当前蛋白身份:P13285
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1UXS CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*2705 COMPLEXED WITH THE LATENT MEMBRANE PROTEIN 2 PEPTIDE (LMP2)OF EPSTEIN-BARR VIRUS 提交 2004-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
236–244(9 aa)
片段:TRANSMEMBRANE DOMAIN, RESIDUES 236-244
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5;0.1M TRIS, PH 7.5, 15% PEG8000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.177 |
| 1UXW CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-B*2709 COMPLEXED WITH THE LATENT MEMBRANE PROTEIN 2 PEPTIDE (LMP2) OF EPSTEIN-BARR VIRUS 提交 2004-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
236–244(9 aa)
片段:TRANSMEMBRANE DOMAIN, RESIDUES 236-244
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5;0.1M TRIS, PH 8.5, 21% PEG8000
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.190 |
| 2JO9 Mouse Itch 3rd WW domain complex with the Epstein-Barr virus latent membrane protein 2A derived peptide EEPPPPYED 提交 2007-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
54–62(9 aa)
片段:SEQUENCE DATABASE RESIDUES 54-62
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2;285 K;离子强度(mmCIF原始值)0.4;压力 ambient
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 15N] WW3, 3.0 mM Ligand, 20 mM Sodium Phosphate, 100 mM NaCl, 0.02% v/v Sodium Azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] WW3, 3.0 mM Ligand, 20 mM Sodium Phosphate, 100 mM NaCl, 0.02% v/v Sodium Azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.0 mM WW3, 3.0 mM Ligand, 20 mM Sodium Phosphate, 100 mM NaCl, 0.02% v/v Sodium Azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3BVN High resolution crystal structure of HLA-B*1402 in complex with the latent membrane protein 2 peptide (LMP2) of Epstein-Barr virus 提交 2008-01-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
236–244(9 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;20-22%(w/v) PEG 20 000, 0.1 M HEPES buffer pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.268 |
| 3BVN High resolution crystal structure of HLA-B*1402 in complex with the latent membrane protein 2 peptide (LMP2) of Epstein-Barr virus 提交 2008-01-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
236–244(9 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;20-22%(w/v) PEG 20 000, 0.1 M HEPES buffer pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.268 |
| 3REW Crystal structure of an lmp2a-derived peptide bound to human class i mhc hla-a2 提交 2011-04-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
426–434(9 aa)
片段:LATENT MEMBRANE PROTEIN 2 (unp residues 426-434)
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;22% PEG 3350, 0.2M AMMONIUM IODIDE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 3REW Crystal structure of an lmp2a-derived peptide bound to human class i mhc hla-a2 提交 2011-04-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
426–434(9 aa)
片段:LATENT MEMBRANE PROTEIN 2 (unp residues 426-434)
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;22% PEG 3350, 0.2M AMMONIUM IODIDE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |