当前蛋白身份：P26368
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JMT X-ray Structure of a Core U2AF65/U2AF35 Heterodimer 提交 2001-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
85–112（28 aa）
|
未记录 | HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；277 K；PEG mme5000, sodium acetate, 1,6-hexanediol, MES, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.238 |
| 1O0P Solution Structure of the third RNA Recognition Motif (RRM) of U2AF65 in complex with an N-terminal SF1 peptide 提交 2003-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
372–475（104 aa）
片段：C-terminal RRM domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4；295 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM salt；压力 ambient
NMR样品组成
1mM 15N,13C U2AF65-RRM3 + 1mM unlabeled SF1_10-25, 30mM phosphate buffer, 20mM NaCL, 3mM DTT | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1mM 15N,13C U2AF65-RRM3 + 1mM unlabeled SF1_10-25, 30mM phosphate buffer, 20mM NaCL, 3mM DTT | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1OPI SOLUTION STRUCTURE OF THE THIRD RNA RECOGNITION MOTIF (RRM) OF U2AF65 IN COMPLEX WITH AN N-TERMINAL SF1 PEPTIDE 提交 2003-03-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
372–475（104 aa）
片段：C-TERMINAL RRM DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4；295 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM SALT；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1MM 15N,13C U2AF65-RRM3 + 1MM UNLABELED SF1_10-25, 30MM PHOSPHATE BUFFER, 20MM NACL, 3MM DTT | D2O
|
分辨率未提供 |
| 1U2F SOLUTION STRUCTURE OF THE FIRST RNA-BINDING DOMAIN OF HU2AF65 提交 1999-05-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
148–237（90 aa）
片段：FIRST RNA-BINDING DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.5；298 K
|
分辨率未提供 |
| 2G4B Structure of U2AF65 variant with polyuridine tract 提交 2006-02-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–237（90 aa）
片段：RNA binding domain
链 A
258–336（79 aa）
片段：RNA binding domain
|
突变：deletion of residues 238-258 突变：deletion of residues 238-258 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；.6 M ammonium sulfate, 100 mM 2-(N-morpholino) ethanesulfonic acid, sodium salt (MES) pH 6.5, 10% dioxane, 200 mM non-detergent sulfobetaine (NDSB) 195 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.276 |
| 2HZC Crystal structure of the N-terminal RRM of the U2AF large subunit 提交 2006-08-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
148–229（82 aa）
片段：RRM 1
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；21% PEGmme550, 200mM Zn acetate, 0.1M MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.226 |
| 2HZC Crystal structure of the N-terminal RRM of the U2AF large subunit 提交 2006-08-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
148–229（82 aa）
片段：RRM 1
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；21% PEGmme550, 200mM Zn acetate, 0.1M MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.226 |
| 2M0G Structure, phosphorylation and U2AF65 binding of the Nterminal Domain of splicing factor 1 during 3 splice site Recognition 提交 2012-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
372–475（104 aa）
片段：RRM 3 domain residues 372-475
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 ambient
NMR样品组成
100-600 uM [U-15N] protein, 100-600 uM [U-13C; U-15N] entity, 100-600 uM [U-13C; U-15N; U-2H] entity, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2U2F SOLUTION STRUCTURE OF THE SECOND RNA-BINDING DOMAIN OF HU2AF65 提交 1999-05-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
258–342（85 aa）
片段：SECOND RNA-BINDING DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K
|
分辨率未提供 |
| 2YH0 Solution structure of the closed conformation of human U2AF65 tandem RRM1 and RRM2 domains 提交 2011-04-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
148–342（195 aa）
片段：TANDEM RRM1 AND RRM2 DOMAINS JOINED BY NATIVE LINKER, RESIDUES 148-342
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；295 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 1.0
NMR样品组成
90% WATER/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2YH1 Model of human U2AF65 tandem RRM1 and RRM2 domains with eight-site uridine binding 提交 2011-04-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–342（195 aa）
片段：TANDEM RRM1 AND RRM2 DOMAINS JOINED BY NATIVE LINKER, RESIDUES 148-342
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；295 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 1.0
NMR测量条件
pH 6.5；295 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 1.0
NMR测量条件
pH 6.5；295 K；离子强度（mmCIF原始值）70；压力 1.0
NMR样品组成
90% WATER/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3VAF Structure of U2AF65 variant with BrU3 DNA 提交 2011-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 A
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 4 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 1 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M Ammonium sulfate, 10% Dioxane, 0.1M MES pH 6.5, Deoxy-Big Chap, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.289 |
| 3VAG Structure of U2AF65 variant with BrU3C2 DNA 提交 2011-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 A
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 6 SO4 SULFATE ION × 7 GOL GLYCEROL × 2 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M Ammonium sulfate, 10% Dioxane, 0.1M MES pH 6.5, Deoxy-Big Chap, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.232 |
| 3VAH Structure of U2AF65 variant with BrU3C4 DNA 提交 2011-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 A
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 4 SO4 SULFATE ION × 5 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M Ammonium sulfate, 10% Dioxane, 0.1M MES pH 6.5, Deoxy-Big Chap, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.259 |
| 3VAI Structure of U2AF65 variant with BrU3C5 DNA 提交 2011-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 A
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 5 SO4 SULFATE ION × 7 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M M Ammonium sulfate, 10% Dioxane, 0.1M MES pH 6.5, Deoxy-Big Chap, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 3VAJ Structure of U2AF65 variant with BrU5C6 DNA 提交 2011-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 A
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 5 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M Ammonium sulfate, 10% Dioxane, 0.1M MES pH 6.5, Deoxy-Big Chap, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.236 |
| 3VAK Structure of U2AF65 variant with BrU5 DNA 提交 2011-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 A
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 5 SO4 SULFATE ION × 7 GOL GLYCEROL × 4 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M Ammonium sulfate, 10% Dioxane, 0.1M MES pH 6.5, Deoxy-Big Chap, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.229 |
| 3VAL Structure of U2AF65 variant with BrU5C1 DNA 提交 2011-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 A
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 D
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 D
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 I
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 I
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 4 SO4 SULFATE ION × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M Ammonium sulfate, 10% Dioxane, 0.1M MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.271 |
| 3VAM Structure of U2AF65 variant with BrU5C2 DNA 提交 2011-12-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 A
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
148–237（90 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
链 B
258–336（79 aa）
片段：RNA Binding Domains 1 and 2
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 5 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M Ammonium sulfate, 10% Dioxane, 0.1M MES pH 6.5, Deoxy-Big Chap, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.237 |
| 4FXW Structure of phosphorylated SF1 complex with U2AF65-UHM domain 提交 2012-07-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
375–475（101 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2 M Lithium sulfate, 20% PEG 3350 and 0.1 M Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.281 |
| 4FXW Structure of phosphorylated SF1 complex with U2AF65-UHM domain 提交 2012-07-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
375–475（101 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2 M Lithium sulfate, 20% PEG 3350 and 0.1 M Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.281 |
| 4TU7 Structure of U2AF65 D231V variant with BrU5 DNA 提交 2014-06-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–336（189 aa）
链 B
148–336（189 aa）
|
突变：D231V 突变：D231V | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 4 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 4 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1.6M AMMONIUM SULFATE, 10% DIOXANE, 0.1M MES PH 6.0, DEOXY-BIG CHAP
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.223 |
| 4TU8 STRUCTURE OF U2AF65 VARIANT WITH BRU5A6 DNA 提交 2014-06-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–336（189 aa）
片段：UNP residues 148-336
链 B
148–336（189 aa）
片段：UNP residues 148-336
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 7 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 SO4 SULFATE ION × 3 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M AMMONIUM SULFATE, 10% DIOXANE, 0.1M MES PH 6.5, ETHYLENE GLYCOL, DEOXY-BIG CHAP
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.218 |
| 4TU9 STRUCTURE OF U2AF65 VARIANT WITH BRU5G6 DNA 提交 2014-06-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
148–336（189 aa）
片段：UNP residues 148-336
链 B
148–336（189 aa）
片段：UNP residues 148-336
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 5 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6M AMMONIUM SULFATE, 10% DIOXANE, 0.1M MES PH 6.5, DEOXY-BIG CHAP
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.234 |
| 5EV1 Structure I of Intact U2AF65 Recognizing a 3' Splice Site Signal 提交 2015-11-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
片段：UNP residues 141-341
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM phosphate-citrate buffer, 40% Peg400, 10% dioxane
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.228 |
| 5EV2 Structure II of Intact U2AF65 Recognizing the 3' Splice Site Signal 提交 2015-11-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
片段：UNP residues 141-341
|
未记录 | DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；200 mM LiCl, 100 mM sodium citrate, 8% PEG 6000, 10% PEG 300, 10% Dioxane, Deoxy-BigCHAP
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.188 |
| 5EV3 Structure III of Intact U2AF65 Recognizing the 3' Splice Site Signal 提交 2015-11-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
片段：UNP residues 141-341
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1M Succinic Acid, 0.1M, 1% PEG MME 2000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.186 |
| 5EV4 Structure IV of Intact U2AF65 Recognizing the 3' Splice Site Signal 提交 2015-11-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
片段：UNP RESIDUES 141-341
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1M Succinic Acid, 0.1M HEPES, 3% PEG MME 2000
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.176 |
| 5W0G Structure of U2AF65 (U2AF2) RRM1 at 1.07 resolution 提交 2017-05-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
148–229（82 aa）
片段：RNA RECOGNITION motif 1 (RRM1), residues 148-229
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 1PG 2-(2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；21% (w/v) PEG MME 550, 210 mM zinc acetate, 100 mM MES
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.153 |
| 5W0H Structure of U2AF65 (U2AF2) RRM2 at 1.11 Angstrom Resolution 提交 2017-05-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
258–336（79 aa）
片段：RNA Recognition Motif 2 (RRM2), residues 258-336
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；26% (w/v) PEG 8000, 0.1 M NaOAc, 0.2 mM TCEP, 10% (v/v) dioxane, 0.2 ul BigCHAP, 0.05 M potassium phosphate monobasic
|
分辨率 1.11 Å R-free 0.168 |
| 6TR0 Solution structure of U2AF2 RRM1,2 提交 2019-12-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
140–342（203 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] U2AF2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 6XLV Crystal structure of leukemia-associated N196K mutant of U2AF65 bound to AdML splice site 提交 2020-06-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
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突变：N196K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG 3350, 3.4 M sodium malonate pH 7, sucrose, LDAO
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.169 |
| 6XLW Crystal structure of U2AF65 bound to AdML splice site sequence 提交 2020-06-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；1M Succinic Acid, 0.1M HEPES pH 7, 3% PEG MME 2000
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分辨率 1.50 Å R-free 0.153 |
| 6XLX Crystal structure of cancer-associated G301D mutant of U2AF65 bound to AdML splice site 提交 2020-06-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
|
突变：G301D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；25% PEG 3350, 0.24 M Na malonate pH 7, 5% sucrose, Lauryldimethylamine oxide
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分辨率 1.70 Å R-free 0.194 |
| 7S3A Crystal structure of intact U2AF65 RRM-region bound to AdML-C5 oligonucleotide 提交 2021-09-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
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未记录 | NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；0.60 M succinic acid, 0.10 M Hepes pH 7.0, 2% Peg MME 2000
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.157 |
| 7S3B Crystal structure of intact U2AF65 RRM-region bound to AdML-G5 oligonucleotide 提交 2021-09-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
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未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.24 M Na Malonate, 26% Peg 3350, n-dodecyl-N,N-dimethylamine-N-oxide (=LDAO)
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分辨率 1.89 Å R-free 0.200 |
| 7S3C Crystal structure of intact U2AF65 RRM-region bound to AdML-A5 oligonucleotide 提交 2021-09-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；0.24 M malonate, 26% Peg 3350, 10% sucrose, LDAO
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分辨率 1.51 Å R-free 0.190 |
| 7SN6 U2AF65 UHM BOUND TO SF3B155 ULM5 提交 2021-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
375–475（101 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M SODIUM CITRATE TRIBASIC DIHYDRATE PH 5.6, 15% V/V 2-PROPANOL, 20% PEG 4000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 7SN6 U2AF65 UHM BOUND TO SF3B155 ULM5 提交 2021-10-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
375–475（101 aa）
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未记录 | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M SODIUM CITRATE TRIBASIC DIHYDRATE PH 5.6, 15% V/V 2-PROPANOL, 20% PEG 4000
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分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 8P25 Solution structure of a chimeric U2AF2 RRM2 / FUBP1 N-Box 提交 2023-05-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
231–342（112 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM NaCl；压力 1
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Chimeric construct of U2AF2 linker-RRM2 and FUBP1 N-box, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Chimeric construct of U2AF2 linker-RRM2 and FUBP1 N-box, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 9C7A Crystal structure of R149W neurodevelopmental disease-associated U2AF2 variant 提交 2024-06-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
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突变：R149W | GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；24 M sodium malonate pH 7.0, 5% w/v sucrose, 25% w/v PEG 3350, with addition of 0.1 uL of 5% w/v LDAO detergent
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分辨率 1.40 Å R-free 0.159 |
| 9C7B Crystal structure of R150H neurodevelopmental disease-associated U2AF2 variant 提交 2024-06-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
141–341（201 aa）
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突变：R150H | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；24 M sodium malonate pH 7.0, 5% w/v sucrose, 25% w/v PEG 3350, with addition of 0.1 uL of 5% w/v LDAO detergent
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分辨率 1.40 Å R-free 0.167 |
| 9DWU CoREST complex bound to U2AF2 提交 2024-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
257–336（80 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 5.14 Å |