当前蛋白身份:P18484 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4UQI AP2 controls clathrin polymerization with a membrane-activated switch 提交 2014-06-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–620(620 aa) 片段:ALPHA SUBUNIT TRUNK DOMAIN, RESIDUES 1-620
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.2;18% PEG1000, 10MM NA/K PHOSPHATE PH 6.2, 200MM NACL, 4MM DTT, IP6
分辨率 2.79 Å R-free 0.259
6YAF AP2 on a membrane containing tyrosine-based cargo peptide 提交 2020-03-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–622(622 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;The sample was supplemented with 10 nm nanogold fiducials, and 3 ul of the mixture was backside blotted for 3 seconds.
分辨率 9.10 Å
6YAH AP2 in clathrin coats assembled on a membrane containing dileucine- and tyrosine-based cargo peptides 提交 2020-03-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–622(622 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;The sample was supplemented with 10 nm nanogold fiducials, and 3 ul of the mixture was backside blotted for 3 seconds.
分辨率 10.20 Å
7OG1 AP2 clathrin adaptor core in complex with cargo peptide and FCHO2 提交 2021-05-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 AAA 1–620(620 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;Crystals of AP-2 in complex with FCHO2 linker and TGN38 peptide, supplemented with 10mM K Na Tartrate, grew in sitting drops with reservoir 0.1M Mg formate dehydrate, 10% to 15% PEG 3350. The crystals were cryo-protected with 0.1M Mg formate dehydrate, 13% PEG 3350, 18-24% Glycerol and 1mg/ml of peptide.
分辨率 3.25 Å R-free 0.306
7OHO Crystal structure of AP2 FCHO2 chimera 提交 2021-05-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 AAA 1–620(620 aa)
未记录 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;289 K;18% PEG 12000 0.1M Na/K phosphate pH 6.2 0.2M NaCl 4mM DTT in the presence of 3-fold molar excess of IP6.
分辨率 2.88 Å R-free 0.273
7Z5C Chimera of AP2 with FCHO2 linker domain as a fusion on Cmu2 subunit 提交 2022-03-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–620(620 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6;50% HKT buffer (10mM Hepes, 10mM Tris 120mM potassium acetate pH 7.2) and 50% Core buffer (10mM Tris, 250mM NaCl, pH 8)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å