当前蛋白身份:P13650 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1C9U CRYSTAL STRUCTURE OF THE SOLUBLE QUINOPROTEIN GLUCOSE DEHYDROGENASE IN COMPLEX WITH PQQ 提交 1999-08-03 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–478(454 aa)
链 B 25–478(454 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 6 PQQ PYRROLOQUINOLINE QUINONE × 2 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.2;293 K;PEG 6000, SODIUM CHLORIDE, CALCIUM CHLORIDE, TRIS, GLYCINE, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.286
1CQ1 Soluble Quinoprotein Glucose Dehydrogenase from Acinetobacter Calcoaceticus in Complex with PQQH2 and Glucose 提交 1999-08-04 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–478(454 aa)
链 B 25–478(454 aa)
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 6 PQQ PYRROLOQUINOLINE QUINONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.2;293 K;PEG 6000, SODIUM CHLORIDE, CALCIUM CHLORIDE, TRIS, GLYCINE, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
1CRU SOLUBLE QUINOPROTEIN GLUCOSE DEHYDROGENASE FROM ACINETOBACTER CALCOACETICUS IN COMPLEX WITH PQQ AND METHYLHYDRAZINE 提交 1999-08-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–478(454 aa)
链 B 25–478(454 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 6 PQQ PYRROLOQUINOLINE QUINONE × 2 HDN METHYLHYDRAZINE × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.2;293 K;PEG 6000, SODIUM CHLORIDE, CALCIUM CHLORIDE, TRIS, GLYCINE, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.195
1QBI SOLUBLE QUINOPROTEIN GLUCOSE DEHYDROGENASE FROM ACINETOBACTER CALCOACETICUS 提交 1999-04-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–478(454 aa)
链 B 25–478(454 aa)
未记录 PT PLATINUM (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.2;293 K;PEG 6000, SODIUM CHLORIDE, CALCIUM CHLORIDE, TRIS, GLYCINE, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.72 Å R-free 0.208
5MIN Apo form of the soluble PQQ-dependent Glucose Dehydrogenase from Acinetobacter calcoaceticus 提交 2016-11-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–477(453 aa)
链 B 25–477(453 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;PEG 4000 (12%) 100 mM TRIS pH 8.5
分辨率 1.76 Å R-free 0.214
8RE0 Soluble glucose dehydrogenase from acinetobacter calcoaceticus - double mutant pH8 提交 2023-12-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–478(454 aa)
链 B 25–478(454 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 6 A1H0D 3-(3,5-dicarboxy-1~{H}-pyrrol-2-yl)pyridine-2,4,6-tricarboxylic acid × 2 LI LITHIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;20% PEG 6000, 100mM TRIS pH8, 200 mM LiCl2
分辨率 1.56 Å R-free 0.183
8RFK Soluble glucose dehydrogenase from acinetobacter calcoaceticus - single mutant pH8 提交 2023-12-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–478(454 aa)
链 B 25–478(454 aa)
突变:D143E,Y343F 突变:D143E,Y343F CA CALCIUM ION × 6 A1H0D 3-(3,5-dicarboxy-1~{H}-pyrrol-2-yl)pyridine-2,4,6-tricarboxylic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;300 K;PEG 6000, TRIS, Lithium chloride
分辨率 1.56 Å R-free 0.185
8RG1 Soluble glucose dehydrogenase from acinetobacter calcoaceticus - wild type pH8 提交 2023-12-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 25–478(454 aa)
链 B 25–478(454 aa)
未记录 A1H0D 3-(3,5-dicarboxy-1~{H}-pyrrol-2-yl)pyridine-2,4,6-tricarboxylic acid × 2 CA CALCIUM ION × 6 LI LITHIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;PEG 6000, 100 mM TRIS pH8, 2 mM ZnCl2
分辨率 1.19 Å R-free 0.173