当前蛋白身份：P12499
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1E28 Nonstandard peptide binding of HLA-B*5101 complexed with HIV immunodominant epitope KM2(TAFTIPSI) 提交 2000-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
282–289（8 aa）
片段：EXTRACELLULAR RESIDUES 282-289
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.253 |
| 1HXW HIV-1 PROTEASE DIMER COMPLEXED WITH A-84538 提交 1997-01-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
24–122（99 aa）
链 B
24–122（99 aa）
|
未记录 | RIT RITONAVIR × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1P7Q Crystal Structure of HLA-A2 Bound to LIR-1, a Host and Viral MHC Receptor 提交 2003-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
463–471（9 aa）
片段：residue 463-471
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Tris, L-Cysteine, Triton X-100, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.309 |
| 1PRO HIV-1 PROTEASE DIMER COMPLEXED WITH A-98881 提交 1995-07-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
24–122（99 aa）
链 B
24–122（99 aa）
|
未记录 | A88 (5R,6R)-2,4-BIS-(4-HYDROXY-3-METHOXYBENZYL)-1,5-DIBENZYL-3-OXO-6-HYDROXY-1,2,4-TRIAZACYCLOHEPTANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.310 |
| 1Q94 Structures of HLA-A*1101 in complex with immunodominant nonamer and decamer HIV-1 epitopes clearly reveal the presence of a middle anchor residue 提交 2003-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
745–753（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；PEG 4000,sodium acetate,sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.272 |
| 1Q94 Structures of HLA-A*1101 in complex with immunodominant nonamer and decamer HIV-1 epitopes clearly reveal the presence of a middle anchor residue 提交 2003-08-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
745–753（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；PEG 4000,sodium acetate,sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.272 |
| 1VIJ HIV-1 PROTEASE COMPLEXED WITH THE INHIBITOR HOE/BAY 793 HEXAGONAL FORM 提交 1997-05-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
56–154（99 aa）
链 B
56–154（99 aa）
|
未记录 | BAY N-(1-BENZYL-2,3-DIHYDROXY-4-{3-METHYL-2-[2-(2-METHYL-PROPANE-2-SULFONYLMETHYL)-3-NAPHTHALEN-1-YL-PROPIONYLAMINO]-BUTYRYLAMINO}-5-PHENYL-PENTYL)-3-METHYL-2-[2-(2-METHYL-PROPANE-2-SULFONYLMETHYL)-3-NAPHTHALEN-1-YL-PROPIONYLAMINO]-BUTYRAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å |
| 1VIK HIV-1 PROTEASE COMPLEXED WITH THE INHIBITOR HOE/BAY 793 ORTHORHOMBIC FORM 提交 1997-05-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
56–154（99 aa）
链 B
56–154（99 aa）
|
未记录 | BAY N-(1-BENZYL-2,3-DIHYDROXY-4-{3-METHYL-2-[2-(2-METHYL-PROPANE-2-SULFONYLMETHYL)-3-NAPHTHALEN-1-YL-PROPIONYLAMINO]-BUTYRYLAMINO}-5-PHENYL-PENTYL)-3-METHYL-2-[2-(2-METHYL-PROPANE-2-SULFONYLMETHYL)-3-NAPHTHALEN-1-YL-PROPIONYLAMINO]-BUTYRAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å |
| 3W39 Crystal structure of HLA-B*5201 in complexed with HIV immunodominant epitope (TAFTIPSI) 提交 2012-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
716–723（8 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M sodium acetate, 0.1M Bis Tris propane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.347 |
| 3W39 Crystal structure of HLA-B*5201 in complexed with HIV immunodominant epitope (TAFTIPSI) 提交 2012-12-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
716–723（8 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M sodium acetate, 0.1M Bis Tris propane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.347 |
| 4EJ8 Apo HIV Protease (PR) dimer in closed form with fragment 1F1 in the outside/top of flap 提交 2012-04-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
490–588（99 aa）
片段：UNP residues 490-588
链 B
490–588（99 aa）
片段：UNP residues 490-588
|
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 1F1 1H-indole-6-carboxylic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；0.1 M Tris, pH 7.5, 28% PEG4000, 10% DMSO, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.243 |
| 4EJD HIV Protease (PR) dimer in closed form with pepstatin in active site and fragment 1F1 in the outside/top of flap 提交 2012-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
490–588（99 aa）
片段：UNP residues 490-588
链 B
490–588（99 aa）
片段：UNP residues 490-588
|
未记录 | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 3 1F1 1H-indole-6-carboxylic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；298 K；0.2 M potassium bromide, 0.2 M potassium thiocyanate, 3% PGA-LM, 3% MPD, 10% DMSO, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.176 |
| 4EJK HIV Protease (PR) dimer in closed form with pepstatin in active site and fragment 1F1-N in the outside/top of flap 提交 2012-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
490–588（99 aa）
片段：UNP residues 490-588
链 B
490–588（99 aa）
片段：UNP residues 490-588
|
未记录 | IOP INDOLYLPROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；298 K；1.0 M sodium formate, 10% DMSO, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.252 |
| 4EJL Apo HIV Protease (PR) dimer in closed form with fragment 1F1-N in the outside/top of flap 提交 2012-04-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
490–588（99 aa）
片段：UNP residues 490-588
链 B
490–588（99 aa）
片段：UNP residues 490-588
|
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 4 IOP INDOLYLPROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；0.8 M sodium formate, 15% PEG4000, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.245 |
| 4K4P TL-3 inhibited Trp6Ala HIV Protease 提交 2013-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
突变：W6A 突变：W6A | NO3 NITRATE ION × 1 3TL benzyl [(1S,4S,7S,8R,9R,10S,13S,16S)-7,10-dibenzyl-8,9-dihydroxy-1,16-dimethyl-4,13-bis(1-methylethyl)-2,5,12,15,18-pentaoxo-20-phenyl-19-oxa-3,6,11,14,17-pentaazaicos-1-yl]carbamate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；0.1M NaOAc pH 5.0, 2.5M NaNO3, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.234 |
| 4K4Q TL-3 inhibited Trp6Ala HIV Protease with 3-bromo-2,6-dimethoxybenzoic acid bound in flap site 提交 2013-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
突变：W6A 突变：W6A | NO3 NITRATE ION × 6 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 3TL benzyl [(1S,4S,7S,8R,9R,10S,13S,16S)-7,10-dibenzyl-8,9-dihydroxy-1,16-dimethyl-4,13-bis(1-methylethyl)-2,5,12,15,18-pentaoxo-20-phenyl-19-oxa-3,6,11,14,17-pentaazaicos-1-yl]carbamate × 1 06B 3-bromo-2,6-dimethoxybenzoic acid × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；0.1M NaOAc pH 5.0, 2.5M NaNO3, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 4K4R TL-3 inhibited Trp6Ala HIV Protease with 1-bromo-2-napthoic acid bound in exosite 提交 2013-04-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
链 B
1–99（99 aa）
|
突变：W6A 突变：W6A | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 27B 1-bromonaphthalene-2-carboxylic acid × 2 NO3 NITRATE ION × 5 3TL benzyl [(1S,4S,7S,8R,9R,10S,13S,16S)-7,10-dibenzyl-8,9-dihydroxy-1,16-dimethyl-4,13-bis(1-methylethyl)-2,5,12,15,18-pentaoxo-20-phenyl-19-oxa-3,6,11,14,17-pentaazaicos-1-yl]carbamate × 1 BR BROMIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；0.1M NaOAc pH 5.0, 2.5M NaNO3, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.235 |
| 9K2R Human T cell receptor (TRAV24*01/TRBV27*01) in complex with HLA-C*1202 and IY11 peptide 提交 2024-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
897–907（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH7.0, 1.6M ammonium sulfate, 0.2M sodium thiocyanate
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.233 |
| 9K2R Human T cell receptor (TRAV24*01/TRBV27*01) in complex with HLA-C*1202 and IY11 peptide 提交 2024-10-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
897–907（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH7.0, 1.6M ammonium sulfate, 0.2M sodium thiocyanate
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.233 |
| 9K2R Human T cell receptor (TRAV24*01/TRBV27*01) in complex with HLA-C*1202 and IY11 peptide 提交 2024-10-18 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 I
897–907（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH7.0, 1.6M ammonium sulfate, 0.2M sodium thiocyanate
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.233 |
| 9K2S Killer cell immunoglobulin-like receptor 2DL2 in complex with HLA-C*1202 and IY10 peptide 提交 2024-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
897–906（10 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M K/Na tartrate, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.299 |
| 9K2T Crystal structure of HLA-C*1202 in complex with IY10 peptide 提交 2024-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
897–906（10 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.243 |