当前蛋白身份：P0C6X7
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1UK4 Crystal structure of SARS Coronavirus Main Proteinase (3CLpro) Complexed With An Inhibitor 提交 2003-08-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
链 B
3241–3546（306 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG 6000, MES, DMSO, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.231 |
| 2XYQ Crystal structure of the nsp16 nsp10 SARS coronavirus complex 提交 2010-11-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6776–7065（290 aa）
片段：RESIDUES 6776-7065
链 B
4240–4361（122 aa）
片段：RESIDUES 4240-4361
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 NA SODIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；0.1M CHES, 1.52M MGCL2, pH 9
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.227 |
| 2XYR Crystal structure of the nsp16 nsp10 SARS coronavirus complex 提交 2010-11-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6776–7067（292 aa）
片段：RESIDUES 6776-7067
链 B
4240–4361（122 aa）
片段：RESIDUES 4240-4361
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 5 SFG SINEFUNGIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；0.1M CHES, 1.52M MGCL2, pH 9
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.235 |
| 2XYV Crystal structure of the nsp16 nsp10 SARS coronavirus complex 提交 2010-11-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6776–7067（292 aa）
片段：RESIDUES 6776-7065
链 B
4240–4361（122 aa）
片段：RESIDUES 4240-4361
|
突变：YES | NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 5 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；67 MM M CHES, 0.99 M MGCL2-HEXAYDRATE, 33 MM TRIS-HCL, 8.3% (V/V) PEG 8000, FROZEN IN THE PRESENCE OF 15% (V/V) GLYCEROL, pH 8.5
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.234 |
| 3EBN A Special Dimerization of SARS-CoV Main Protease C-Terminal Domain Due to Domain-swapping 提交 2008-08-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3429–3546（118 aa）
片段：UNP residues 3429-3546
链 C
3429–3546（118 aa）
片段：UNP residues 3429-3546
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；25% PEG3350, pH5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 3EBN A Special Dimerization of SARS-CoV Main Protease C-Terminal Domain Due to Domain-swapping 提交 2008-08-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3429–3546（118 aa）
片段：UNP residues 3429-3546
链 D
3429–3546（118 aa）
片段：UNP residues 3429-3546
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；25% PEG3350, pH5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 3R24 Crystal structure of nsp10/nsp16 complex of SARS coronavirus 提交 2011-03-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6776–7073（298 aa）
|
未记录 | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；2.0M NaCl, 0.1M NaH2PO4, 0.1M K2HPO4, 0.1M MES, pH5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 4TWW Structure of SARS-3CL protease complex with a Bromobenzoyl (S,R)-N-decalin type inhibitor 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
链 B
3241–3546（306 aa）
|
未记录 | 3A7 (2S)-2-({[(3S,4aR,8aS)-2-(4-bromobenzoyl)decahydroisoquinolin-3-yl]methyl}amino)-3-(1H-imidazol-5-yl)propanal × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；9-11%(w/v) of PEG20000, 100mM MES, 5mM DTT
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.261 |
| 4TWY Structure of SARS-3CL protease complex with a phenylbenzoyl (S,R)-N-decalin type inhibitor 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
|
未记录 | 3BL (2S)-2-({[(3S,4aR,8aS)-2-(biphenyl-4-ylcarbonyl)decahydroisoquinolin-3-yl]methyl}amino)-3-(1H-imidazol-5-yl)propanal × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；10%(w/v) of PEG20000, 100mM MES, 5mM DTT
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.319 |
| 4WY3 Structure of SARS-3CL protease complex with a phenylbenzoyl (R,S)-N-decalin type inhibitor 提交 2014-11-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
|
未记录 | 3X5 (2S)-2-({[(3R,4aS,8aR)-2-(biphenyl-4-ylcarbonyl)decahydroisoquinolin-3-yl]methyl}amino)-3-(1H-imidazol-5-yl)propanal × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；10%(w/v) PEG20000, 100mM MES, 5 mM DTT
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.299 |
| 5B6O Crystal structure of MS8104 提交 2016-05-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3556（316 aa）
链 B
3241–3556（316 aa）
|
突变：C145A 突变：C145A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；Sodium Chloride, PEG 4000 , pH 7.3, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.254 |
| 5C5N Structure of SARS-3CL protease complex with a phenyl-beta-alanyl (R,S)-N-decalin type inhibitor 提交 2015-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
|
突变：R188I | SLH (2S)-3-(1H-imidazol-5-yl)-2-({[(3R,4aS,8aR)-2-(N-phenyl-beta-alanyl)decahydroisoquinolin-3-yl]methyl}amino)propanal × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10%(w/v) of PEG20000, 100mM MES, 5mM DTT
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.321 |
| 5C5N Structure of SARS-3CL protease complex with a phenyl-beta-alanyl (R,S)-N-decalin type inhibitor 提交 2015-06-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
|
突变：R188I | SLH (2S)-3-(1H-imidazol-5-yl)-2-({[(3R,4aS,8aR)-2-(N-phenyl-beta-alanyl)decahydroisoquinolin-3-yl]methyl}amino)propanal × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10%(w/v) of PEG20000, 100mM MES, 5mM DTT
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.321 |
| 5C5O Structure of SARS-3CL protease complex with a phenyl-beta-alanyl (S,R)-N-decalin type inhibitor 提交 2015-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
|
突变：R188I | SDJ (2S)-3-(1H-imidazol-5-yl)-2-({[(3S,4aR,8aS)-2-(N-phenyl-beta-alanyl)decahydroisoquinolin-3-yl]methyl}amino)propanal × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10% (w/v) PEG 20000, 100mM MES, 5mM DTT
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.271 |
| 5C5O Structure of SARS-3CL protease complex with a phenyl-beta-alanyl (S,R)-N-decalin type inhibitor 提交 2015-06-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
3241–3546（306 aa）
|
突变：R188I | SDJ (2S)-3-(1H-imidazol-5-yl)-2-({[(3S,4aR,8aS)-2-(N-phenyl-beta-alanyl)decahydroisoquinolin-3-yl]methyl}amino)propanal × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10% (w/v) PEG 20000, 100mM MES, 5mM DTT
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.271 |
| 5C5O Structure of SARS-3CL protease complex with a phenyl-beta-alanyl (S,R)-N-decalin type inhibitor 提交 2015-06-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
链 B
3241–3546（306 aa）
|
突变：R188I 突变：R188I | SDJ (2S)-3-(1H-imidazol-5-yl)-2-({[(3S,4aR,8aS)-2-(N-phenyl-beta-alanyl)decahydroisoquinolin-3-yl]methyl}amino)propanal × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；10% (w/v) PEG 20000, 100mM MES, 5mM DTT
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.271 |
| 5C8S Crystal structure of the SARS coronavirus nsp14-nsp10 complex with functional ligands SAH and GpppA 提交 2015-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4231–4369（139 aa）
链 B
5903–6429（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 G3A GUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；15% (v/v) tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0, and 2% (w/v) polyethylene glycol 3350
|
分辨率 3.33 Å R-free 0.259 |
| 5C8S Crystal structure of the SARS coronavirus nsp14-nsp10 complex with functional ligands SAH and GpppA 提交 2015-06-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
4231–4369（139 aa）
链 D
5903–6429（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 G3A GUANOSINE-P3-ADENOSINE-5',5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289 K；15% (v/v) tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0, and 2% (w/v) polyethylene glycol 3350
|
分辨率 3.33 Å R-free 0.259 |
| 5C8T Crystal structure of the SARS coronavirus nsp14-nsp10 complex with functional ligand SAM 提交 2015-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4231–4369（139 aa）
链 B
5903–6429（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；15% (v/v) tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0, and 2% (w/v) polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.265 |
| 5C8T Crystal structure of the SARS coronavirus nsp14-nsp10 complex with functional ligand SAM 提交 2015-06-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
4231–4369（139 aa）
链 D
5903–6429（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；15% (v/v) tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0, and 2% (w/v) polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.265 |
| 5C8U Crystal structure of the SARS coronavirus nsp14-nsp10 complex 提交 2015-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4231–4369（139 aa）
链 B
5903–6429（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；15% (v/v) tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0, 2% (w/v) polyethylene glycol 3350
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.266 |
| 5C8U Crystal structure of the SARS coronavirus nsp14-nsp10 complex 提交 2015-06-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
4231–4369（139 aa）
链 D
5903–6429（527 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；15% (v/v) tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0, 2% (w/v) polyethylene glycol 3350
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.266 |
| 5E6J Structure of SARS PLpro bound to a Lys48-linked di-ubiquitin activity based probe 提交 2015-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1541–1856（316 aa）
片段：UNP Residues 1541-1856
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；285 K；0.1 M MES, 0.1 M lithium acetate, 17% PEG 6000
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.264 |
| 5E6J Structure of SARS PLpro bound to a Lys48-linked di-ubiquitin activity based probe 提交 2015-10-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
1541–1856（316 aa）
片段：UNP Residues 1541-1856
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；285 K；0.1 M MES, 0.1 M lithium acetate, 17% PEG 6000
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.264 |
| 5F22 C-terminal domain of SARS-CoV nsp8 complex with nsp7 提交 2015-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3989–4117（129 aa）
片段：UNP residues 3989-4117
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2M magnesium acetate,
PEG 3350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.252 |
| 5N19 Structure of SARS coronavirus main protease in complex with the alpha-ketoamide (S)-N-benzyl-3-((S)-2-cinnamamido-3-phenylpropanamido)-2-oxo-4-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)butanamide 提交 2017-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
|
未记录 | D03 (S)-N-benzyl-3-((S)-2-cinnamamido-3-phenylpropanamido)-2-oxo-4-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)butanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；6 - 8% polyethylene glycol 6000, 0.1 M MES, pH 6.0
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.200 |
| 5N5O Structure of SARS coronavirus main protease in complex with the alpha-ketoamide (S)-N-benzyl-3-((S)-2-cinnamamido-3-cyclopropylpropanamido)-2-oxo-4-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)butanamide (Cinnamoyl-cyclopropylalanine-GlnLactam-CO-CO-NH-benzyl) 提交 2017-02-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
|
未记录 | 8O5 (2~{R},3~{S})-3-[[(2~{S})-3-cyclopropyl-2-[[(~{E})-3-phenylprop-2-enoyl]amino]propanoyl]amino]-2-oxidanyl-4-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]-~{N}-(phenylmethyl)butanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；6 - 8% polyethylene glycol 6000, 0.1 M MES, pH 6.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 5TL6 Crystal structure of SARS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2016-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1541–1855（315 aa）
片段：UNP residues 1541-1855
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-tris [pH 6.5], 22% PEG 3350, supplemented with 30% (v/v) glycerol additive in a 1:5 dilution
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.250 |
| 5TL6 Crystal structure of SARS-CoV papain-like protease in complex with the C-terminal domain of human ISG15 提交 2016-10-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1541–1855（315 aa）
片段：UNP residues 1541-1855
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M lithium sulfate, 0.1 M Bis-tris [pH 6.5], 22% PEG 3350, supplemented with 30% (v/v) glycerol additive in a 1:5 dilution
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.250 |
| 5TL7 Crystal structure of SARS-CoV papain-like protease in complex with C-terminal domain mouse ISG15 提交 2016-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1541–1855（315 aa）
片段：UNP residues 1541-1855
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；65% (v/v) MPD, 0.1 M Tris [pH 8.0], supplemented with 30% (w/v) Trimethylamine N-oxide dihydrate additive in a 1:5 dilution
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.267 |
| 5TL7 Crystal structure of SARS-CoV papain-like protease in complex with C-terminal domain mouse ISG15 提交 2016-10-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1541–1855（315 aa）
片段：UNP residues 1541-1855
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；65% (v/v) MPD, 0.1 M Tris [pH 8.0], supplemented with 30% (w/v) Trimethylamine N-oxide dihydrate additive in a 1:5 dilution
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.267 |
| 6JYT Delicate structural coordination of the Severe Acute Respiratory Syndrome coronavirus Nsp13 upon ATP hydrolysis 提交 2019-04-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5302–5902（601 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；12% w/v polyethylene glycol 20000, 2M ammonium sulfate, 0.1M MES monohydrate pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.292 |
| 6JYT Delicate structural coordination of the Severe Acute Respiratory Syndrome coronavirus Nsp13 upon ATP hydrolysis 提交 2019-04-28 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
5302–5902（601 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；12% w/v polyethylene glycol 20000, 2M ammonium sulfate, 0.1M MES monohydrate pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.292 |
| 6NUR SARS-Coronavirus NSP12 bound to NSP7 and NSP8 co-factors 提交 2019-02-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
4370–5300（931 aa）
片段：UNP residues 4370-5300
链 C
3837–3919（83 aa）
片段：UNP residues 3837-3919
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；n-dodecyl-beta-D-maltopyranoside was added just prior to spotting samples onto holey EM grids.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6NUS SARS-Coronavirus NSP12 bound to NSP8 co-factor 提交 2019-02-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4370–5300（931 aa）
片段：UNP residues 4370-5300
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；n-dodecyl-beta-D-maltopyranoside was added just prior to spotting samples onto holey EM grids.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7LCP N-terminal finger stabilizes feline drug GC376 in coronavirus 3CL protease 提交 2021-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
|
未记录 | UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；295 K；7% PEG 8000, 1 mM MES pH 6.0, 1mM DTT, 3% ethylene glycol and 3% DMSO
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |
| 7LCQ N-terminal finger stabilizes feline drug GC376 in coronavirus 3CL protease 提交 2021-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 UED N~2~-[(benzyloxy)carbonyl]-N-{(2S)-1-hydroxy-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl}-L-leucinamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；295 K；7% PEG 8000, 1 mM MES pH 6.0, 1mM DTT, 3% ethylene glycol and 3% DMSO
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.223 |
| 8C0G SARS-CoV nsp16-nsp10 complexed with N7-GTP 提交 2022-12-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
6776–7067（292 aa）
链 B
4240–4361（122 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 SRC [[(2~{R},3~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-7-methyl-6-oxidanylidene-1,8-dihydropurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 NA SODIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；67 MM M CHES, 0.99 M MGCL2-HEXAYDRATE, 33 MM TRIS-HCL, 8.3% (V/V) PEG 8000
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.263 |
| 8CB3 SARS-CoV Macro domain complexed with 3-(N-morpholino)propanesulfonic acid 提交 2023-01-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1000–1173（174 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M Imidazole, 0.9 M NaCitrate, pH 7.9
0.2 M MOPS
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.203 |
| 8CB3 SARS-CoV Macro domain complexed with 3-(N-morpholino)propanesulfonic acid 提交 2023-01-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1000–1173（174 aa）
|
未记录 | MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M Imidazole, 0.9 M NaCitrate, pH 7.9
0.2 M MOPS
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.203 |
| 8CB3 SARS-CoV Macro domain complexed with 3-(N-morpholino)propanesulfonic acid 提交 2023-01-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1000–1173（174 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1 M Imidazole, 0.9 M NaCitrate, pH 7.9
0.2 M MOPS
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.203 |
| 8YKK Crystal structure of SARS main protease in complex with X77 提交 2024-03-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3242–3539（298 aa）
|
未记录 | X77 N-(4-tert-butylphenyl)-N-[(1R)-2-(cyclohexylamino)-2-oxo-1-(pyridin-3-yl)ethyl]-1H-imidazole-4-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Hepes pH7.5, 10% PEG8000, 8% Ethylene glycol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.248 |
| 9LZQ Crystal structure of SARS main protease in complex with Ibuzatrelvir Pomotrelvir 提交 2025-02-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3242–3540（299 aa）
链 B
3242–3540（299 aa）
|
未记录 | ZQB Pomotrelvir bound form × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Hepes pH7.5, 10% PEG8000, 8% Ethylene glycol
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.248 |
| 9MBV Crystal structure of SARS main protease complex with CCF0058981 提交 2025-03-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3242–3540（299 aa）
链 B
3242–3540（299 aa）
|
未记录 | XIU 2-(benzotriazol-1-yl)-~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-~{N}-[4-(1~{H}-imidazol-5-yl)phenyl]ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.12M-0.21M Na2SO4, 20%-24% PEG3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.244 |
| 9XG4 The crystal structure of SARS-CoV-1 Main protease in complex with inhibitor FD2-21 提交 2025-10-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3241–3546（306 aa）
|
未记录 | A1EZ7 7-(5-azanylpyridin-3-yl)-2-(2-chlorophenyl)-5,7-diazaspiro[3.4]octane-6,8-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；1.1 M Ammonium tartrate dibasic pH 7.0
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.218 |