当前蛋白身份:P25651 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3N4R Structure of Csm1 C-terminal domain, R3 form 提交 2010-05-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 69–181(113 aa) 片段:C-terminal domain (residues 69-181)
链 B 69–181(113 aa) 片段:C-terminal domain (residues 69-181)
突变:L157M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:L157M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 MLI MALONATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.4;293 K;2.0 M Sodium malonate pH 6.4, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.243
3N4R Structure of Csm1 C-terminal domain, R3 form 提交 2010-05-22 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 69–181(113 aa) 片段:C-terminal domain (residues 69-181)
链 D 69–181(113 aa) 片段:C-terminal domain (residues 69-181)
突变:L157M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:L157M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.4;293 K;2.0 M Sodium malonate pH 6.4, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.243
3N4S Structure of Csm1 C-terminal domain, P21212 form 提交 2010-05-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 69–181(113 aa) 片段:C-terminal domain (residues 69-181)
链 B 69–181(113 aa) 片段:C-terminal domain (residues 69-181)
未记录 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.0 M Sodium malonate pH 6.4, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.35 Å R-free 0.234
3N4S Structure of Csm1 C-terminal domain, P21212 form 提交 2010-05-22 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 69–181(113 aa) 片段:C-terminal domain (residues 69-181)
链 D 69–181(113 aa) 片段:C-terminal domain (residues 69-181)
未记录 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;293 K;2.0 M Sodium malonate pH 6.4, 2% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.35 Å R-free 0.234
3N4X Structure of Csm1 full-length 提交 2010-05-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–190(190 aa)
链 B 1–190(190 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;150 mM lithium chloride, 12% PEG 2000, 4% 1,4-butanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.41 Å R-free 0.282
3N4X Structure of Csm1 full-length 提交 2010-05-23 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–190(190 aa)
链 D 1–190(190 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;150 mM lithium chloride, 12% PEG 2000, 4% 1,4-butanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.41 Å R-free 0.282
3N7N Structure of Csm1/Lrs4 complex 提交 2010-05-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–190(190 aa)
链 B 1–190(190 aa)
链 C 1–190(190 aa)
链 D 1–190(190 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 120 mM MgCl2, 16% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.90 Å R-free 0.355
5KTB Structure of a complex between S. cerevisiae Csm1 and Mam1 提交 2016-07-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–190(190 aa)
链 B 1–190(190 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;100 mM HEPES, pH 7.5, 100 mM magnesium chloride, 6% PEG4000
分辨率 3.05 Å R-free 0.241
5V1A Structure of S. cerevisiae Ulp2:Csm1 complex 提交 2017-03-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 69–190(122 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;100 mM M HEPES pH 7.5 and 20% PEG 3350, 25% Glycerol
分辨率 2.14 Å R-free 0.278
5V3N Structure of S. cerevisiae Ulp2-Tof2-Csm1 complex 提交 2017-03-07 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 69–181(113 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M HEPES pH 7.5 and 25% PEG 3350 and 25% Glycerol
分辨率 1.30 Å R-free 0.217
6DEI Structure of Dse3-Csm1 complex 提交 2018-05-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 69–181(113 aa)
链 B 69–181(113 aa)
未记录 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1M NaOAc, 0.1M HEPES pH 7.5, 22% PEG 4000
分辨率 1.70 Å R-free 0.221