当前蛋白身份:P0A8J2
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差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2RU8 DnaT C-terminal domain 提交 2014-01-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
89–179(91 aa)
片段:ssDNA binding domain, UNP residues 89-179
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] DnaT-1, 20 mM HEPES-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.1 mM [U-99% 15N] DnaT-3, 20 mM HEPES-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4OU6 Crystal structure of DnaT84-153-dT10 ssDNA complex form 1 提交 2014-02-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致 |
链 A
84–159(76 aa)
片段:UNP RESIDUES 84-159
链 B
84–159(76 aa)
片段:UNP RESIDUES 84-159
链 C
84–159(76 aa)
片段:UNP RESIDUES 84-159
链 D
84–159(76 aa)
片段:UNP RESIDUES 84-159
链 E
84–159(76 aa)
片段:UNP RESIDUES 84-159
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.228 |
| 4OU7 Crystal structure of DnaT84-153-dT10 ssDNA complex reveals a novel single-stranded DNA binding mode 提交 2014-02-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致 |
链 A
84–154(71 aa)
片段:UNP RESIDUES 84-154
链 B
84–154(71 aa)
片段:UNP RESIDUES 84-154
链 C
84–154(71 aa)
片段:UNP RESIDUES 84-154
链 D
84–154(71 aa)
片段:UNP RESIDUES 84-154
链 E
84–154(71 aa)
片段:UNP RESIDUES 84-154
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.238 |
| 9ZBT Visualization of PriA/PriB/DnaT complexes reveals mechanisms governing structure-specific assembly of the DNA replication restart primosome 提交 2025-11-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致 |
链 D
1–179(179 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;50 mM Tris-HCl, pH 8, 2 mM dithiothreitol, 5 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 75 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.22 Å |
| 9ZBU Visualization of PriA/PriB/DnaT complexes reveals mechanisms governing structure-specific assembly of the DNA replication restart primosome 提交 2025-11-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–154(154 aa)
链 D
1–154(154 aa)
链 E
1–154(154 aa)
链 T
1–154(154 aa)
链 W
1–154(154 aa)
链 X
1–154(154 aa)
链 Y
1–154(154 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;50 mM Tris-HCl, pH 8, 2 mM dithiothreitol, 5 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 75 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |