当前蛋白身份:P0AFW8
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差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1SG5 Solution structure of Yaeo, a Rho-specific inhibitor of transcription termination 提交 2004-02-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–84(84 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;303 K;压力 ambient
NMR样品组成
2mM YaeO, 150mM phophate buffer, 2.0mM DTT; 0.1 mM NaN3,90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2mM YaeO,U-15N, 150mM phophate buffer, 2.0mM DTT; 0.1 mM NaN3, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2mM YaeO,U-15N, 13C, 150mM phophate buffer, 2.0mM DTT; 0.1 mM NaN3, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2mM YaeO, 150mM phophate buffer, 2.0mM DTT; 0.1 mM NaN3, 100% D20 | 100% D20
|
分辨率未提供 |
| 8PTM Structure of the transcription termination factor Rho in complex with Rof and ADP 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:11-meric(11) 与蛋白数一致 |
链 a
2–84(83 aa)
链 b
2–84(83 aa)
链 c
2–84(83 aa)
链 d
2–84(83 aa)
链 e
2–84(83 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 2.90 Å |
| 8PTN Structure of the transcription termination factor Rho in complex with Rof 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致 |
链 a
2–84(83 aa)
链 b
2–84(83 aa)
链 c
2–84(83 aa)
链 d
2–84(83 aa)
链 e
2–84(83 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.30 Å |
| 8PTO Structure of Rho pentamer in complex with Rof and ADP 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 a
2–84(83 aa)
链 b
2–84(83 aa)
链 c
2–84(83 aa)
链 d
2–84(83 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 2.70 Å |
| 8PTP Structure of Rho pentamer in complex with Rof 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 a
2–84(83 aa)
链 b
2–84(83 aa)
链 c
2–84(83 aa)
链 d
2–84(83 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
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分辨率 3.00 Å |
| 8W8D Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by Rof 提交 2023-09-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致 |
链 a
1–84(84 aa)
链 b
1–84(84 aa)
链 c
1–84(84 aa)
链 d
1–84(84 aa)
链 e
1–84(84 aa)
链 f
1–84(84 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |