当前蛋白身份:P24931
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B71 RUBRERYTHRIN 提交 1999-01-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;pH 8
|
分辨率 1.90 Å |
| 1B71 RUBRERYTHRIN 提交 1999-01-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 8 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;pH 8
|
分辨率 1.90 Å |
| 1DVB RUBRERYTHRIN 提交 2000-01-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;277 K;PEG4000, Tris acid maleate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.255 |
| 1DVB RUBRERYTHRIN 提交 2000-01-20 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 8 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;277 K;PEG4000, Tris acid maleate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.255 |
| 1JYB Crystal structure of Rubrerythrin 提交 2001-09-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;298 K;PEG1500, Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.231 |
| 1JYB Crystal structure of Rubrerythrin 提交 2001-09-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 8 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;298 K;PEG1500, Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.231 |
| 1LKM Crystal structure of Desulfovibrio vulgaris rubrerythrin all-iron(III) form 提交 2002-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;PEG 1450, Tris, Glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.210 |
| 1LKM Crystal structure of Desulfovibrio vulgaris rubrerythrin all-iron(III) form 提交 2002-04-25 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;PEG 1450, Tris, Glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.210 |
| 1LKO Crystal structure of Desulfovibrio vulgaris rubrerythrin all-iron(II) form 提交 2002-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;PEG1450, Tris, Sodium Dithionite, NADH, BenC, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.204 |
| 1LKO Crystal structure of Desulfovibrio vulgaris rubrerythrin all-iron(II) form 提交 2002-04-25 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;PEG1450, Tris, Sodium Dithionite, NADH, BenC, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.204 |
| 1LKP Crystal structure of Desulfovibrio vulgaris rubrerythrin all-iron(II) form, azide adduct 提交 2002-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | AZI AZIDE ION × 4 FE2 FE (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;PEG 1450, MOPS, Sodium Azide, Sodium Dithionite, NADH, BenC, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.202 |
| 1LKP Crystal structure of Desulfovibrio vulgaris rubrerythrin all-iron(II) form, azide adduct 提交 2002-04-25 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | AZI AZIDE ION × 8 FE2 FE (II) ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;PEG 1450, MOPS, Sodium Azide, Sodium Dithionite, NADH, BenC, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.202 |
| 1QYB X-ray crystal structure of Desulfovibrio vulgaris rubrerythrin with zinc substituted into the [Fe(SCys)4] site and alternative diiron site structures 提交 2003-09-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 4 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;PEG1450, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.213 |
| 1QYB X-ray crystal structure of Desulfovibrio vulgaris rubrerythrin with zinc substituted into the [Fe(SCys)4] site and alternative diiron site structures 提交 2003-09-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 8 ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;PEG1450, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.213 |
| 1RYT RUBRERYTHRIN 提交 1996-04-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
2–191(190 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.256 |
| 1RYT RUBRERYTHRIN 提交 1996-04-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
2–191(190 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.256 |
| 1S2Z X-ray crystal structure of Desulfovibrio vulgaris Rubrerythrin with displacement of iron by zinc at the diiron Site 提交 2004-01-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;PEG 1450, Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.196 |
| 1S2Z X-ray crystal structure of Desulfovibrio vulgaris Rubrerythrin with displacement of iron by zinc at the diiron Site 提交 2004-01-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 8 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;PEG 1450, Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.196 |
| 1S30 X-ray crystal structure of Desulfovibrio vulgaris Rubrerythrin with displacement of iron by zinc at the diiron Site 提交 2004-01-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;PEG 1450, Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.208 |
| 1S30 X-ray crystal structure of Desulfovibrio vulgaris Rubrerythrin with displacement of iron by zinc at the diiron Site 提交 2004-01-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–191(191 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 8 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;298 K;PEG 1450, Tris, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.208 |