当前蛋白身份:P11684 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7VF3 Plexin B1 extracellular fragment in complex with lasso-grafted PB1m7 peptide 提交 2021-09-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 21–89(69 aa)
链 B 25–91(67 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;293 K;0.1M sodium acetate buffer, 20% PEG 400, 0.2M Calcium acetate
分辨率 2.29 Å R-free 0.226
7VF3 Plexin B1 extracellular fragment in complex with lasso-grafted PB1m7 peptide 提交 2021-09-10 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 21–89(69 aa)
链 D 25–91(67 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;293 K;0.1M sodium acetate buffer, 20% PEG 400, 0.2M Calcium acetate
分辨率 2.29 Å R-free 0.226
7VG7 Plexin B1 extracellular fragment in complex with lasso-grafted PB1m6A9 peptide 提交 2021-09-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 21–89(69 aa)
链 B 25–91(67 aa)
突变:A21S 突变:A21S PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1M MES or HEPES, 14-16% PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.243