当前蛋白身份:P24385 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2W96 Crystal Structure of CDK4 in complex with a D-type cyclin 提交 2009-01-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–271(271 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å R-free 0.259
2W99 Crystal Structure of CDK4 in complex with a D-type cyclin 提交 2009-01-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–271(271 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.270
2W9F Crystal Structure of CDK4 in complex with a D-type cyclin 提交 2009-01-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–271(271 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.85 Å R-free 0.300
2W9Z Crystal Structure of CDK4 in complex with a D-type cyclin 提交 2009-01-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 16–271(256 aa) 片段:RESIDUES 16-271
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.45 Å R-free 0.272
6P8E Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P27 提交 2019-06-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 19–267(249 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;295 K;100mM Tris (7.0) 200mM MgCl2 25%PEG 8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.222
6P8F Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P27 提交 2019-06-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 19–267(249 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;100mM Tris (7.0) 17% PEG 3350 100 mM CaCl2 10 mM MgCl2
分辨率 2.89 Å R-free 0.242
6P8G Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P27 提交 2019-06-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 19–267(249 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;295 K;100mM Tris (7.0) 200mM MgCl2 10% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.275
6P8H Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P21 提交 2019-06-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 19–267(249 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 7;295 K;100mM Tris (7.0), 10% PEG 8000 200mM MgCl2
分辨率 3.19 Å R-free 0.258
9CSK Crystal structure of CDK4 cyclin D1 in complex with atirmociclib 提交 2024-07-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 16–271(256 aa)
未记录 A1AZ4 Atirmociclib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294.15 K;Salt: 0.1 M DL-Malic acid Polymer: 12.4642857143 %w/v PEG 3350 Buffer: 0.1 M HEPES (pH 6.91) Additive: 10mM DTT [protein] 6mg/ml
分辨率 2.25 Å R-free 0.270
9CSK Crystal structure of CDK4 cyclin D1 in complex with atirmociclib 提交 2024-07-24 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 16–271(256 aa)
未记录 A1AZ4 Atirmociclib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;294.15 K;Salt: 0.1 M DL-Malic acid Polymer: 12.4642857143 %w/v PEG 3350 Buffer: 0.1 M HEPES (pH 6.91) Additive: 10mM DTT [protein] 6mg/ml
分辨率 2.25 Å R-free 0.270
9IVD Cryo-EM structure of CyclinD1 bound AMBRA1-DDB1 提交 2024-07-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 E 1–295(295 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å