当前蛋白身份：P20457
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3LGB Crystal Structure of the Fe-S Domain of the yeast DNA primase 提交 2010-01-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
317–512（196 aa）
片段：Fe-S DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M TrisHCl pH 7.5, 1mM Zn acetate, 11% ethanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.164 |
| 3LGB Crystal Structure of the Fe-S Domain of the yeast DNA primase 提交 2010-01-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
317–512（196 aa）
片段：Fe-S DOMAIN
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M TrisHCl pH 7.5, 1mM Zn acetate, 11% ethanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.164 |
| 6DTV Crystal structure of eukaryotic DNA primase large subunit iron-sulfur cluster domain Y395F mutant 提交 2018-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
316–512（197 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；MPD, TRIS 8.5
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.137 |
| 6DTZ Crystal structure of eukaryotic DNA primase large subunit iron-sulfur cluster domain, Y397F mutant 提交 2018-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
316–512（197 aa）
|
突变：Y397F | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；100 mM TRIS, 40% MPD
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.179 |
| 6DU0 Crystal structure of eukaryotic DNA primase large subunit iron-sulfur cluster domain Y395L mutant 提交 2018-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
316–512（197 aa）
|
突变：Y395L | GOL GLYCEROL × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；100 mM TRIS 8.5, 40-60% MPD
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.324 |
| 8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–528（528 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–528（528 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–528（528 aa）
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |