当前蛋白身份：P27918
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1W0R Solution structure of dimeric form of properdin by X-ray solution scattering and analytical ultracentrifugation 提交 2004-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–469（442 aa）
片段：RESIDUES 28-469
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION SCATTERING | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1W0R Solution structure of dimeric form of properdin by X-ray solution scattering and analytical ultracentrifugation 提交 2004-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
28–469（442 aa）
片段：RESIDUES 28-469
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION SCATTERING | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1W0S Solution structure of trimeric form of properdin by X-ray solution scattering and analytical ultracentrifugation 提交 2004-06-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–469（442 aa）
片段：RESIDUES 28-469
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION SCATTERING | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1W0S Solution structure of trimeric form of properdin by X-ray solution scattering and analytical ultracentrifugation 提交 2004-06-09 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
28–469（442 aa）
片段：RESIDUES 28-469
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION SCATTERING | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1W0S Solution structure of trimeric form of properdin by X-ray solution scattering and analytical ultracentrifugation 提交 2004-06-09 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
28–469（442 aa）
片段：RESIDUES 28-469
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION SCATTERING | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 6RUR Structure of the SCIN stabilized C3bBb convertase bound to properdin 提交 2019-05-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 U
28–255（228 aa）
链 V
256–469（214 aa）
链 X
28–255（228 aa）
链 Y
256–469（214 aa）
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突变：TSR2 and TSR3 are not modelled 突变：TSR2 and TSR3 are not modelled | MAN alpha-D-mannopyranose × 18 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM MgAcetate 50 mM Mes 6.5 5 % w/v PEG 10K
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分辨率 6.00 Å R-free 0.272 |
| 6RUS Structure of a functional properdin monomer 提交 2019-05-29 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–255（228 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 8 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；1.1 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 6.0, 1.2%(w/v) myo-inositol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.274 |
| 6RUS Structure of a functional properdin monomer 提交 2019-05-29 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
256–469（214 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；1.1 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 6.0, 1.2%(w/v) myo-inositol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.274 |
| 6RUV Structure of the SCIN stabilized C3bBb convertase bound to Properdin and a the non-inhibitory nanobody hFPNb1 提交 2019-05-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 U
28–191（164 aa）
链 V
256–469（214 aa）
链 X
28–191（164 aa）
链 Y
256–469（214 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 21 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；277 K；100 mM NaCl, 5 % (w/v) PEG4000, 10 mM MgCl2, 100 mM Sodium Cacodylate trihydrate pH 5.8.
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分辨率 6.15 Å R-free 0.271 |
| 6RV6 Structure of properdin lacking TSR3 based on anomalous data 提交 2019-05-31 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–191（164 aa）
链 B
256–469（214 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；292 K；1.0 M lithium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4.0,
0.1 M barium chloride
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分辨率 3.51 Å R-free 0.283 |
| 6S08 Crystal Structure of Properdin (TSR domains N1 & 456) 提交 2019-06-14 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
256–469（214 aa）
链 B
26–132（107 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 8 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 NA SODIUM ION × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Potassium Sulphate, PEG 3350
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分辨率 2.03 Å R-free 0.248 |
| 6S0A Crystal Structure of Properdin (TSR domains N12 & 456) 提交 2019-06-14 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
256–469（214 aa）
链 B
26–191（166 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 10 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；Sodium Citrate, PEG 3000
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分辨率 2.52 Å R-free 0.267 |
| 6S0B Crystal Structure of Properdin in complex with the CTC domain of C3/C3b 提交 2019-06-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
256–469（214 aa）
链 B
26–132（107 aa）
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 8 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；Tacsimate, PEG 3350
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.277 |
| 6SEJ Structure of a functional monomeric properdin lacking TSR3 提交 2019-07-30 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–191（164 aa）
链 B
256–469（214 aa）
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；292 K；1.0 M lithium sulfate, 0.1 M sodium acetate pH 4.0, 0.1 M barium chloride
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.266 |
| 7B26 CirpA1 in complex with pseudo-monomeric Properdin lacking TSR2-3 提交 2020-11-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–134（134 aa）
链 B
256–469（214 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M Potassium thiocyanate, 0.1 M Tris, pH 7.5, 18 % w/v PEG 5000 MME
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.274 |
| 7NOZ Structure of the nanobody stablized properdin bound alternative pathway proconvertase C3b:FB:FP 提交 2021-02-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
28–190（163 aa）
链 D
255–461（207 aa）
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未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Na-acetate pH 5.3, 0.1 M Mg-formate,7% PEG5000 MME
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.265 |
| 8Q6R Structure of complement FP in complex with the TPP-3077 VHH 提交 2023-08-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
28–135（108 aa）
链 D
256–469（214 aa）
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未记录 | GCH GLYCOCHOLIC ACID × 2 MAN alpha-D-mannopyranose × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；95% Morpheus Screen III, condition G1
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.238 |
| 8Q6R Structure of complement FP in complex with the TPP-3077 VHH 提交 2023-08-14 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
28–135（108 aa）
链 F
256–469（214 aa）
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；95% Morpheus Screen III, condition G1
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.238 |
| 9U62 AP pathways C3 convertase C3bBbP and C3 complex 提交 2025-03-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 P
1–453（453 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NI NICKEL (II) ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å |