当前蛋白身份：P21453
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3V2W Crystal Structure of a Lipid G protein-Coupled Receptor at 3.35A 提交 2011-12-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
链 A
244–326（83 aa）
|
突变：C1054T, C1097A 突变：C1054T, C1097A | ML5 {(3R)-3-amino-4-[(3-hexylphenyl)amino]-4-oxobutyl}phosphonic acid × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Lupuc cubic phase；287 K；0.1M Tricine, 34-36% PEG400, 80mM sodium citrate and 4% glycerol, Lupuc cubic phase, temperature 287K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.281 |
| 3V2Y Crystal Structure of a Lipid G protein-Coupled Receptor at 2.80A 提交 2011-12-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–231（230 aa）
链 A
244–326（83 aa）
|
突变：C1054T, C1097A 突变：C1054T, C1097A | ML5 {(3R)-3-amino-4-[(3-hexylphenyl)amino]-4-oxobutyl}phosphonic acid × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Lipid cubic phase；287 K；0.1M Tricine, 34-36% PEG400, 80mM sodium citrate and 4% glycerol, Lipid cubic phase, temperature 287K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.272 |
| 7EO2 Cryo-EM of Sphingosine 1-phosphate receptor 1 / Gi complex bound to FTY720p 提交 2021-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–339（339 aa）
|
未记录 | J89 (2~{S})-2-azanyl-4-(4-octylphenyl)-2-[[oxidanyl-bis(oxidanylidene)-$l^{6}-phosphanyl]oxymethyl]butan-1-ol × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 7EO4 Cryo-EM of Sphingosine 1-phosphate receptor 1 / Gi complex bound to BAF312 提交 2021-04-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–382（382 aa）
|
未记录 | J8C 1-[[4-[(~{E})-~{N}-[[4-cyclohexyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]methoxy]-~{C}-methyl-carbonimidoyl]-2-ethyl-phenyl]methyl]azetidine-3-carboxylic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 7TD3 Sphingosine-1-phosphate receptor 1-Gi complex bound to S1P 提交 2021-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
2–382（381 aa）
|
未记录 | S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7TD4 Sphingosine-1-phosphate receptor 1-Gi complex bound to Siponimod 提交 2021-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
2–382（381 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 J8C 1-[[4-[(~{E})-~{N}-[[4-cyclohexyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]methoxy]-~{C}-methyl-carbonimidoyl]-2-ethyl-phenyl]methyl]azetidine-3-carboxylic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7VIE Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with S1P 提交 2021-09-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
1–382（382 aa）
|
未记录 | S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 7VIF Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with (S)-FTY720-P 提交 2021-09-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
1–382（382 aa）
|
未记录 | J89 (2~{S})-2-azanyl-4-(4-octylphenyl)-2-[[oxidanyl-bis(oxidanylidene)-$l^{6}-phosphanyl]oxymethyl]butan-1-ol × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
| 7VIG Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with CBP-307 提交 2021-09-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
1–382（382 aa）
|
未记录 | 7I4 1-[[2-fluoranyl-4-[5-[4-(2-methylpropyl)phenyl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]phenyl]methyl]azetidine-3-carboxylic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 7VIH Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with CBP-307 提交 2021-09-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
1–382（382 aa）
|
未记录 | 7I4 1-[[2-fluoranyl-4-[5-[4-(2-methylpropyl)phenyl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]phenyl]methyl]azetidine-3-carboxylic acid × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 7WF7 Cryo-EM of Sphingosine 1-phosphate receptor 1 / Gi complex bound to S1P 提交 2021-12-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–382（382 aa）
|
未记录 | S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8G94 Structure of CD69-bound S1PR1 coupled to heterotrimeric Gi 提交 2023-02-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–347（347 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 8YIC SAR247799-bound S1PR1-Gi protein complex 提交 2024-02-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 R
1–337（337 aa）
|
未记录 | A1LYQ SAR247799 × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9VNY Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with CYM5442 提交 2025-07-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
1–382（382 aa）
|
未记录 | A1L3G 2-[[(1~{R})-4-[5-(3,4-diethoxyphenyl)-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-2,3-dihydro-1~{H}-inden-1-yl]amino]ethanol × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 9VNZ Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with HY-X-1011 提交 2025-07-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
1–382（382 aa）
|
未记录 | A1ESY [(2~{S})-2-azanyl-2-[[4-[5-[4-cyclohexyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-2-fluoranyl-phenyl]methyl]-3-oxidanyl-propyl] dihydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 9VO0 Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with Ponesimod 提交 2025-07-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
1–382（382 aa）
|
未记录 | A1ESZ (2~{Z},5~{Z})-5-[[4-[(2~{R})-2,3-bis(oxidanyl)propoxy]-3-chloranyl-phenyl]methylidene]-3-(2-methylphenyl)-2-propylimino-1,3-thiazolidin-4-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 9VO1 Cryo-EM structure of Gi coupled Sphingosine 1-phosphate receptor bound with SAR247799 提交 2025-07-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
1–382（382 aa）
|
未记录 | A1LYQ SAR247799 × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |