当前蛋白身份：P19803
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AJW STRUCTURE OF RHOGDI: A C-TERMINAL BINDING DOMAIN TARGETS AN N-TERMINAL INHIBITORY PEPTIDE TO GTPASES, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-05-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
60–204（145 aa）
片段：ISOPRENE BINDING DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；303 K
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分辨率未提供 |
| 1DOA Structure of the rho family gtp-binding protein cdc42 in complex with the multifunctional regulator rhogdi 提交 1999-12-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–204（204 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GER GERAN-8-YL GERAN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；15% PEG 4000,
100 mM Glutamic Acid,
25 mM MgSO4,
50 mM Tris,
2 mM NaN3,
2 mM LDAO
, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K, temperature 291K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.320 |
| 1DOA Structure of the rho family gtp-binding protein cdc42 in complex with the multifunctional regulator rhogdi 提交 1999-12-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–204（204 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 GER GERAN-8-YL GERAN × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；15% PEG 4000,
100 mM Glutamic Acid,
25 mM MgSO4,
50 mM Tris,
2 mM NaN3,
2 mM LDAO
, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.320 |
| 1GDF STRUCTURE OF RHOGDI: A C-TERMINAL BINDING DOMAIN TARGETS AN N-TERMINAL INHIBITORY PEPTIDE TO GTPASES, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-05-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
60–204（145 aa）
片段：ISOPRENE BINDING DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；303 K
|
分辨率未提供 |
| 5FR1 Double acetylated RhoGDI-alpha in complex with RhoA-GDP 提交 2015-12-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–204（204 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；4 M SODIUM FORMATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.5
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分辨率 2.75 Å R-free 0.256 |
| 5FR2 Farnesylated RhoA-GDP in complex with RhoGDI-alpha, lysine acetylated at K178 提交 2015-12-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–204（204 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FAR FARNESYL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.2 M LITHIUMSULFATE 0.1 M BIS-TRIS PH5.5 25% PEG3350 30% DEXTROSE
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分辨率 3.35 Å R-free 0.258 |