DnaT complexes reveals mechanisms governing structure-specific assembly of the DNA replication restart primosome 提交 2025-11-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致
链 C 1–154(154 aa)
链 D 1–154(154 aa)
链 E 1–154(154 aa)
链 T 1–154(154 aa)
链 W 1–154(154 aa)
链 X 1–154(154 aa)
链 Y 1–154(154 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;50 mM Tris-HCl, pH 8, 2 mM dithiothreitol, 5 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 75 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å