当前蛋白身份：P25105
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5ZKP Crystal structure of the human platelet-activating factor receptor in complex with SR 27417 提交 2018-03-25 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–216（215 aa）
链 A
224–316（93 aa）
|
突变：F116Y, N169D,P2A, Y98W,A230D, V234A, D289N 突变：F116Y, N169D,P2A, Y98W,A230D, V234A, D289N | 9ER N1,N1-dimethyl-N2-[(pyridin-3-yl)methyl]-N2-{4-[2,4,6-tri(propan-2-yl)phenyl]-1,3-thiazol-2-yl}ethane-1,2-diamine × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；HEPES, PEG 400, NaSCN, Na citrate
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.259 |
| 5ZKQ Crystal structure of the human platelet-activating factor receptor in complex with ABT-491 提交 2018-03-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–218（217 aa）
链 A
224–316（93 aa）
链 B
2–218（217 aa）
链 B
224–316（93 aa）
|
突变：F116Y, N169D, A230D,C97A, I137R, A230D, V234A, D289N 突变：F116Y, N169D, A230D,C97A, I137R, A230D, V234A, D289N 突变：F116Y, N169D, A230D,C97A, I137R, A230D, V234A, D289N 突变：F116Y, N169D, A230D,C97A, I137R, A230D, V234A, D289N | 9EU 4-ethynyl-3-{3-fluoro-4-[(2-methyl-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-1-yl)methyl]benzene-1-carbonyl}-N,N-dimethyl-1H-indole-1-carboxamide × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；HEPES, PEG 400, MgSO4
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.235 |
| 8XYD Structure of Platelet-activating factor receptor-G protein complex bound to platelet-activating factor 提交 2024-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–342（342 aa）
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未记录 | PFS (2R)-2-(acetyloxy)-3-(hexadecyloxy)propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |