当前蛋白身份：P18615
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1X5P Solution structure of RRM domain in Parp14 提交 2005-05-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
54–137（84 aa）
片段：RRM domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.8mM U-15, 13C; 20mM phosphate buffer NA; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90%H2O, 10%D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2BZ2 Solution structure of NELF E RRM 提交 2005-08-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
244–343（100 aa）
片段：RNA RECOGNITION MOTIF, RESIDUES 244-343
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1.0
NMR样品组成
90% H2O, 10%D2O
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分辨率未提供 |
| 2JX2 Solution conformation of RNA-bound NELF-E RRM 提交 2007-11-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
244–343（100 aa）
片段：RRM domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
0.4 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] rna bound nelfe-rrm, 0.8 mM TAR(49-57), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 5OOB COMPLEX OF HUMAN NUCLEAR CAP-BINDING COMPLEX WITH M7GTP AND NELF-E C-TERMINAL PEPTIDE 提交 2017-08-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Z
360–380（21 aa）
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未记录 | MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；6 mg/ml of CBC were mixed with 500 microM m7GTP and 500 microM NELF-E peptide in 120 mM NaCl, 1 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine, 20 mM HEPES pH 7.8. Crystals grew at 20 C in mother liquor containing 0.2 M lithium citrate and 20% (w/v) PEG 3350.
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分辨率 2.79 Å R-free 0.229 |
| 5OOB COMPLEX OF HUMAN NUCLEAR CAP-BINDING COMPLEX WITH M7GTP AND NELF-E C-TERMINAL PEPTIDE 提交 2017-08-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
360–380（21 aa）
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未记录 | MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；6 mg/ml of CBC were mixed with 500 microM m7GTP and 500 microM NELF-E peptide in 120 mM NaCl, 1 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine, 20 mM HEPES pH 7.8. Crystals grew at 20 C in mother liquor containing 0.2 M lithium citrate and 20% (w/v) PEG 3350.
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分辨率 2.79 Å R-free 0.229 |
| 5OOB COMPLEX OF HUMAN NUCLEAR CAP-BINDING COMPLEX WITH M7GTP AND NELF-E C-TERMINAL PEPTIDE 提交 2017-08-07 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
360–380（21 aa）
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未记录 | MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；6 mg/ml of CBC were mixed with 500 microM m7GTP and 500 microM NELF-E peptide in 120 mM NaCl, 1 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine, 20 mM HEPES pH 7.8. Crystals grew at 20 C in mother liquor containing 0.2 M lithium citrate and 20% (w/v) PEG 3350.
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分辨率 2.79 Å R-free 0.229 |
| 6GML Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF 提交 2018-05-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 X
8–387（380 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric（34） 与全部聚合物一致 |
链 h
1–380（380 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.18 Å |
| 8UHA Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - tilted 提交 2023-10-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–380（380 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8UHD Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - post-translocated 提交 2023-10-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–380（380 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.80 Å |
| 8UHG Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF - poised post-translocated 提交 2023-10-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–380（380 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8UI0 Structure of poised transcription complex Pol II-DSIF-NELF - pre-translocated 提交 2023-10-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–380（380 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8W8E human co-transcriptional RNA capping enzyme RNGTT 提交 2023-09-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–380（380 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.90 Å |
| 9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–380（380 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–380（380 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–380（380 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |