当前蛋白身份：P18827
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4GVC Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ in complex with phosphorylated Syndecan1 Peptide 提交 2012-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
303–310（8 aa）
片段：UNP residues 303-310
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 ANS 5-(DIMETHYLAMINO)-1-NAPHTHALENESULFONIC ACID(DANSYL ACID) × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1 M sodium acetate, 25% PEG4000, 8% isopropanol, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.200 |
| 4GVD Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ in complex with Syndecan1 Peptide 提交 2012-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
303–310（8 aa）
片段：UNP residues 303-310
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 ANS 5-(DIMETHYLAMINO)-1-NAPHTHALENESULFONIC ACID(DANSYL ACID) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1 M MES, 20% PEG8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 1.85 Å R-free 0.243 |
| 4GVD Crystal Structure of T-cell Lymphoma Invasion and Metastasis-1 PDZ in complex with Syndecan1 Peptide 提交 2012-08-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
303–310（8 aa）
片段：UNP residues 303-310
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ANS 5-(DIMETHYLAMINO)-1-NAPHTHALENESULFONIC ACID(DANSYL ACID) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1 M MES, 20% PEG8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.243 |
| 6EJE Human Xylosyltransferase 1 in complex with peptide PAAEGSGEQDFT 提交 2017-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
201–212（12 aa）
片段：UNP residues 201-212
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；55-65% Morpheus Precipitant mix 2 (PEG8000 and Ethylene glycol)
0.1M Bicine/Tris buffer at pH 7.5
0.1M of NPS mix (0.033M of each)
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分辨率 2.43 Å R-free 0.235 |