当前蛋白身份：P11926
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1D7K CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ORNITHINE DECARBOXYLASE AT 2.1 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1999-10-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
7–427（421 aa）
链 B
7–427（421 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；289 K；20% PEG 3350, 0.2M NaCl, 5mM DTT, 0.1M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 16K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.288 |
| 2ON3 A structural insight into the inhibition of human and Leishmania donovani ornithine decarboxylases by 3-aminooxy-1-aminopropane 提交 2007-01-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–461（461 aa）
链 B
1–461（461 aa）
|
未记录 | XAP 3-AMINOOXY-1-AMINOPROPANE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；288.15 K；25% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, 2 mM APA, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 288.15K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.293 |
| 2OO0 A structural insight into the inhibition of human and Leishmania donovani ornithine decarboxylases by 3-aminooxy-1-aminopropane 提交 2007-01-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–461（461 aa）
链 B
1–461（461 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 3 PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 XAP 3-AMINOOXY-1-AMINOPROPANE × 2 N2P PENTANE-1,5-DIAMINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；288.15 K；25% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate, O.1M MES, 2mM XAP, 0.3 % cadaverine, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 288.15K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.213 |
| 4ZGY STRUCTURE of HUMAN ORNITHINE DECARBOXYLASE IN COMPLEX WITH A C-TERMINAL FRAGMENT OF ANTIZYME 提交 2015-04-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–421（420 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-421
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；100MM MAGNESIUM ACETATE, 50MM MES PH
5.6, 20% 2-METHYL-2, 4-PENTANEDIOL(MPD), VAPOR DIFFUSION, HANGING
DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.256 |
| 5BWA Crystal structure of ODC-PLP-AZ1 ternary complex 提交 2015-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–461（461 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8.5；288 K；0.2 M di-Ammonium tartrate, 20% PEG 3350
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.289 |
| 7S3F Structure of cofactor pyridoxal 5-phosphate bound human ornithine decarboxylase in complex with its inhibitor 1-amino-oxy-3-aminopropane 提交 2021-09-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–424（424 aa）
链 B
1–424（424 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 XAP 3-AMINOOXY-1-AMINOPROPANE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；2% tacsimate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH
5.6, and 16% w/v polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.208 |
| 7S3G Structure of cofactor pyridoxal 5-phosphate bound human ornithine decarboxylase in complex with citrate at the catalytic center 提交 2021-09-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–424（424 aa）
链 B
1–424（424 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 CIT CITRIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；100 mM tri-sodium citrate pH 5.0 and 30% polyethylene glycol monomethyl
ether 550
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.198 |
| 7U6P Structure of an intellectual disability-associated ornithine decarboxylase variant G84R 提交 2022-03-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–424（424 aa）
链 B
1–424（424 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；0.2 M sodium acetate trihydrate pH 7.0, 20% w/v polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.225 |
| 7U6U Structure of an intellectual disability-associated ornithine decarboxylase variant G84R in complex with PLP 提交 2022-03-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–424（424 aa）
链 B
1–424（424 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M sodium acetate trihydrate pH 7.0, 20% w/v polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.204 |
| 9B8M Crystal structure of ornithine decarboxylase in complex with a novel inhibitor 提交 2024-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–422（422 aa）
链 B
1–422（422 aa）
|
未记录 | A1AQO O-{[(3R)-pyrrolidin-3-yl]methyl}hydroxylamine × 2 PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Not available
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.223 |
| 9B8N Crystal structure of ornithine decarboxylase in complex with a novel inhibitor (10-S) 提交 2024-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–424（424 aa）
链 B
1–424（424 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 A1AQP O-{[(3S)-pyrrolidin-3-yl]methyl}hydroxylamine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；not available
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |