当前蛋白身份:P20443 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4ZWJ Crystal structure of rhodopsin bound to arrestin by femtosecond X-ray laser 提交 2015-05-19 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 10–392(383 aa)
突变:R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5;293 K;PEG400, sodium acetate, magnesium acetate
分辨率 3.30 Å R-free 0.293
4ZWJ Crystal structure of rhodopsin bound to arrestin by femtosecond X-ray laser 提交 2015-05-19 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 10–392(383 aa)
突变:R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5;293 K;PEG400, sodium acetate, magnesium acetate
分辨率 3.30 Å R-free 0.293
4ZWJ Crystal structure of rhodopsin bound to arrestin by femtosecond X-ray laser 提交 2015-05-19 Assembly 3 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 10–392(383 aa)
突变:R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5;293 K;PEG400, sodium acetate, magnesium acetate
分辨率 3.30 Å R-free 0.293
4ZWJ Crystal structure of rhodopsin bound to arrestin by femtosecond X-ray laser 提交 2015-05-19 Assembly 4 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 10–392(383 aa)
突变:R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5;293 K;PEG400, sodium acetate, magnesium acetate
分辨率 3.30 Å R-free 0.293
5DGY Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin 提交 2015-08-28 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 10–392(383 aa)
链 C 10–392(383 aa)
突变:R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A 突变:R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5;293 K;PEG400
分辨率 7.70 Å R-free 0.335
5DGY Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin 提交 2015-08-28 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 10–392(383 aa)
链 D 10–392(383 aa)
突变:R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A 突变:R12G, C54T, C97A , I137R,N2C, E113Q, M257Y, N282C,L374A, V375A, F376A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5;293 K;PEG400
分辨率 7.70 Å R-free 0.335
5W0P Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin determined by X-ray free electron laser 提交 2017-05-31 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 10–392(383 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5;293 K;PEG 400, magnesium acetate, sodium acetate.
分辨率 3.01 Å R-free 0.272
5W0P Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin determined by X-ray free electron laser 提交 2017-05-31 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 10–392(383 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5;293 K;PEG 400, magnesium acetate, sodium acetate.
分辨率 3.01 Å R-free 0.272
5W0P Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin determined by X-ray free electron laser 提交 2017-05-31 Assembly 3 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 10–392(383 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5;293 K;PEG 400, magnesium acetate, sodium acetate.
分辨率 3.01 Å R-free 0.272
5W0P Crystal structure of rhodopsin bound to visual arrestin determined by X-ray free electron laser 提交 2017-05-31 Assembly 4 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 10–392(383 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5;293 K;PEG 400, magnesium acetate, sodium acetate.
分辨率 3.01 Å R-free 0.272