当前蛋白身份：P14941
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BXZ CRYSTAL STRUCTURE OF A THERMOPHILIC ALCOHOL DEHYDROGENASE SUBSTRATE COMPLEX FROM THERMOANAEROBACTER BROCKII 提交 1998-10-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
片段：NUCLEOTIDE-BINDING DOMAIN, CATALYTIC DOMAIN
链 B
1–352（352 aa）
片段：NUCLEOTIDE-BINDING DOMAIN, CATALYTIC DOMAIN
链 C
1–352（352 aa）
片段：NUCLEOTIDE-BINDING DOMAIN, CATALYTIC DOMAIN
链 D
1–352（352 aa）
片段：NUCLEOTIDE-BINDING DOMAIN, CATALYTIC DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 SBT 2-BUTANOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.8；pH 5.8
|
分辨率 2.99 Å R-free 0.264 |
| 1YKF NADP-DEPENDENT ALCOHOL DEHYDROGENASE FROM THERMOANAEROBIUM BROCKII 提交 1996-03-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.2；pH 8.2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.267 |
| 2NVB Contribution of Pro275 to the Thermostability of the Alcohol Dehydrogenases (ADHs) 提交 2006-11-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
突变：P275D 突变：P275D 突变：P275D 突变：P275D | ZN ZINC ION × 4 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；298 K；16%(w/v) PEG 4000, 50mM NaCl, 50mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 8.3
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.278 |
| 2NVB Contribution of Pro275 to the Thermostability of the Alcohol Dehydrogenases (ADHs) 提交 2006-11-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
|
突变：P275D 突变：P275D | ZN ZINC ION × 2 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；298 K；16%(w/v) PEG 4000, 50mM NaCl, 50mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 8.3
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.278 |
| 2NVB Contribution of Pro275 to the Thermostability of the Alcohol Dehydrogenases (ADHs) 提交 2006-11-12 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
突变：P275D 突变：P275D | ZN ZINC ION × 2 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；298 K；16%(w/v) PEG 4000, 50mM NaCl, 50mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 8.3
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.278 |
| 3FPC Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-294 of T. brockii ADH by E. histolytica ADH 提交 2009-01-05 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–152（152 aa）
链 A
295–352（58 aa）
链 B
1–152（152 aa）
链 B
295–352（58 aa）
链 C
1–152（152 aa）
链 C
295–352（58 aa）
链 D
1–152（152 aa）
链 D
295–352（58 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CAC CACODYLATE ION × 4 OXY OXYGEN MOLECULE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 NO3 NITRATE ION × 2 IMD IMIDAZOLE × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；8mg/mL protein [25mM Tris-HCl, 50mM NaCl, 0.1mM DTT, 50mM ZnCl2 (pH=7.5)] was mixed with 0.001 ml of reservoir solution [16% (w/v) PEG 8000, 200mM magnesium acetate tetrahydrate, 100mM Cacodylate buffer (pH 6.5)], vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.155 |
| 3FPL Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-295 of C. beijerinckii ADH by T. brockii ADH 提交 2009-01-05 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
153–295（143 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CAC CACODYLATE ION × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；298 K；Single crystals of apo-22(CTC) were obtained by the microbatch method under oil at 18 C, using the IMPAX 1-5 robot. The apo-22(CTC) (10mg/mL) was crystallized in a mixture containing 100mM ammonium acetate, 15% (w/v) PEG 4000, 25mM NaCl, 50mM DTT, 25mM ZnCl2 and 50mM tri-citrate dihydrate (pH sodium 5.6), Microbatch, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.172 |
| 3FSR Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-295 of T. brockii ADH by C. beijerinckii ADH 提交 2009-01-11 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–152（152 aa）
链 A
296–352（57 aa）
链 B
1–152（152 aa）
链 B
296–352（57 aa）
链 C
1–152（152 aa）
链 C
296–352（57 aa）
链 D
1–152（152 aa）
链 D
296–352（57 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；8mg/mL protein [25mM Tris-HCl, 50mM NaCl, 0.1mM DTT, 50mM ZnCl2 (pH=7.5)] was mixed with 0.001ml of reservoir solution [16% (w/v) PEG 8000, 200mM magnesium acetate tetrahydrate, 100mM Cacodylate buffer (pH 6.5)], vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 3FTN Q165E/S254K Double Mutant Chimera of alcohol dehydrogenase by exchange of the cofactor binding domain res 153-295 of T. brockii ADH by C. beijerinckii ADH 提交 2009-01-13 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–152（152 aa）
链 A
296–352（57 aa）
链 B
1–152（152 aa）
链 B
296–352（57 aa）
链 C
1–152（152 aa）
链 C
296–352（57 aa）
链 D
1–152（152 aa）
链 D
296–352（57 aa）
|
突变：Q165E, S254K 突变：Q165E, S254K 突变：Q165E, S254K 突变：Q165E, S254K 突变：Q165E, S254K 突变：Q165E, S254K 突变：Q165E, S254K 突变：Q165E, S254K | ZN ZINC ION × 4 ACT ACETATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 CL CHLORIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；8 mg/mL protein, 25 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 0.1 mM DTT, 50 mM ZnCl2 (pH=7.5)] was mixed with 1 microliter of reservoir solution [16% (w/v) PEG8K, 200 mM magnesium acetate tetrahydrate, 100 mM Cacodylate buffer (pH 6.5), vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.228 |
| 6SDM NADH-dependent variant of TBADH 提交 2019-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；20% w/v PEG 3K, sodium citrate pH 5.5
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.238 |
| 7F3P Crystal structure of a nadp-dependent alcohol dehydrogenase mutant in apo form 提交 2021-06-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
突变：P84S, I86L 突变：P84S, I86L 突变：P84S, I86L 突变：P84S, I86L | ZN ZINC ION × 4 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, NH4, citrate
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 7UTC Crystal structure of secondary alcohol dehydrogenases from the Thermoanaerobacter ethanolicus with NADP and transition-state analogue inhibitor DMSO 提交 2022-04-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
突变：C295A 突变：C295A 突变：C295A 突变：C295A | ZN ZINC ION × 4 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 35 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.6 M KCl, 12% PEG 3350, 50 mM HEPES-K buffer, pH 7.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.227 |
| 7UUT Ternary complex crystal structure of secondary alcohol dehydrogenases from the Thermoanaerobacter ethanolicus mutants C295A and I86A provides better understanding of catalytic mechanism 提交 2022-04-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
突变：I86A 突变：I86A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I86A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I86A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 4 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 2RP (2R)-pentan-2-ol × 4 K POTASSIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.6 M KCl, 12% PEG 3350, 50 mM HEPES buffer pH 7.5
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.231 |
| 7UX4 Crystallographic snapshots of ternary complexes of thermophilic secondary alcohol dehydrogenase from Thermoanaerobacter pseudoethanolicus reveal the dynamics of ligand exchange and the proton relay network. 提交 2022-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–352（352 aa）
链 B
1–352（352 aa）
链 C
1–352（352 aa）
链 D
1–352（352 aa）
|
突变：I86A 突变：I86A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I86A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：I86A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 4 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 8 NWO (1S,3S)-3-methylcyclohexan-1-ol × 3 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.6 M KCl,12% PEG 3350, 50 mM HEPES-K buffer, pH 7.5
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.204 |
| 7XL5 Crystal structure of the H42T/A85G/I86A mutant of a nadp-dependent alcohol dehydrogenase 提交 2022-04-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–352（351 aa）
链 B
2–352（351 aa）
链 C
2–352（351 aa）
链 D
2–352（351 aa）
|
突变：H42T, A85G, I86A 突变：H42T, A85G, I86A 突变：H42T, A85G, I86A 突变：H42T, A85G, I86A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M Magnesium acetate tetrahydrate, 15% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.225 |
| 7XY9 Cryo-EM structure of secondary alcohol dehydrogenases TbSADH after carrier-free immobilization based on weak intermolecular interactions 提交 2022-06-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–352（351 aa）
链 B
2–352（351 aa）
链 C
2–352（351 aa）
链 D
2–352（351 aa）
|
突变：I86N 突变：I86N 突变：I86N 突变：I86N | ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.12 Å |