当前蛋白身份：P21505
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B24 I-DMOI, INTRON-ENCODED ENDONUCLEASE 提交 1998-12-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–188（188 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；HANGING DROP VAPOR-DIFFUSION METHOD: 4UL I-DMOI PROTEIN 1UL 20MM N-OCTYL-B-
GLUCOPYRANOSIDE 4UL PRECIPITATING BUFFER: 30% PEG 3350 200MM SODIUM ACETATE
100MM TRIS-HCL PH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.324 |
| 2VS7 The crystal structure of I-DmoI in complex with DNA and Ca 提交 2008-04-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
片段：RESIDUES 2-188
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
5.6% PEG 4000, 0.07M SODIUM ACETATE, 30% GLYCEROL
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.228 |
| 2VS7 The crystal structure of I-DmoI in complex with DNA and Ca 提交 2008-04-21 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–188（187 aa）
片段：RESIDUES 2-188
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
5.6% PEG 4000, 0.07M SODIUM ACETATE, 30% GLYCEROL
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.228 |
| 2VS7 The crystal structure of I-DmoI in complex with DNA and Ca 提交 2008-04-21 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–188（187 aa）
片段：RESIDUES 2-188
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
5.6% PEG 4000, 0.07M SODIUM ACETATE, 30% GLYCEROL
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.228 |
| 2VS8 The crystal structure of I-DmoI in complex with DNA and Mn 提交 2008-04-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
片段：RESIDUES 2-188
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
5.6% PEG 4000, 0.07M SODIUM ACETATE, PH 4.6-5.5, 30% GLYCEROL.
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.248 |
| 2VS8 The crystal structure of I-DmoI in complex with DNA and Mn 提交 2008-04-21 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 F
2–188（187 aa）
片段：RESIDUES 2-188
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
5.6% PEG 4000, 0.07M SODIUM ACETATE, PH 4.6-5.5, 30% GLYCEROL.
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.248 |
| 2VS8 The crystal structure of I-DmoI in complex with DNA and Mn 提交 2008-04-21 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 K
2–188（187 aa）
片段：RESIDUES 2-188
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
5.6% PEG 4000, 0.07M SODIUM ACETATE, PH 4.6-5.5, 30% GLYCEROL.
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.248 |
| 4D6N THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 10 DAYS INCUBATION IN 5MM MG (STATE 7) 提交 2014-11-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 K
2–188（187 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.217 |
| 4D6N THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 10 DAYS INCUBATION IN 5MM MG (STATE 7) 提交 2014-11-13 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 F
2–188（187 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.217 |
| 4D6N THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 10 DAYS INCUBATION IN 5MM MG (STATE 7) 提交 2014-11-13 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.217 |
| 4D6O THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 1H INCUBATION IN 5MM MG (STATE 2) 提交 2014-11-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–188（187 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 4D6O THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 1H INCUBATION IN 5MM MG (STATE 2) 提交 2014-11-13 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–188（187 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 4D6O THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 1H INCUBATION IN 5MM MG (STATE 2) 提交 2014-11-13 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；pH 5.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 4UN7 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA BEFORE INCUBATION IN 5MM MN (STATE 1) 提交 2014-05-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 4UN7 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA BEFORE INCUBATION IN 5MM MN (STATE 1) 提交 2014-05-26 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–188（187 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 4UN7 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA BEFORE INCUBATION IN 5MM MN (STATE 1) 提交 2014-05-26 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–188（187 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 4UN8 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 1H INCUBATION IN 5MM MN (STATE 2) 提交 2014-05-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.223 |
| 4UN8 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 1H INCUBATION IN 5MM MN (STATE 2) 提交 2014-05-26 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.223 |
| 4UN8 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 1H INCUBATION IN 5MM MN (STATE 2) 提交 2014-05-26 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.223 |
| 4UN9 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 8H INCUBATION IN 5MM MN (STATE 3) 提交 2014-05-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.220 |
| 4UN9 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 8H INCUBATION IN 5MM MN (STATE 3) 提交 2014-05-26 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.220 |
| 4UN9 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 8H INCUBATION IN 5MM MN (STATE 3) 提交 2014-05-26 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.220 |
| 4UNA THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 2 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 4) 提交 2014-05-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.219 |
| 4UNA THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 2 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 4) 提交 2014-05-26 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.219 |
| 4UNA THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 2 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 4) 提交 2014-05-26 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.219 |
| 4UNB THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 6 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 5) 提交 2014-05-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.221 |
| 4UNB THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 6 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 5) 提交 2014-05-26 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.221 |
| 4UNB THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 6 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 5) 提交 2014-05-26 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.221 |
| 4UNC THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 8 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 6) 提交 2014-05-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.225 |
| 4UNC THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 8 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 6) 提交 2014-05-26 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.225 |
| 4UNC THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 8 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 6) 提交 2014-05-26 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.225 |
| 4UT0 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 10 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 7) 提交 2014-07-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 K
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.228 |
| 4UT0 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 10 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 7) 提交 2014-07-17 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 F
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.228 |
| 4UT0 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AT 10 DAYS INCUBATION IN 5MM MN (STATE 7) 提交 2014-07-17 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；PH 6
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.228 |
| 5A0W THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI E117A IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-04-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–188（187 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.208 |
| 5A0W THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI E117A IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-04-23 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.208 |
| 5A0W THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI E117A IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-04-23 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–188（187 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.208 |
| 5AK9 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-03-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.222 |
| 5AK9 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-03-02 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 J
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.222 |
| 5AK9 THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-03-02 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 E
2–188（187 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.222 |
| 5AKF THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA NICKED IN THE CODING STRAND A AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-03-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 I
2–188（187 aa）
|
突变：YES | CL CHLORIDE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.45 Å R-free 0.230 |
| 5AKF THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA NICKED IN THE CODING STRAND A AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-03-03 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 E
2–188（187 aa）
|
突变：YES | CL CHLORIDE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.45 Å R-free 0.230 |
| 5AKF THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA NICKED IN THE CODING STRAND A AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-03-03 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
突变：YES | CL CHLORIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.45 Å R-free 0.230 |
| 5AKM THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI G20S IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA IN THE PRESENCE OF 2MM MG 提交 2015-03-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 F
2–188（187 aa）
|
突变：YES | ACT ACETATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.235 |
| 5AKM THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI G20S IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA IN THE PRESENCE OF 2MM MG 提交 2015-03-04 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 K
2–188（187 aa）
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.235 |
| 5AKM THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI G20S IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA IN THE PRESENCE OF 2MM MG 提交 2015-03-04 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
|
突变：YES | ACT ACETATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.235 |
| 5AKN THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA NICKED IN THE non-CODING STRAND B AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-03-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
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突变：YES | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.75 Å R-free 0.236 |
| 5AKN THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA NICKED IN THE non-CODING STRAND B AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-03-04 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 F
2–188（187 aa）
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突变：YES | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.75 Å R-free 0.236 |
| 5AKN THE CRYSTAL STRUCTURE OF I-DMOI Q42AK120M IN COMPLEX WITH ITS TARGET DNA NICKED IN THE non-CODING STRAND B AND IN THE PRESENCE OF 2MM MN 提交 2015-03-04 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 K
2–188（187 aa）
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突变：YES | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.75 Å R-free 0.236 |
| 5O6G Structures and dynamics of mesophilic variants from the homing endonuclease I-DmoI 提交 2017-06-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5-6 % PEG4000, 0.07 M NaAc pH = 4.6-5.5 and 30% Glycerol
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分辨率 2.75 Å R-free 0.232 |
| 5O6G Structures and dynamics of mesophilic variants from the homing endonuclease I-DmoI 提交 2017-06-06 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
2–188（187 aa）
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5-6 % PEG4000, 0.07 M NaAc pH = 4.6-5.5 and 30% Glycerol
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分辨率 2.75 Å R-free 0.232 |
| 5O6G Structures and dynamics of mesophilic variants from the homing endonuclease I-DmoI 提交 2017-06-06 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 G
2–188（187 aa）
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5-6 % PEG4000, 0.07 M NaAc pH = 4.6-5.5 and 30% Glycerol
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分辨率 2.75 Å R-free 0.232 |
| 5O6I Structures and dynamics of mesophilic variants from the homing endonuclease I-DmoI 提交 2017-06-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–188（187 aa）
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5-6 % PEG4000, 0.07 M NaAc pH = 4.6-5.5 and 30% Glycerol
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分辨率 2.25 Å R-free 0.228 |
| 5O6I Structures and dynamics of mesophilic variants from the homing endonuclease I-DmoI 提交 2017-06-06 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 F
2–188（187 aa）
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5-6 % PEG4000, 0.07 M NaAc pH = 4.6-5.5 and 30% Glycerol
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分辨率 2.25 Å R-free 0.228 |
| 5O6I Structures and dynamics of mesophilic variants from the homing endonuclease I-DmoI 提交 2017-06-06 | Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 K
2–188（187 aa）
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；5-6 % PEG4000, 0.07 M NaAc pH = 4.6-5.5 and 30% Glycerol
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分辨率 2.25 Å R-free 0.228 |