当前蛋白身份:P27838 重新检索
本组结构的主要差异维度
配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1EW4 CRYSTAL STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI CYAY PROTEIN REVEALS A NOVEL FOLD FOR THE FRATAXIN FAMILY 提交 2000-04-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–106(106 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.12;296 K;0.1 M sodium acetate, 34% PEG 4000, pH 5.12, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.40 Å R-free 0.213
1SOY Solution structure of the bacterial frataxin orthologue, CyaY 提交 2004-03-16 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–106(106 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150mM KCl;压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM CyaY U-15N,13C, 50mM Phosphate buffer, 150mM KCl, 1mM DTT, 0.05%NaN3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5mM CyaY 15N, 50mM Phosphate buffer, 150mM KCl, 1mM DTT, 0.05%NaN3 | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2EFF Crystal structure analysis of the complex between CyaY and Co(II) 提交 2007-02-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–106(106 aa)
未记录 CO COBALT (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.7;293 K;30% w/v PEG 4000, 200mM CoCl2, 2mM beta-mercaptoethanol, 100 mM sodium acetate, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
2P1X Crystal structure analysis of the complex between CyaY and Eu(III) 提交 2007-03-06 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–106(106 aa)
未记录 EU3 EUROPIUM (III) ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;Crystallization conditions: protein concentration 15mg/ml, 0.1M sodium acetate, 0.2M CaCl2, 30% PEG 4000, 2mM beta mercaptoethanol Soaking conditions: EuCl3 in the stabilizing solution, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.42 Å R-free 0.222