当前蛋白身份:P13285 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1UXS CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*2705 COMPLEXED WITH THE LATENT MEMBRANE PROTEIN 2 PEPTIDE (LMP2)OF EPSTEIN-BARR VIRUS 提交 2004-03-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 236–244(9 aa) 片段:TRANSMEMBRANE DOMAIN, RESIDUES 236-244
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;0.1M TRIS, PH 7.5, 15% PEG8000
分辨率 1.55 Å R-free 0.177
1UXW CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*2709 COMPLEXED WITH THE LATENT MEMBRANE PROTEIN 2 PEPTIDE (LMP2) OF EPSTEIN-BARR VIRUS 提交 2004-03-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 236–244(9 aa) 片段:TRANSMEMBRANE DOMAIN, RESIDUES 236-244
未记录 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;0.1M TRIS, PH 8.5, 21% PEG8000
分辨率 1.71 Å R-free 0.190
2JO9 Mouse Itch 3rd WW domain complex with the Epstein-Barr virus latent membrane protein 2A derived peptide EEPPPPYED 提交 2007-03-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 54–62(9 aa) 片段:SEQUENCE DATABASE RESIDUES 54-62
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.2;285 K;离子强度(mmCIF原始值)0.4;压力 ambient
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] WW3, 3.0 mM Ligand, 20 mM Sodium Phosphate, 100 mM NaCl, 0.02% v/v Sodium Azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] WW3, 3.0 mM Ligand, 20 mM Sodium Phosphate, 100 mM NaCl, 0.02% v/v Sodium Azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM WW3, 3.0 mM Ligand, 20 mM Sodium Phosphate, 100 mM NaCl, 0.02% v/v Sodium Azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3BVN High resolution crystal structure of HLA-B*1402 in complex with the latent membrane protein 2 peptide (LMP2) of Epstein-Barr virus 提交 2008-01-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 236–244(9 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;20-22%(w/v) PEG 20 000, 0.1 M HEPES buffer pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.55 Å R-free 0.268
3BVN High resolution crystal structure of HLA-B*1402 in complex with the latent membrane protein 2 peptide (LMP2) of Epstein-Barr virus 提交 2008-01-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 236–244(9 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;20-22%(w/v) PEG 20 000, 0.1 M HEPES buffer pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.55 Å R-free 0.268
3REW Crystal structure of an lmp2a-derived peptide bound to human class i mhc hla-a2 提交 2011-04-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 426–434(9 aa) 片段:LATENT MEMBRANE PROTEIN 2 (unp residues 426-434)
未记录 IOD IODIDE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;22% PEG 3350, 0.2M AMMONIUM IODIDE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.239
3REW Crystal structure of an lmp2a-derived peptide bound to human class i mhc hla-a2 提交 2011-04-05 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 426–434(9 aa) 片段:LATENT MEMBRANE PROTEIN 2 (unp residues 426-434)
未记录 IOD IODIDE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;22% PEG 3350, 0.2M AMMONIUM IODIDE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
分辨率 1.90 Å R-free 0.239