当前蛋白身份:P19634 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1Y4E NMR structure of transmembrane segment IV of the NHE1 isoform of the Na+/H+ exchanger 提交 2004-11-30 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 155–180(26 aa) 片段:Transmembrane segment IV
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 303 K;压力 ambient
NMR样品组成 2 mM TM IV, unlabelled; 1 mM DSS, CDCl3:CD3OH:H2O (4:4:1 v:v:v) | CDCl3:CD3OH:H2O (4:4:1 v:v:v)
NMR样品组成 2 mM TM IV, U-15N; 1 mM DSS, CDCl3:CD3OH:H2O (4:4:1 v:v:v) | CDCl3:CD3OH:H2O (4:4:1 v:v:v)
分辨率未提供
23XK Cryo-EM structure of human sodium/proton antiporter NHE1 in complex with Cariporide in an outward-open conformation 提交 2026-02-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–815(815 aa)
链 B 1–815(815 aa)
未记录 HG0 N-[bis(azanyl)methylidene]-3-methylsulfonyl-4-propan-2-yl-benzamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
23XM Cryo-EM structure of human sodium/proton antiporter NHE1 in complex with Eniporide in an outward-open conformation 提交 2026-02-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–815(815 aa)
链 B 1–815(815 aa)
未记录 A1E6D Eniporide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
23XO Cryo-EM structure of human sodium/proton antiporter NHE1 in complex with Rimeporide in an outward-open conformation 提交 2026-02-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–815(815 aa)
链 B 1–815(815 aa)
未记录 A1E6E ~{N}-carbamimidoyl-2-methyl-4,5-bis(methylsulfonyl)benzamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
2BEC Crystal structure of CHP2 in complex with its binding region in NHE1 and insights into the mechanism of pH regulation 提交 2005-10-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 503–545(43 aa) 片段:residues 503-545
未记录 YT3 YTTRIUM (III) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;25% PEG 3350, 0.2M ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris, 0.01M yttrium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.287
2E30 Solution structure of the cytoplasmic region of Na+/H+ exchanger 1 complexed with essential cofactor calcineurin B homologous protein 1 提交 2006-11-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 503–545(43 aa) 片段:NHE1 fragment (503-545)
未记录 CA CALCIUM ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.9;310 K;离子强度(mmCIF原始值)30mM;压力 ambient
NMR样品组成 0.9mM CHP1/NHE1 U-15N, U-13C, 50mM Tris buffer, 99% D2O | 99% D2O
NMR样品组成 0.5mM CHP1/NHE1 60%2H, U-15N, U-13C, 50mM Tris buffer, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.9mM CHP1/NHE1 U-15N, 50mM Tris buffer, 95% H2Om, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.9mM CHP1/NHE1 U-15N, U-13C, 50mM Tris buffer, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.5mM CHP1/NHE1 U-15N, 15%-13C, 50mM Tris buffer, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2HTG Structural and functional characterization of TM VII of the NHE1 isoform of the Na+/H+ exchanger 提交 2006-07-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 250–274(25 aa) 片段:Transmembrane segment VII
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.8;303 K;离子强度(mmCIF原始值)~ 75 mM Na+/DPC-;压力 ambient
NMR样品组成 ~ 1 mM peptide synthetic source 1 (unlabeled), 90% H2O/10% D2O, ~ 75 mM dodecylphosphocholine, 1.0 mM DSS | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 ~ 1 mM peptide synthetic source 2 (6 specific 15N labels), 90% H2O/10% D2O, ~ 75 mM dodecylphosphocholine, 1.0 mM DSS | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KBV Structural and functional analysis of TM XI of the NHE1 isoform of thE NA+/H+ exchanger 提交 2008-12-09 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 447–472(26 aa) 片段:NHE1 transmembrane segment XI
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;303 K;压力 ambient
NMR样品组成 150 mM DPC-1, 0.25 mM DSS-2, 2 mM TMXI-3, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2L0E Structural and functional analysis of tm vi of the nhe1 isoform of the na+/h+ exchanger 提交 2010-07-01 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 226–250(25 aa) 片段:transmembrane segment VI of NHE1, UNP residues 226-250
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;303 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 ambient
NMR样品组成 2 mM TM VI-1, 0.25 mM DSS-2, 150 mM [U-2H] DPC-3, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2MDF NMR structure of a two-transmembrane segment TM VI-VII of NHE1 提交 2013-09-10 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 226–274(49 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;303 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 ambient
NMR样品组成 1-2 mM [U-15N] entity, 5 % [U-2H] D2O, 0.25 mM [1,1,2,2,3,3-2H6] DSS, 95 % H2O, 75-150 mM [U-2H] dodecylphosphocholine, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1-2 mM [U-15N] entity, 100 % [U-2H] D2O, 0.25 mM [1,1,2,2,3,3-2H6] DSS, 75-150 mM [U-2H] dodecylphosphocholine, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2YGG Complex of CaMBR and CaM 提交 2011-04-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 622–689(68 aa) 片段:CAM BINDING REGION, RESIDUES 622-689
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 3 CA CALCIUM ION × 4 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.23 Å R-free 0.232
6NUC Structure of Calcineurin in complex with NHE1 peptide 提交 2019-01-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 679–723(45 aa)
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.194
6NUF Structure of Calcineurin in complex with NHE1 peptide 提交 2019-01-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 679–723(45 aa)
突变:R698A, R700A FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 1.90 Å R-free 0.209
6NUU Structure of Calcineurin mutant in complex with NHE1 peptide 提交 2019-02-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 679–723(45 aa)
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
分辨率 2.30 Å R-free 0.243
6ZBI Ternary complex of Calmodulin bound to 2 molecules of NHE1 提交 2020-06-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 622–657(36 aa)
链 C 622–657(36 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5;310 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Calmodulin, 1.15 mM Sodium/Hydrogen exchanger 1 (NHE1, SLC9A1), 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Sodium/Hydrogen exchanger 1 (NHE1, SLC9A1), 0.5 mM Calmodulin, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
7DSV Structure of a human NHE1-CHP1 complex under pH 6.5 提交 2021-01-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 87–558(472 aa)
链 B 87–558(472 aa)
未记录 LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7DSW Structure of a human NHE1-CHP1 complex under pH 7.5 提交 2021-01-03 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 87–506(420 aa)
链 B 87–506(420 aa)
未记录 LBN 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7DSX Structure of a human NHE1-CHP1 complex under pH 7.5, bound by cariporide 提交 2021-01-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 85–593(509 aa)
链 B 85–593(509 aa)
未记录 PGT (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 6 HG0 N-[bis(azanyl)methylidene]-3-methylsulfonyl-4-propan-2-yl-benzamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9NXE Crystal Structure of Calcineurin Clinical Variant E282K 提交 2025-03-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 679–723(45 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;290 K;0.1 M CAPS pH 9, 0.2 M MgCl2 and 24% PEG 600
分辨率 2.09 Å R-free 0.243