当前蛋白身份:P27870 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1F5X NMR STRUCTURE OF THE Y174 AUTOINHIBITED DBL HOMOLOGY DOMAIN 提交 2000-06-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 168–375(208 aa) 片段:DBL HOMOLOGY DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)70 mM;压力 ambient
NMR样品组成 1.4 mM 15N,13C,2H; 20 mM phosphate buffer; 50 mM NaCl; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1GCP CRYSTAL STRUCTURE OF VAV SH3 DOMAIN 提交 2000-08-08 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 595–660(66 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;277.2 K;PEG4000, tris(hydroxymethyl)aminomethane, isopropanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.2K
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
1GCP CRYSTAL STRUCTURE OF VAV SH3 DOMAIN 提交 2000-08-08 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 595–660(66 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;277.2 K;PEG4000, tris(hydroxymethyl)aminomethane, isopropanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.2K
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
1GCP CRYSTAL STRUCTURE OF VAV SH3 DOMAIN 提交 2000-08-08 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 595–660(66 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;277.2 K;PEG4000, tris(hydroxymethyl)aminomethane, isopropanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.2K
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
1GCP CRYSTAL STRUCTURE OF VAV SH3 DOMAIN 提交 2000-08-08 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 595–660(66 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;277.2 K;PEG4000, tris(hydroxymethyl)aminomethane, isopropanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.2K
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
1GCQ CRYSTAL STRUCTURE OF VAV AND GRB2 SH3 DOMAINS 提交 2000-08-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 595–660(66 aa) 片段:N-TERMINAL SH3 DOMAIN
未记录 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293.2 K;2-methyl-2,4-pentanediol, imidazole, magnesium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.2K
分辨率 1.68 Å R-free 0.235
1K1Z Solution structure of N-terminal SH3 domain mutant(P33G) of murine Vav 提交 2001-09-26 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 583–660(78 aa) 片段:N-terminal SH3 domain
突变:P33G 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;压力 1
NMR样品组成 1.5mM protein U-15N,13C; 10mM phosphate buffer K; 10mM DTT-d | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KBT Attachment of an NMR-invisible solubility enhancement tag (INSET) using a sortase-mediated protein ligation method 提交 2008-12-07 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 784–844(61 aa) 片段:SH3 2 domain of Proto-oncogene vav,UNP residues 228-282 of Immunoglobulin G-binding protein G
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 ambient
NMR样品组成 20 mM MES-1, 2 mM DTT-2, 150 mM NaCl-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2VRW Critical structural role for the PH and C1 domains of the Vav1 exchange factor 提交 2008-04-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 170–575(406 aa) 片段:RESIDUES 170-575
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;100MM BICINE PH9.0 10% PEG 6000
分辨率 1.85 Å R-free 0.251