当前蛋白身份:P20263 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1OCP SOLUTION STRUCTURE OF OCT3 POU-HOMEODOMAIN 提交 1995-02-21 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 217–282(66 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
3L1P POU protein:DNA complex 提交 2009-12-14 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 131–282(152 aa) 片段:UNP residues 131-282
链 B 131–282(152 aa) 片段:UNP residues 131-282
突变:C48S, C61S, C84S, C115S, C142S 突变:C48S, C61S, C84S, C115S, C142S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.257
6HT5 Oct4/Sox2:UTF1 structure 提交 2018-10-03 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 E 131–282(152 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;100 mM 4-morpholineethanesulfonic acid at pH 6.0, 33% v/v 2-methyl-2,4-pentanediol
分辨率 3.45 Å R-free 0.248
8BX1 Oct4/Sox2 protein:DNA complex 提交 2022-12-07 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 131–282(152 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;277 K;0.1M sodium acetate, 12% (v/v) PEG 4000
分辨率 2.50 Å R-free 0.274
8BX2 Oct4/Sox2 protein:DNA complex 提交 2022-12-07 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 131–282(152 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.1M HEPES, 70% (v/v) MPD
分辨率 3.14 Å R-free 0.252