当前蛋白身份:P0C6U2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2J97 Human coronavirus 229E non structural protein 9 (Nsp9) 提交 2006-11-03 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 3825–3933(109 aa) 片段:RESIDUES 3825-3933
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5;1.9M AMMONIUM SULFATE 0.1M NA ACETATE PH 4.0 5% MPD
分辨率 1.75 Å R-free 0.225
2J98 Human coronavirus 229E non structural protein 9 cys69ala mutant (Nsp9) 提交 2006-11-03 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 3825–3933(109 aa) 片段:RESIDUES 3825-3933
链 B 3825–3933(109 aa) 片段:RESIDUES 3825-3933
突变:YES 突变:YES DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5;0.1M NA ACETATE PH 4.6 30% PEG MME 2000
分辨率 1.80 Å R-free 0.278
2ZU2 complex structure of CoV 229E 3CL protease with EPDTC 提交 2008-10-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 2966–3267(302 aa)
链 B 2966–3267(302 aa)
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 DTZ zinc(II)hydrogensulfide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;298 K;18% PEG 6000, 10% DMSO, 14% MPD, 0.1M Tris-HCL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
3EWQ HCov-229E Nsp3 ADRP domain 提交 2008-10-16 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1269–1436(168 aa) 片段:ADRP domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;291 K;0.1M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, temperature 291.0K
分辨率 2.10 Å R-free 0.282
3EWR complex of substrate ADP-ribose with HCoV-229E Nsp3 ADRP domain 提交 2008-10-16 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1269–1436(168 aa) 片段:ADRP domain
未记录 APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;291 K;0.1M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG 3350 , VAPOR DIFFUSION, temperature 291.0K
分辨率 2.01 Å R-free 0.264