当前蛋白身份:P0AFW8 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1SG5 Solution structure of Yaeo, a Rho-specific inhibitor of transcription termination 提交 2004-02-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–84(84 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;303 K;压力 ambient
NMR样品组成 2mM YaeO, 150mM phophate buffer, 2.0mM DTT; 0.1 mM NaN3,90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 2mM YaeO,U-15N, 150mM phophate buffer, 2.0mM DTT; 0.1 mM NaN3, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 2mM YaeO,U-15N, 13C, 150mM phophate buffer, 2.0mM DTT; 0.1 mM NaN3, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 2mM YaeO, 150mM phophate buffer, 2.0mM DTT; 0.1 mM NaN3, 100% D20 | 100% D20
分辨率未提供
8PTM Structure of the transcription termination factor Rho in complex with Rof and ADP 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:11-meric(11) 与蛋白数一致
链 a 2–84(83 aa)
链 b 2–84(83 aa)
链 c 2–84(83 aa)
链 d 2–84(83 aa)
链 e 2–84(83 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 2.90 Å
8PTN Structure of the transcription termination factor Rho in complex with Rof 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 a 2–84(83 aa)
链 b 2–84(83 aa)
链 c 2–84(83 aa)
链 d 2–84(83 aa)
链 e 2–84(83 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.30 Å
8PTO Structure of Rho pentamer in complex with Rof and ADP 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 a 2–84(83 aa)
链 b 2–84(83 aa)
链 c 2–84(83 aa)
链 d 2–84(83 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 2.70 Å
8PTP Structure of Rho pentamer in complex with Rof 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 a 2–84(83 aa)
链 b 2–84(83 aa)
链 c 2–84(83 aa)
链 d 2–84(83 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.00 Å
8W8D Structural mechanism of inhibition of the Rho transcription termination factor by Rof 提交 2023-09-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 a 1–84(84 aa)
链 b 1–84(84 aa)
链 c 1–84(84 aa)
链 d 1–84(84 aa)
链 e 1–84(84 aa)
链 f 1–84(84 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å