当前蛋白身份：P17763
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3L6P Crystal Structure of Dengue Virus 1 NS2B/NS3 protease 提交 2009-12-23 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1476–1661（186 aa）
片段：NS2B residues 1394-1440, NS3 PROTEASE residues 1476-1661
|
突变：deletion NS3 PROTEASE, residues 1486-1495 | NI NICKEL (II) ION × 6 CD CADMIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；293 K；0.1M HEPES pH 7.5, 12% PEG 3350 and 0.005M each of NiCl2, CdCl2, MgCl2 and CoCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.284 |
| 3L6P Crystal Structure of Dengue Virus 1 NS2B/NS3 protease 提交 2009-12-23 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1476–1661（186 aa）
片段：NS2B residues 1394-1440, NS3 PROTEASE residues 1476-1661
|
突变：deletion NS3 PROTEASE, residues 1486-1495 | NI NICKEL (II) ION × 12 CD CADMIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；293 K；0.1M HEPES pH 7.5, 12% PEG 3350 and 0.005M each of NiCl2, CdCl2, MgCl2 and CoCl2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.284 |
| 3LKW Crystal Structure of Dengue Virus 1 NS2B/NS3 protease active site mutant 提交 2010-01-28 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1476–1661（186 aa）
片段：NS2B residues 1394-1440, NS3 PROTEASE residues 1476-1661
|
突变：deletion NS3 PROTEASE, residues 1486-1495 | CL CHLORIDE ION × 2 CD CADMIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；293 K；0.1M Hepes pH 7.5, 12% PEG 3350, 0.005M each NiCl2, CdCl2, MgCl2, CoCl2, 0.1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 3LKW Crystal Structure of Dengue Virus 1 NS2B/NS3 protease active site mutant 提交 2010-01-28 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1476–1661（186 aa）
片段：NS2B residues 1394-1440, NS3 PROTEASE residues 1476-1661
|
突变：deletion NS3 PROTEASE, residues 1486-1495 | CL CHLORIDE ION × 4 CD CADMIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；293 K；0.1M Hepes pH 7.5, 12% PEG 3350, 0.005M each NiCl2, CdCl2, MgCl2, CoCl2, 0.1M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 4FFZ Crystal Structure of DENV1-E111 fab fragment bound to DENV-1 DIII (Western Pacific-74 strain). 提交 2012-06-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
573–679（107 aa）
片段：UNP residues 573-679
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；20% PEG 6000, 0.1M MES, 1% glycerol., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.278 |
| 4FFZ Crystal Structure of DENV1-E111 fab fragment bound to DENV-1 DIII (Western Pacific-74 strain). 提交 2012-06-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 X
573–679（107 aa）
片段：UNP residues 573-679
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；20% PEG 6000, 0.1M MES, 1% glycerol., pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.278 |
| 4GSX High resolution structure of dengue virus serotype 1 sE containing stem 提交 2012-08-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
281–691（411 aa）
片段：UNP residues 281-691
|
突变：W101H | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CD CADMIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.186 |
| 4GSX High resolution structure of dengue virus serotype 1 sE containing stem 提交 2012-08-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
281–691（411 aa）
片段：UNP residues 281-691
|
突变：W101H | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CD CADMIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.186 |
| 4GT0 Structure of dengue virus serotype 1 sE containing stem to residue 421 提交 2012-08-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
281–701（421 aa）
片段：sE(421), UNP residues 281-701
|
突变：W101H | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CD CADMIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.210 |
| 4GT0 Structure of dengue virus serotype 1 sE containing stem to residue 421 提交 2012-08-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
281–701（421 aa）
片段：sE(421), UNP residues 281-701
|
突变：W101H | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CD CADMIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.210 |
| 4OIG Dengue Virus Non-structural Protein NS1 提交 2014-01-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
947–1127（181 aa）
片段：UNP residues 947-1127
链 B
947–1127（181 aa）
片段：UNP residues 947-1127
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12mg/mL in 20% PEG 4K, 0.2 M magnesium sulfate, 10% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.268 |
| 4OIG Dengue Virus Non-structural Protein NS1 提交 2014-01-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
947–1127（181 aa）
片段：UNP residues 947-1127
链 E
947–1127（181 aa）
片段：UNP residues 947-1127
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12mg/mL in 20% PEG 4K, 0.2 M magnesium sulfate, 10% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.268 |
| 5VIC Crystal structure of anti-Zika antibody Z004 bound to DENV-1 Envelope protein DIII 提交 2017-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
578–676（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；295 K；0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.5, 30% w/v PEG 1500
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.286 |
| 8VPR Crystal structure of mouse Importin alpha in complex with Dengue 1 NS5 central NLS peptide 提交 2024-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2875–2890（16 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；296 K；0.75 M sodium citrate, 0.1 M HEPES
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.242 |