当前蛋白身份：P23246
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4WII HUMAN SPLICING FACTOR, CONSTRUCT 3 提交 2014-09-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
276–535（260 aa）
片段：UNP RESIDUES 276-535
链 B
276–535（260 aa）
片段：UNP RESIDUES 276-535
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；1.9 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS,
20% ETHYLENE GLYCOL (V/V), PH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,
TEMPERATURE 293K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.235 |
| 4WIJ HUMAN SPLICING FACTOR, CONSTRUCT 1 提交 2014-09-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
276–598（323 aa）
片段：UNP RESIDUES 276-598
链 B
276–598（323 aa）
片段：UNP RESIDUES 276-598
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；26% (V/V) 1,4 DIOXANE, 0.05M MOPS, 50
MM MAGNESIUM CHLORIDE HEXAHYDRATE, 1 MM SPERMINE, PH 7.0, VAPOR
DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 3.49 Å R-free 0.335 |
| 4WIK HUMAN SPLICING FACTOR, CONSTRUCT 2 提交 2014-09-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
369–598（230 aa）
片段：UNP RESIDUES 369-598
链 B
369–598（230 aa）
片段：UNP RESIDUES 369-598
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M SODIUM PHOSPHATE DIBASIC
DIHYDRATE, 22% (W/V) POLYETHYLENE GLYCOL 3350, VAPOR DIFFUSION,
SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.291 |
| 5WPA Structure of human SFPQ/PSPC1 heterodimer 提交 2017-08-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
276–535（260 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.05 M MES, pH 5.5, 0.2 M sodium chloride, 3% aminohexanoic acid
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.272 |
| 6NCQ The dimerization domain of human SFPQ in space group C2221 提交 2018-12-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
276–535（260 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8,5), 35-40% (v/v) MPD
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.243 |
| 6OWJ Zn-mediated polymerization of human SFPQ 提交 2019-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
276–535（260 aa）
片段：UNP residues 276-535
链 B
276–535（260 aa）
片段：UNP residues 276-535
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14% PEG4000, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M MES, pH 6.0
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.218 |
| 6WMZ Crystal structure of human SFPQ/NONO complex 提交 2020-04-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
214–598（385 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5), 0.2 M ammonium sulfate, 19% PEG 3350
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.283 |
| 6WMZ Crystal structure of human SFPQ/NONO complex 提交 2020-04-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
214–598（385 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5), 0.2 M ammonium sulfate, 19% PEG 3350
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.283 |
| 7LRQ Crystal structure of human SFPQ/NONO heterodimer, conserved DBHS region 提交 2021-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
276–535（260 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；22.5% PEG3350, 0.4 M MgCl2, 0.1 M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.299 |
| 7LRU Crystal structure of SFPQ-NONO-SFPQ chimeric protein homodimer 提交 2021-02-17 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
276–452（177 aa）
链 B
505–535（31 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；15%(v/v) Jeffamine ED-2003, 10% EtOH
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.256 |
| 7PU5 Structure of SFPQ-NONO complex 提交 2021-09-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
277–535（259 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；25 mM Tris-HCl pH8.5, 14-16 % PEG 8K, 20 % w/v
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.255 |
| 7PU5 Structure of SFPQ-NONO complex 提交 2021-09-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
277–535（259 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；25 mM Tris-HCl pH8.5, 14-16 % PEG 8K, 20 % w/v
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.255 |
| 7PU5 Structure of SFPQ-NONO complex 提交 2021-09-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
277–535（259 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；25 mM Tris-HCl pH8.5, 14-16 % PEG 8K, 20 % w/v
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.255 |
| 7PU5 Structure of SFPQ-NONO complex 提交 2021-09-28 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
277–535（259 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；25 mM Tris-HCl pH8.5, 14-16 % PEG 8K, 20 % w/v
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.255 |
| 7PU5 Structure of SFPQ-NONO complex 提交 2021-09-28 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
277–535（259 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；25 mM Tris-HCl pH8.5, 14-16 % PEG 8K, 20 % w/v
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.255 |
| 7PU5 Structure of SFPQ-NONO complex 提交 2021-09-28 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
277–535（259 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；25 mM Tris-HCl pH8.5, 14-16 % PEG 8K, 20 % w/v
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.255 |
| 7SP0 Crystal structure of human SFPQ L534I mutant in complex with zinc 提交 2021-11-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
276–535（260 aa）
链 B
276–535（260 aa）
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突变：L534I 突变：L534I | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12% PEG4000, 0.2 M CALCIUM CHLORIDE, 0.1 M MES, PH 6.0
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.216 |
| 7UJ1 Crystal structure of PSF-RNA complex 提交 2022-03-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
214–598（385 aa）
链 B
214–598（385 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1M Tris-HCl, pH 8.5, 5mM MgCl2, 1mM DTT, 26% SOKALAN CP 42.
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.241 |
| 7UK1 Complex Structure of Human Polypyrimidine Splicing Factor (PSF/SFPQ) with Murine Virus-like 30S Transcript-1 (VS30-1) Reveals Cooperative Binding of RNA 提交 2022-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
214–598（385 aa）
链 B
214–598（385 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；285.15 K；0.1 M MgCl2, 0.1 M HEPES pH 7.0, 15% (w/v),PEG4000, or 15% (w/v) PEG3500, or 20% PEG2000MME
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分辨率 2.70 Å R-free 0.291 |