当前蛋白身份：P25116
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1NRN CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURES OF THROMBIN COMPLEXED WITH THROMBIN RECEPTOR PEPTIDES: EXISTENCE OF EXPECTED AND NOVEL BINDING MODES 提交 1994-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
38–60（23 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.10 Å |
| 1NRO CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURES OF THROMBIN COMPLEXED WITH THROMBIN RECEPTOR PEPTIDES: EXISTENCE OF EXPECTED AND NOVEL BINDING MODES 提交 1994-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
38–64（27 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.10 Å |
| 1NRP CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURES OF THROMBIN COMPLEXED WITH THROMBIN RECEPTOR PEPTIDES: EXISTENCE OF EXPECTED AND NOVEL BINDING MODES 提交 1994-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
38–60（23 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 1NRQ CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURES OF THROMBIN COMPLEXED WITH THROMBIN RECEPTOR PEPTIDES: EXISTENCE OF EXPECTED AND NOVEL BINDING MODES 提交 1994-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
40–60（21 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.50 Å |
| 1NRR Crystallographic structures of Thrombin complexed with Thrombin receptor peptides: Existence of expected and novel binding modes 提交 1994-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
43–60（18 aa）
片段：UNP residues 43-60
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未记录 | 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å |
| 3BEF Crystal structure of thrombin bound to the extracellular fragment of PAR1 提交 2007-11-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
49–57（9 aa）
片段：UNP residues 49-57
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；285 K；100mM MES, 30% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.248 |
| 3BEF Crystal structure of thrombin bound to the extracellular fragment of PAR1 提交 2007-11-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
49–57（9 aa）
片段：UNP residues 49-57
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；285 K；100mM MES, 30% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.248 |
| 3HKI Crystal structure of murine thrombin mutant W215A/E217A in complex with the extracellular fragment of human PAR1 提交 2009-05-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
42–62（21 aa）
片段：Extracellular fragment: UNP residues 42-62
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；100mM Tris-HCl pH 8.5, 20% PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.261 |
| 3HKI Crystal structure of murine thrombin mutant W215A/E217A in complex with the extracellular fragment of human PAR1 提交 2009-05-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
42–62（21 aa）
片段：Extracellular fragment: UNP residues 42-62
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；100mM Tris-HCl pH 8.5, 20% PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.261 |
| 3HKJ Crystal structure of human thrombin mutant W215A/E217A in complex with the extracellular fragment of human PAR1 提交 2009-05-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
42–62（21 aa）
片段：Extracellular fragment: UNP residues 42-62
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；100mM HEPES pH 7.5, 20% PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 3HKJ Crystal structure of human thrombin mutant W215A/E217A in complex with the extracellular fragment of human PAR1 提交 2009-05-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
42–62（21 aa）
片段：Extracellular fragment: UNP residues 42-62
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；100mM HEPES pH 7.5, 20% PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.234 |
| 3LU9 Crystal structure of human thrombin mutant S195A in complex with the extracellular fragment of human PAR1 提交 2010-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
33–57（25 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；200mM K/Na tartrate, 20% PEG3350, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 3LU9 Crystal structure of human thrombin mutant S195A in complex with the extracellular fragment of human PAR1 提交 2010-02-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
33–57（25 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；200mM K/Na tartrate, 20% PEG3350, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.236 |
| 3VW7 Crystal structure of human protease-activated receptor 1 (PAR1) bound with antagonist vorapaxar at 2.2 angstrom 提交 2012-08-07 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
86–301（216 aa）
链 A
303–395（93 aa）
|
突变：N250G, N259S, D1020N, C1054T, C1097A 突变：N250G, N259S, D1020N, C1054T, C1097A | VPX ethyl [(1R,3aR,4aR,6R,8aR,9S,9aS)-9-{(E)-2-[5-(3-fluorophenyl)pyridin-2-yl]ethenyl}-1-methyl-3-oxododecahydronaphtho[2,3-c]fur an-6-yl]carbamate × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 9 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
293 K；0.1-0.2M sodium chloride, 100mM sodium phosphate pH 6.0-6.5, 25%-35% PEG 300, Lipidic cubic phase (in meso phase), temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.235 |
| 8XOR Cryo-EM structure of the tethered agonist-bound human PAR1-Gq complex 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
42–397（356 aa）
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未记录 | CLR CHOLESTEROL × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.00 Å |
| 8XOS Cryo-EM structure of the tethered agonist-bound human PAR1-Gi complex 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
42–397（356 aa）
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未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 9D4Z CryoEM structure of PAR1 with endogenous tethered ligand 提交 2024-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 R
42–425（384 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.74 Å |