当前蛋白身份：P18887
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CDZ BRCT DOMAIN FROM DNA-REPAIR PROTEIN XRCC1 提交 1999-03-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
538–633（96 aa）
片段：C-TERMINAL BRCT DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.266 |
| 1XNA NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE SINGLE-STRAND BREAK REPAIR PROTEIN XRCC1-N-TERMINAL DOMAIN 提交 1999-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-183. RESIDUES 152-183 ARE DISORDERED AND NOT SHOWN.
|
突变：D179E | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.4；压力 1
NMR样品组成
H2O AND D2O
|
分辨率未提供 |
| 1XNT NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE SINGLE-STRAND BREAK REPAIR PROTEIN XRCC1-N-TERMINAL DOMAIN 提交 1999-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1-183. RESIDUES 152-183 ARE DISORDERED AND NOT SHOWN.
|
突变：D179E | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.4；压力 1
NMR样品组成
H2O AND D2O
|
分辨率未提供 |
| 2D8M Solution structure of the first BRCT domain of DNA-repair protein XRCC1 提交 2005-12-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
305–420（116 aa）
片段：BRCT domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.89mM BRCT domain U-15N,13C; 20mM TrisHCl, 100mM NaCl, 1mM DTT, 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2W3O Crystal structure of the human PNKP FHA domain in complex with an XRCC1-derived phosphopeptide 提交 2008-11-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
515–522（8 aa）
片段：RESIDUES 515-522
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.25 M CACL2, 28% W/V PEG 4000, 0.2 M NDSB-221
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.236 |
| 2W3O Crystal structure of the human PNKP FHA domain in complex with an XRCC1-derived phosphopeptide 提交 2008-11-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
515–522（8 aa）
片段：RESIDUES 515-522
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.25 M CACL2, 28% W/V PEG 4000, 0.2 M NDSB-221
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.236 |
| 3K75 X-ray crystal structure of reduced XRCC1 bound to DNA pol beta catalytic domain 提交 2009-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–183（183 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1 to 183)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20-25% PEG 3350, 0.2-0.3M Tri-potassium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.295 |
| 3K75 X-ray crystal structure of reduced XRCC1 bound to DNA pol beta catalytic domain 提交 2009-10-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–183（183 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1 to 183)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20-25% PEG 3350, 0.2-0.3M Tri-potassium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.295 |
| 3K77 X-ray crystal structure of XRCC1 提交 2009-10-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–155（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；25-30% PEG 3350, 0.2-0.3M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 3K77 X-ray crystal structure of XRCC1 提交 2009-10-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–155（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；25-30% PEG 3350, 0.2-0.3M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 3K77 X-ray crystal structure of XRCC1 提交 2009-10-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–155（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；25-30% PEG 3350, 0.2-0.3M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 3K77 X-ray crystal structure of XRCC1 提交 2009-10-12 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–155（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；25-30% PEG 3350, 0.2-0.3M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 3K77 X-ray crystal structure of XRCC1 提交 2009-10-12 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–155（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；25-30% PEG 3350, 0.2-0.3M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 3K77 X-ray crystal structure of XRCC1 提交 2009-10-12 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1–155（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；25-30% PEG 3350, 0.2-0.3M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 3K77 X-ray crystal structure of XRCC1 提交 2009-10-12 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
1–155（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；25-30% PEG 3350, 0.2-0.3M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 3K77 X-ray crystal structure of XRCC1 提交 2009-10-12 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
1–155（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；25-30% PEG 3350, 0.2-0.3M MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.237 |
| 3LQC X-ray crystal structure of oxidized XRCC1 bound to DNA pol beta Palm thumb domain 提交 2010-02-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–183（183 aa）
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 CO3 CARBONATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20-25% PEG 3350, 0.2-0.3M TRI-POTASSIUM CITRATE, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.250 |
| 5E6Q Importin alpha binding to XRCC1 NLS peptide 提交 2015-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
241–276（36 aa）
片段：UNP residues 241-276
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1.5M Ammonium sulfate, 0.1M bis-tris propane
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.208 |
| 5W7X Crystal Structure of FHA domain of human APLF in complex with XRCC1 bisphospho peptide 提交 2017-06-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
514–522（9 aa）
片段：UNP residues 514-522
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.6mM XRCC1 bisphosphopeptide
0.6mM APLF
0.5M lithium chloride
0.1M Tris
28% PEG 6000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 5W7X Crystal Structure of FHA domain of human APLF in complex with XRCC1 bisphospho peptide 提交 2017-06-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
514–522（9 aa）
片段：UNP residues 514-522
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.6mM XRCC1 bisphosphopeptide
0.6mM APLF
0.5M lithium chloride
0.1M Tris
28% PEG 6000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 5W7X Crystal Structure of FHA domain of human APLF in complex with XRCC1 bisphospho peptide 提交 2017-06-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
514–522（9 aa）
片段：UNP residues 514-522
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.6mM XRCC1 bisphosphopeptide
0.6mM APLF
0.5M lithium chloride
0.1M Tris
28% PEG 6000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 5W7X Crystal Structure of FHA domain of human APLF in complex with XRCC1 bisphospho peptide 提交 2017-06-21 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
514–522（9 aa）
片段：UNP residues 514-522
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.6mM XRCC1 bisphosphopeptide
0.6mM APLF
0.5M lithium chloride
0.1M Tris
28% PEG 6000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 5W7Y Crystal Structure of FHA domain of human APLF in complex with XRCC1 monophosphorylated mutated peptide 提交 2017-06-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
514–521（8 aa）
片段：UNP residues 514-521
|
突变：S518E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.6mM APLF
0.6mM XRCC1 peptide
0.1M Tris
30% PEG 1000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.237 |
| 5W7Y Crystal Structure of FHA domain of human APLF in complex with XRCC1 monophosphorylated mutated peptide 提交 2017-06-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
514–521（8 aa）
片段：UNP residues 514-521
|
突变：S518E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.6mM APLF
0.6mM XRCC1 peptide
0.1M Tris
30% PEG 1000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.237 |