当前蛋白身份:P0ABS8 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1DU2 SOLUTION STRUCTURE OF THE THETA SUBUNIT OF DNA POLYMERASE III 提交 2000-01-13 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–76(76 aa) 片段:THETA SUBUNIT
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.03;压力 aambient
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.03;压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.03;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM Theta subunit U-15N; 10 mM phosphate buffer pH 6.5; | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM Theta subunit U-15N,13C; 10 mM phosphate buffer, pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM Theta subunit; 10 mM phosphate buffer pH 6.5; | 100% D2O
分辨率未提供
2AE9 Solution Structure of the theta subunit of DNA polymerase III from E. coli 提交 2005-07-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–76(76 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;压力 ambient
NMR样品组成 600 uM theta U-15N,13C; 10 mM NaPi pH 6.5 10 M EDTA, 5mM NaN3 | 54 % H2O; 6 % D2O; 40% d3- Methanol
NMR样品组成 600 uM theta U-15N,13C; 10 mM NaPi pH 6.5 10 M EDTA, 5mM NaN3 | 60% D2O; 40% d4- Methanol
分辨率未提供
2AXD solution structure of the theta subunit of escherichia coli DNA polymerase III in complex with the epsilon subunit 提交 2005-09-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 S 1–76(76 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM NaCl;压力 ambient
NMR样品组成 1MM THETA-EPSILON186 U15N,13C(THETA); 100mM NaCl, 0.1mM DITHIOTHREITOL; 20mM PHOSPHATE BUFFER Na; 90% H20, 10% D2O | 90% H20, 10% D2O
NMR样品组成 1MM THETA-EPSILON186 U15N,13C(THETA); 100mM NaCl, 0.1mM DITHIOTHREITOL; 20mM TRIS BUFFER; 90% H20, 10% D2O | 90% H20, 10% D2O
分辨率未提供
5M1S Cryo-EM structure of the E. coli replicative DNA polymerase-clamp-exonuclase-theta complex bound to DNA in the editing mode 提交 2016-10-10 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致
链 F 10–65(56 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Prior to sample preparation 0.1 volumes of 0.05% Tween 20 were added to the sample 3 microliters were pipetted onto the grid and blotted for 4 seconds
分辨率 6.70 Å