当前蛋白身份:P0ACB2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1B4E X-ray structure of 5-aminolevulinic acid dehydratase complexed with the inhibitor levulinic acid 提交 1998-12-19 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–323(323 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 24 ZN ZINC ION × 24 SHF LAEVULINIC ACID × 8 GOL GLYCEROL × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.2;7MG/ML ENZYME AND 2 - 5 % SATURATED AMMONIUM SULPHATE AS PRECIPITANT. 0.2 M TRIS-HCL USED TO BUFFER THE PH BETWEEN 8.1 AND 8.4. 15MM LEVULINIC ACID, 40UM ZINC SULPHATE AND 4MM BETA- MERCAPTOETHANOL WERE PRESENT., pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.00 Å R-free 0.255
1I8J CRYSTAL STRUCTURE OF PORPHOBILINOGEN SYNTHASE COMPLEXED WITH THE INHIBITOR 4,7-DIOXOSEBACIC ACID 提交 2001-03-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–323(323 aa)
链 B 1–323(323 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 DSB 4,7-DIOXOSEBACIC ACID × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;294 K;PEG 3350, GLYCEROL, TRIS-HCL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.90 Å R-free 0.247
1L6S Crystal Structure of Porphobilinogen Synthase Complexed with the Inhibitor 4,7-Dioxosebacic Acid 提交 2002-03-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–323(323 aa)
链 B 1–323(323 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 DSB 4,7-DIOXOSEBACIC ACID × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;PEG 3350, 10% GLYCEROL, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.5, 0.02% SODIUM AZIDE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.70 Å R-free 0.243
1L6Y Crystal Structure of Porphobilinogen Synthase Complexed with the Inhibitor 4-Oxosebacic Acid 提交 2002-03-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–323(323 aa)
链 B 1–323(323 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 4OX 4-OXODECANEDIOIC ACID × 8 GOL GLYCEROL × 20 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;PEG 3350, 10% GLYCEROL, 0.1M TRIS-HCL, PH 8.5, 0.02% SODIUM AZIDE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
5MHB Product-Complex of E.coli 5-Amino Laevulinic Acid Dehydratase 提交 2016-11-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–324(324 aa)
未记录 PBG 3-[5-(AMINOMETHYL)-4-(CARBOXYMETHYL)-1H-PYRROL-3-YL]PROPANOIC ACID × 8 ZN ZINC ION × 24 GOL GLYCEROL × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.2;293 K;ALAD at 7 mg per ml mixed with equal volume of well solution: 200 mM Tris pH 8.0 - 8.4, 2 % saturated Ammonium sulphate, 200 microM zinc sulphate, 6 mM beta-mercaptoethanol and 3 mM porphobilinogen. Crystals were grown in the dark.
分辨率 2.10 Å R-free 0.213